More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0051 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0051  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
250 aa  488  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0054  transcriptional regulator, TetR family  99.6 
 
 
250 aa  485  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0162  transcription regulator protein  71.12 
 
 
233 aa  301  9e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  50.46 
 
 
245 aa  193  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  46.79 
 
 
230 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1778  TetR family transcriptional regulator  44.09 
 
 
250 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  44.09 
 
 
261 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  41.81 
 
 
232 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  40.77 
 
 
244 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1718  TetR family transcriptional regulator  42.34 
 
 
228 aa  158  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.114077  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  42.99 
 
 
244 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
231 aa  153  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4330  TetR family transcriptional regulator  39 
 
 
235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3356  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000224117 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
219 aa  132  7.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 
204 aa  62.8  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 
214 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 
218 aa  61.6  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  22.87 
 
 
225 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 
220 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
211 aa  60.1  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
210 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
210 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
210 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  40.26 
 
 
184 aa  58.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
193 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  28.15 
 
 
222 aa  57.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
193 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
193 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3897  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 
213 aa  56.6  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 
183 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1005  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 
218 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0973  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 
198 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  50 
 
 
201 aa  56.2  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 
219 aa  55.1  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
192 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
188 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  36.9 
 
 
207 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1733  transcriptional regulator, TetR family  33.19 
 
 
213 aa  55.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446931  hitchhiker  0.00691691 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 
242 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 
204 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
222 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5635  transcriptional regulator, TetR family  22.16 
 
 
203 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0445849  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2192  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  38.16 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 
204 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
220 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0384  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 
225 aa  54.7  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
194 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
206 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 
204 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21800  transcriptional regulator  37.66 
 
 
265 aa  53.5  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.391718  normal  0.223847 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
216 aa  53.5  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0176  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 
263 aa  53.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
206 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
240 aa  53.1  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 
207 aa  53.1  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3236  transcriptional regulator, TetR family  28.69 
 
 
194 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0469246  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1070  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 
229 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3194  transcriptional regulator, TetR family  28.69 
 
 
188 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 
200 aa  52.8  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  32.86 
 
 
227 aa  52.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 
194 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  52.94 
 
 
213 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 
211 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  43.1 
 
 
211 aa  52.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 
211 aa  52.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2064  TetR family transcriptional regulator  23.28 
 
 
211 aa  52.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  43.1 
 
 
211 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  43.1 
 
 
211 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  43.1 
 
 
211 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  43.1 
 
 
211 aa  52.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  43.1 
 
 
211 aa  52.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  37.5 
 
 
230 aa  52.4  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 
233 aa  52.4  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 
233 aa  52.4  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 
222 aa  52.4  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
191 aa  52  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  23.48 
 
 
226 aa  52  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  38.18 
 
 
196 aa  52  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2447  TetR family transcriptional regulator  52.94 
 
 
208 aa  52  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  37.38 
 
 
235 aa  52  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.31 
 
 
217 aa  52  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.31 
 
 
217 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 
470 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.31 
 
 
217 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  26 
 
 
214 aa  51.6  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2214  transcriptional regulator, TetR family  25.3 
 
 
219 aa  51.6  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.411668  normal  0.665917 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 
198 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.31 
 
 
217 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal 
 
 
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NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 
229 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.31 
 
 
217 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_012791  Vapar_4830  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 
226 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.31 
 
 
217 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal 
 
 
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NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 
215 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_3665  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
228 aa  52  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 
194 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS4114  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
191 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_0121  regulatory protein, TetR  36.36 
 
 
209 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.602969 
 
 
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NC_007950  Bpro_5551  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 
203 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1306  normal 
 
 
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