15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0009 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0009  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  254  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0007  hypothetical protein  94.26 
 
 		 122 aa  240  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3449  hypothetical protein  95.73 
 
 		 122 aa  202  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3105  hypothetical protein  97.89 
 
 		 121 aa  197  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3583  hypothetical protein  95.79 
 
 		 122 aa  194  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.881264 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3259  hypothetical protein  90.53 
 
 		 122 aa  185  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3635  hypothetical protein  71.26 
 
 		 94 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3310  hypothetical protein  70 
 
 		 94 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4118  hypothetical protein  48.84 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.457314  normal  0.0301059 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4230  hypothetical protein  48.84 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.207721  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3434  hypothetical protein  45.88 
 
 		 86 aa  84  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1231  hypothetical protein  37.21 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3875  hypothetical protein  39.29 
 
 		 92 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.228714 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1294  hypothetical protein  39.02 
 
 		 87 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.218039  normal  0.118522 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3989  hypothetical protein  39.29 
 
 		 92 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>