23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5213 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5213  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  789    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0839  hypothetical protein  73.3 
 
 		 397 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0948  hypothetical protein  73.8 
 
 		 397 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4862  hypothetical protein  62.97 
 
 		 395 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0687822  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0672  hypothetical protein  61.04 
 
 		 396 aa  474  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.745104  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0581  hypothetical protein  59.95 
 
 		 414 aa  473  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1181  hypothetical protein  57.14 
 
 		 394 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0016  hypothetical protein  29.04 
 
 		 354 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.142957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4444  hypothetical protein  27.82 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3249  hypothetical protein  31.79 
 
 		 365 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.106475 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2441  hypothetical protein  29.72 
 
 		 368 aa  103  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1649  conserved hypothetical proteinn  29.43 
 
 		 368 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1590  hypothetical protein  25.32 
 
 		 366 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  0.0229246 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1869  hypothetical protein  24.8 
 
 		 367 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274473  normal  0.277649 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2548  hypothetical protein  27.27 
 
 		 337 aa  85.9  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3536  hypothetical protein  25.36 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0317173 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3559  hypothetical protein  26.73 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2943  hypothetical protein  25.91 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0604603 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2378  hypothetical protein  26.32 
 
 		 336 aa  51.2  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268153 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3224  hypothetical protein  25.51 
 
 		 336 aa  50.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3577  hypothetical protein  23.1 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0395057 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3086  hypothetical protein  23.17 
 
 		 325 aa  44.3  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3870  hypothetical protein  23.21 
 
 		 338 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.13922 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>