More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5211 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_5211  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
319 aa  626  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.313194  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3708  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  99.37 
 
 
319 aa  620  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2510  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  57.93 
 
 
337 aa  341  9e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.775068  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4014  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  57.93 
 
 
337 aa  341  9e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5547  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  57.93 
 
 
337 aa  341  9e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1600  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  56.49 
 
 
312 aa  316  3e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1084  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  56.49 
 
 
312 aa  316  3e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0840793  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2936  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  56.49 
 
 
312 aa  316  3e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2164  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  56.49 
 
 
312 aa  316  3e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0243723 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2924  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  56.49 
 
 
312 aa  316  4e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.690618 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4355  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  56.49 
 
 
312 aa  316  4e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.778833  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3966  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  56.17 
 
 
312 aa  314  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.573271  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1548  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.4 
 
 
309 aa  193  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3686  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.4 
 
 
309 aa  193  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0352  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.07 
 
 
309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.07 
 
 
309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0045  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  38.91 
 
 
318 aa  188  8e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0046  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  38.91 
 
 
318 aa  188  8e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0094  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  38.91 
 
 
318 aa  188  8e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.05206  hitchhiker  0.00363531 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0132  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  38.91 
 
 
318 aa  188  8e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0760311  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0488  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  38.91 
 
 
318 aa  188  8e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0670  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  38.91 
 
 
318 aa  188  8e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.375238 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0723  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  38.91 
 
 
318 aa  188  8e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0120706  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0958  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  38.91 
 
 
318 aa  188  8e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1143  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  38.91 
 
 
318 aa  188  8e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1718  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  38.91 
 
 
318 aa  188  8e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00396754  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2073  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  38.91 
 
 
318 aa  188  8e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000159022  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2810  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  38.91 
 
 
318 aa  188  8e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2975  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  38.91 
 
 
318 aa  188  8e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3429  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  38.91 
 
 
318 aa  188  8e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0043  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.31 
 
 
321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.706965  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1202  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.31 
 
 
321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0645698  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2433  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.31 
 
 
321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.945374 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2238  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.99 
 
 
321 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5809  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.99 
 
 
321 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911931  hitchhiker  0.000316639 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3523  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.99 
 
 
321 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3440  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.99 
 
 
321 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.830328 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4107  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.99 
 
 
321 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190664  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2112  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.11 
 
 
325 aa  183  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.838809 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4857  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.31 
 
 
321 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131589  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4794  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.33 
 
 
315 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1179  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.33 
 
 
315 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1817  transposase IS116/IS110/IS902  38.99 
 
 
321 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2208  transposase IS116/IS110/IS902  38.99 
 
 
321 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146372  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.99 
 
 
321 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.99 
 
 
321 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8696  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.33 
 
 
315 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.331955  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7866  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.33 
 
 
315 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5832  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.33 
 
 
315 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236486  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2742  ISCps7, transposase  36.69 
 
 
317 aa  179  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.102652  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2517  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.11 
 
 
322 aa  178  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0566277  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3420  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.11 
 
 
322 aa  176  6e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.415822  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0519  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.38 
 
 
320 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0858  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.38 
 
 
320 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1056  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.38 
 
 
320 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3543  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.38 
 
 
320 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.909049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3848  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.38 
 
 
320 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206363  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4601  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.38 
 
 
320 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1618  transposase IS111A/IS1328/IS1533  38.89 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.119532  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0271  transposase IS111A/IS1328/IS1533  38.89 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.982036  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1602  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.08 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7776  transposase IS111A/IS1328/IS1533  38.89 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99895  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4047  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.08 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4428  transposase IS111A/IS1328/IS1533  38.89 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0327166  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1833  transposase IS111A/IS1328/IS1533  38.89 
 
 
326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592146  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3615  transposase IS111A/IS1328/IS1533  38.89 
 
 
326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.457809  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5245  transposase IS111A/IS1328/IS1533  38.89 
 
 
326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39153  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2773  transposase IS111A/IS1328/IS1533  38.89 
 
 
326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1663  transposase IS111A/IS1328/IS1533  38.89 
 
 
326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4772  transposase IS111A/IS1328/IS1533  38.89 
 
 
326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286106  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2116  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.08 
 
 
314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0687  transposase IS111A/IS1328/IS1533  38.89 
 
 
326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204727  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3427  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.08 
 
 
314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.934881 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5427  transposase IS111A/IS1328/IS1533  38.89 
 
 
326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0841  transposase IS116/IS110/IS902  38.73 
 
 
326 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.643653 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2154  transposase IS116/IS110/IS902  38.73 
 
 
326 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.110451 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1149  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.54 
 
 
320 aa  168  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.852696  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1423  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.54 
 
 
320 aa  168  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0743274  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1739  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.54 
 
 
320 aa  168  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.106448  normal  0.0290423 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2894  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.54 
 
 
320 aa  168  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.940801  normal  0.95279 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2923  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.54 
 
 
320 aa  168  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.568531  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2982  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.54 
 
 
320 aa  168  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.311525  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0388  transposase IS111A/IS1328/IS1533  34.75 
 
 
318 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3496  transposase IS111A/IS1328/IS1533  34.75 
 
 
318 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.118492 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1134  transposase IS116/IS110/IS902  35.9 
 
 
323 aa  167  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2289  transposase IS111A/IS1328/IS1533  34.75 
 
 
318 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.795414  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2708  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.36 
 
 
315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2664  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.36 
 
 
315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219726  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0133  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.36 
 
 
315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0840  transposase IS116/IS110/IS902  34.31 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553808  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0862  transposase IS116/IS110/IS902  34.31 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.595658  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1845  transposase IS116/IS110/IS902  34.31 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.116231  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1950  transposase IS116/IS110/IS902  34.31 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0873071  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2653  transposase IS116/IS110/IS902  34.31 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.356975  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3756  transposase IS116/IS110/IS902  34.31 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.723193  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0856  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.82 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1261  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  34.41 
 
 
316 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.812718 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1426  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  34.41 
 
 
316 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0372411  normal  0.895779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3883  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  34.41 
 
 
316 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4991  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  34.41 
 
 
316 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>