More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5123 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_5123  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  100 
 
 
361 aa  747    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2692  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  89.2 
 
 
361 aa  679    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.108693  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6398  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  87.78 
 
 
360 aa  672    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.698426  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0950  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  95.01 
 
 
361 aa  721    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2896  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  94.46 
 
 
361 aa  715    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.399813  normal  0.179502 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1053  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  96.68 
 
 
361 aa  732    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.540808  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4048  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  88.64 
 
 
361 aa  680    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.729421  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3752  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  88.64 
 
 
361 aa  680    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1194  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  82.83 
 
 
361 aa  620  1e-176  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0390619 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4019  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  82.67 
 
 
354 aa  616  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4003  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  81.82 
 
 
354 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260153  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3270  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  81.53 
 
 
354 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7283  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  77.22 
 
 
362 aa  593  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0373571  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6004  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  76.94 
 
 
362 aa  590  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.086132  decreased coverage  0.00313463 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0156  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  77.12 
 
 
356 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.191735 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2713  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  76.94 
 
 
359 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2325  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  77.05 
 
 
355 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320028  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2646  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  76.77 
 
 
355 aa  580  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292128  normal  0.550526 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2369  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  76.77 
 
 
355 aa  580  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.545417 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1283  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  76.11 
 
 
359 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2942  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  76.11 
 
 
359 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0765  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  75.93 
 
 
363 aa  561  1.0000000000000001e-159  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.290883  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0871  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  73.94 
 
 
354 aa  555  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0823  fructose-bisphosphate aldolase, class II  75 
 
 
359 aa  556  1e-157  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0450  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  73.06 
 
 
366 aa  554  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310283  normal  0.0618632 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3923  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  75.57 
 
 
359 aa  552  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2904  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  73.65 
 
 
354 aa  551  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0818  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  73.65 
 
 
354 aa  553  1e-156  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.942349  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0596  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  72.8 
 
 
354 aa  550  1e-155  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1698  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  74.79 
 
 
359 aa  548  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.0076037  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6928  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  73.45 
 
 
355 aa  546  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.826361  normal  0.18115 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5315  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  74.36 
 
 
354 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2492  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.57 
 
 
359 aa  485  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.180719 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0166  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.76 
 
 
359 aa  484  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0304491 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2029  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  62.85 
 
 
359 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.394674  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4602  fructose-bisphosphate aldolase  64.76 
 
 
357 aa  481  1e-135  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200924  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0994  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.33 
 
 
359 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal  0.788402 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0967  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.33 
 
 
359 aa  482  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2386  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  65.72 
 
 
354 aa  481  1e-135  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.109398 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0384  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.44 
 
 
354 aa  479  1e-134  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4099  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.9 
 
 
359 aa  479  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109682  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2844  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.74 
 
 
354 aa  478  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0933  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.31 
 
 
355 aa  474  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0875  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.31 
 
 
355 aa  475  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1086  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.87 
 
 
355 aa  477  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000814215  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0776  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.31 
 
 
355 aa  475  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0266968  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3247  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.31 
 
 
355 aa  475  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0347517  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3350  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.31 
 
 
355 aa  475  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000198413  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2889  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.87 
 
 
354 aa  472  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0791  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.87 
 
 
354 aa  474  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.475428  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1815  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.04 
 
 
354 aa  468  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.267172  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0830  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.02 
 
 
355 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.254898  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0163  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.69 
 
 
355 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0408428 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3462  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.02 
 
 
355 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3537  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.02 
 
 
355 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3656  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.02 
 
 
355 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0755  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.46 
 
 
354 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.119495  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3218  fructose-bisphosphate aldolase  62.89 
 
 
354 aa  469  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.338247  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0841  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.75 
 
 
354 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0836  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.75 
 
 
354 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0040  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.75 
 
 
354 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3037  fructose-bisphosphate aldolase, class II  63.46 
 
 
354 aa  467  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0299  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.75 
 
 
354 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0267498  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3596  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.71 
 
 
354 aa  466  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000879946 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0997  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.75 
 
 
354 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2804  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.89 
 
 
354 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2428  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.75 
 
 
354 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1443  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.78 
 
 
357 aa  467  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66755  normal  0.139145 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2793  fructose-bisphosphate aldolase  66.57 
 
 
345 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0665  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.75 
 
 
354 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1530  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.75 
 
 
354 aa  467  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0879  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.89 
 
 
354 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0370  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.17 
 
 
354 aa  468  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0672  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.75 
 
 
354 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal  0.967694 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0594  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.75 
 
 
354 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0650  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.74 
 
 
354 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0196207  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0877  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.46 
 
 
354 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000290228  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08441  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.74 
 
 
357 aa  465  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08421  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.46 
 
 
357 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.201369  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0462  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.17 
 
 
354 aa  462  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5957  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.75 
 
 
354 aa  463  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.67865  normal  0.160231 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0797  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.75 
 
 
357 aa  462  1e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.162751  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0229  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.08 
 
 
363 aa  463  1e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.58536  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0789  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.46 
 
 
357 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2655  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.75 
 
 
354 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2546  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.46 
 
 
354 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0691  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.75 
 
 
354 aa  461  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.858155  normal  0.247033 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1974  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.08 
 
 
363 aa  463  1e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2015  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.75 
 
 
354 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2673  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.46 
 
 
354 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000776519  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2626  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.75 
 
 
354 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0937863  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3275  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.18 
 
 
354 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.604828  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0405  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.89 
 
 
354 aa  458  9.999999999999999e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.841441  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4787  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.04 
 
 
354 aa  457  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.111053 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0480  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.18 
 
 
354 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.669489  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0493  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.18 
 
 
354 aa  457  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09801  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.03 
 
 
357 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.137925  normal  0.129701 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2756  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.89 
 
 
355 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0461  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  60.61 
 
 
354 aa  455  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.671902  normal  0.237356 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3248  fructose-bisphosphate aldolase, class II  63.2 
 
 
356 aa  456  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>