30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5105 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_5105  NifZ family protein  100 
 
 
77 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1069  hypothetical protein  83.12 
 
 
85 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0965  NifZ  80.52 
 
 
85 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201713  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4467  NifZ  70.67 
 
 
76 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3640  NifZ family protein  68.42 
 
 
79 aa  118  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.231555 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0117  NifZ family protein  63.01 
 
 
81 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.788219 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5898  hypothetical protein  67.61 
 
 
82 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00590287  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0402  NifZ family protein  66.22 
 
 
82 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0210  nifZ protein, putative  59.72 
 
 
89 aa  94.4  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000650031  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1252  NifZ family protein  58.57 
 
 
84 aa  89.4  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355595  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1536  NifZ domain protein  58.57 
 
 
83 aa  89.4  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1410  NifZ protein, putative  53.52 
 
 
92 aa  84.7  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1451  hypothetical protein  54.05 
 
 
91 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482298 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1580  NifZ family protein  56.94 
 
 
103 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.854887 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0947  NifZ family protein  40.54 
 
 
82 aa  57.8  0.00000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0285448  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0964  NifZ  38.36 
 
 
99 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338549  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5106  NifZ family protein  36.49 
 
 
99 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1068  NifZ  38.36 
 
 
99 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3957  NifZ  35.06 
 
 
95 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000304465  hitchhiker  0.00212617 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4468  NifZ  35.21 
 
 
101 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4243  NifZ  35.21 
 
 
88 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01680  nitrogen fixation protein NifZ  33.8 
 
 
159 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2128  NifZ family protein  36.49 
 
 
88 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.560071 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3641  NifZ family protein  40.35 
 
 
101 aa  44.3  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1803  NifZ family protein  31.08 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.250711  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6872  NifZ family protein  38.36 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1775  NifZ family protein  31.08 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4479  NifZ  36.99 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.248929  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2368  NifZ family protein  30.3 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1394  NifZ  30.56 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0463497  normal  0.159008 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>