289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5101 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_5101  nitrogenase reductase  100 
 
 
298 aa  607  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4463  nitrogenase reductase  96.42 
 
 
300 aa  557  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1073  nitrogenase reductase  94.98 
 
 
299 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0969  nitrogenase reductase  94.98 
 
 
299 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3534  nitrogenase reductase  93.53 
 
 
299 aa  541  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332377  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3996  nitrogenase reductase  93.88 
 
 
299 aa  541  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6225  nitrogenase reductase  89.27 
 
 
297 aa  540  1e-152  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.572672  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1570  nitrogenase reductase  90.65 
 
 
298 aa  531  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1010  nitrogenase reductase  86.3 
 
 
295 aa  531  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5052  nitrogenase reductase  86.01 
 
 
295 aa  527  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4930  nitrogenase reductase  87.15 
 
 
295 aa  524  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1522  nitrogenase reductase  82.31 
 
 
296 aa  507  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1240  nitrogenase reductase  82.31 
 
 
296 aa  507  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.118183 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1246  nitrogenase reductase  88.57 
 
 
312 aa  505  1e-142  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.944984  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0541  nitrogenase reductase  88.93 
 
 
291 aa  498  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2192  nitrogenase reductase  88.93 
 
 
291 aa  498  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.866269  normal  0.548044 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5925  nitrogenase reductase  80.55 
 
 
295 aa  495  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780912  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0143  nitrogenase reductase  81.1 
 
 
293 aa  494  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5879  nitrogenase reductase  80.55 
 
 
295 aa  495  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0809019  normal  0.897591 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0473  nitrogenase reductase  82.23 
 
 
290 aa  495  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.686958  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1430  nitrogenase reductase  83.21 
 
 
293 aa  496  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1465  nitrogenase reductase  81.72 
 
 
293 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375574  hitchhiker  0.00132251 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0088  nitrogenase reductase  81.1 
 
 
303 aa  496  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0229  nitrogenase reductase  79.38 
 
 
293 aa  488  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2345  nitrogenase reductase  82.08 
 
 
296 aa  490  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.383855  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3632  nitrogenase reductase  80.69 
 
 
293 aa  486  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.664822 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7808  nitrogenase reductase  79.31 
 
 
293 aa  485  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220892  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7753  nitrogenase reductase  79.31 
 
 
293 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73881  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3916  nitrogenase reductase  74.31 
 
 
295 aa  451  1e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1354  nitrogenase iron protein  73.88 
 
 
296 aa  451  1e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4054  nitrogenase iron protein subunit NifH  76.53 
 
 
324 aa  451  1e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00458685  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4247  nitrogenase iron protein subunit NifH  72.85 
 
 
296 aa  449  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.252394  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3855  nitrogenase iron protein  71.67 
 
 
326 aa  447  1e-124  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430007  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4478  nitrogenase reductase  76.34 
 
 
297 aa  439  1e-122  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3771  nitrogenase iron protein  74.23 
 
 
299 aa  437  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0377842  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2120  nitrogenase iron protein  71.13 
 
 
299 aa  431  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.109902 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4488  nitrogenase iron protein subunit NifH  71.43 
 
 
287 aa  432  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0491  nitrogenase iron protein  69.7 
 
 
293 aa  431  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01380  Nitrogenase iron protein  70.69 
 
 
290 aa  431  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6881  nitrogenase iron protein  70.36 
 
 
289 aa  430  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82086  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2364  nitrogenase iron protein  72.76 
 
 
298 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1049  nitrogenase iron protein  73.82 
 
 
275 aa  426  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1202  nitrogenase iron protein subunit NifH  70.67 
 
 
296 aa  424  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.451718  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3030  nitrogenase iron protein  70.71 
 
 
288 aa  418  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2098  nitrogenase iron protein  70.11 
 
 
292 aa  417  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1813  nitrogenase iron protein  68.58 
 
 
296 aa  414  1e-115  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0274  nitrogenase iron protein  67.12 
 
 
291 aa  416  1e-115  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23577  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1785  nitrogenase iron protein  68.58 
 
 
296 aa  414  1e-115  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3467  nitrogenase iron protein  67.97 
 
 
288 aa  412  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0650  nitrogenase iron protein  73.12 
 
 
288 aa  409  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1415  nitrogenase iron protein subunit NifH  72.6 
 
 
296 aa  409  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.210537 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4136  nitrogenase iron protein subunit NifH  75.19 
 
 
296 aa  407  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0109879  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2074  nitrogenase iron protein  71.17 
 
 
289 aa  404  1e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1175  nitrogenase iron protein  70.46 
 
 
289 aa  404  1e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02660  vanadium nitrogenase iron protein  69.66 
 
 
290 aa  405  1e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2821  nitrogenase iron protein  70 
 
 
289 aa  407  1e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2145  nitrogenase iron protein  70.82 
 
 
289 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.936237 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0662  nitrogenase iron protein subunit NifH  70.11 
 
 
289 aa  400  1e-110  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.24324  normal  0.221237 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1218  nitrogenase iron protein  70.11 
 
 
288 aa  400  1e-110  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3203  nitrogenase iron protein  70.71 
 
 
288 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1573  nitrogenase iron protein subunit NifH  65.58 
 
 
284 aa  378  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2821  nitrogenase iron protein  64.96 
 
 
272 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.436411  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1023  nitrogenase iron protein  62.18 
 
 
275 aa  362  3e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1751  nitrogenase reductase  64.73 
 
 
274 aa  359  4e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.555016  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1627  nitrogenase reductase  65.09 
 
 
274 aa  358  8e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000481616  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3090  nitrogenase reductase  61.51 
 
 
277 aa  356  3e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1019  nitrogenase reductase  61.45 
 
 
274 aa  355  5e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855562  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0561  nitrogenase iron protein  63 
 
 
276 aa  355  6e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  3.68653e-05  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0834  nitrogenase reductase  60.65 
 
 
276 aa  352  3e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0171  nitrogenase reductase  63.5 
 
 
273 aa  352  4e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.217628  normal  0.670038 
 
 
-
 
NC_002936  DET1158  nitrogenase reductase  60.14 
 
 
274 aa  349  3e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1142  nitrogenase iron protein  61.54 
 
 
276 aa  348  9e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.442855  normal  0.809863 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2613  nitrogenase reductase  59.35 
 
 
276 aa  345  6e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0744  nitrogenase reductase  63.64 
 
 
274 aa  338  5e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1244  nitrogenase reductase  62.91 
 
 
274 aa  338  6e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  2.40583e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0685  nitrogenase reductase  63.64 
 
 
274 aa  338  6e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1949  nitrogenase reductase  62.91 
 
 
274 aa  338  9e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00645764  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4043  nitrogenase iron protein  61.31 
 
 
273 aa  337  1e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0162942 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2281  nitrogenase reductase  60.22 
 
 
275 aa  337  1e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000562599  normal  0.173141 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1528  nitrogenase reductase  63.27 
 
 
274 aa  337  2e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1201  nitrogenase iron protein  60.95 
 
 
273 aa  336  3e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49000  nitrogenase reductase  58.97 
 
 
275 aa  335  4e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0143  nitrogenase iron protein  58.93 
 
 
280 aa  331  7e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.343179  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1434  nitrogenase iron protein  59.85 
 
 
283 aa  331  9e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0658  nitrogenase reductase  57.82 
 
 
275 aa  330  2e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0493156  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4684  nitrogenase reductase  59.12 
 
 
275 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0098  nitrogenase reductase  57.82 
 
 
275 aa  328  5e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.380897  normal  0.0345089 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1623  nitrogenase reductase  57.66 
 
 
275 aa  328  8e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2610  nitrogenase reductase  56.93 
 
 
275 aa  328  9e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.343866  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1803  nitrogenase reductase  57.09 
 
 
275 aa  328  9e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.736404  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0065  nitrogenase reductase  56.73 
 
 
275 aa  326  3e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1395  nitrogenase reductase  58.03 
 
 
275 aa  326  3e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4046  nitrogenase iron protein  55.23 
 
 
275 aa  310  3e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.316801  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0237  Nitrogenase  54.41 
 
 
272 aa  293  2e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.848648  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2083  nitrogenase  51.1 
 
 
270 aa  282  5e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0793  nitrogenase  52.99 
 
 
280 aa  282  5e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00476725  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1937  nitrogenase  52.21 
 
 
272 aa  265  6e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.894359  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1616  NifH/frxC-family protein  46.67 
 
 
276 aa  263  3e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0795  nitrogenase iron protein  48.31 
 
 
291 aa  256  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.835028  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0506  nitrogenase reductase-like protein  47.12 
 
 
290 aa  254  1e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>