36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5095 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5095  nitrogen fixation protein  100 
 
 		 154 aa  315  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0975  hypothetical protein  89.61 
 
 		 154 aa  290  7e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1079  hypothetical protein  89.03 
 
 		 155 aa  286  6e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4457  hypothetical protein  77.12 
 
 		 155 aa  251  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0236  hypothetical protein  72.6 
 
 		 152 aa  233  5.0000000000000005e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5919  hypothetical protein  73.91 
 
 		 156 aa  224  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0094  hypothetical protein  65.16 
 
 		 156 aa  224  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.123891  normal  0.916048 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0479  nitrogen fixation protein  72.08 
 
 		 156 aa  221  3e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1352  nitrogen fixation protein  64.33 
 
 		 159 aa  212  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1232  nitrogen fixation protein  67.61 
 
 		 155 aa  213  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318988 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1514  hypothetical protein  67.61 
 
 		 155 aa  213  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.111049  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3626  nitrogen fixation protein  69.23 
 
 		 155 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136981 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1473  hypothetical protein  64 
 
 		 165 aa  207  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554599  decreased coverage  0.000104665 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2322  hypothetical protein  62.34 
 
 		 170 aa  206  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0454045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2283  hypothetical protein  57.05 
 
 		 157 aa  192  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3540  nitrogen fixation protein  56.96 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.859638  hitchhiker  0.00968593 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3990  nitrogen fixation protein  59.12 
 
 		 160 aa  181  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186093  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1564  nitrogen fixation protein  52.78 
 
 		 153 aa  164  5.9999999999999996e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1252  hypothetical protein  49.68 
 
 		 156 aa  158  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2187  hypothetical protein  47.74 
 
 		 156 aa  156  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0900342 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0535  hypothetical protein  47.74 
 
 		 156 aa  156  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1508  hypothetical protein  43.51 
 
 		 153 aa  153  9e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.689838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0266  hypothetical protein  45.83 
 
 		 169 aa  150  5e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1347  nitrogen fixation protein  44.3 
 
 		 158 aa  148  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.629038  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1192  hypothetical protein  45.32 
 
 		 149 aa  144  5e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000719142 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3935  hypothetical protein  45.64 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0255327 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1791  nitrogen fixation protein  45.32 
 
 		 156 aa  137  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1819  nitrogen fixation protein  44.6 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2113  nitrogen fixation protein  46.04 
 
 		 159 aa  134  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00558029 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4253  hypothetical protein  41.94 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4141  hypothetical protein  42.45 
 
 		 156 aa  131  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01490  hypothetical protein  37.67 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4799  nitrogen fixation protein  39.1 
 
 		 157 aa  124  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4482  hypothetical protein  43.07 
 
 		 147 aa  124  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.995501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6875  hypothetical protein  40.15 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2115  hypothetical protein  29.46 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00818252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>