68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5093 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5093  ferredoxin III, nif-specific  100 
 
 		 103 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0977  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  86.41 
 
 		 103 aa  186  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.316671 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4455  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  87.5 
 
 		 104 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1081  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  87.5 
 
 		 104 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3542  ferredoxin III, nif-specific  64 
 
 		 104 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.923414  hitchhiker  0.00998746 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3989  ferredoxin III, nif-specific  62.75 
 
 		 179 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0809121  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6219  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  55.34 
 
 		 105 aa  114  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0481  ferredoxin III, nif-specific  62.5 
 
 		 103 aa  110  9e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.92658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2282  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  55.79 
 
 		 101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1253  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  65.56 
 
 		 101 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.908705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7733  ferredoxin III, nif-specific  51.65 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4902  ferredoxin III, nif-specific  52.58 
 
 		 97 aa  104  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2104  ferredoxin III, nif-specific  55.95 
 
 		 97 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000996016 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3624  ferredoxin III, nif-specific  53.4 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.182851 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0238  ferredoxin, 4Fe-4S  53.06 
 
 		 102 aa  99  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.194696  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5917  ferredoxin-3 (ferredoxin III) (FdIII)  56.84 
 
 		 95 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0534  putative dimeric ferredoxin (FdIII)  63.33 
 
 		 100 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.165776  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2186  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  63.33 
 
 		 100 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0900342 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0096  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  60 
 
 		 98 aa  97.8  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.418618  normal  0.870899 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1512  ferredoxin  48.94 
 
 		 102 aa  95.9  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.560047  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1230  ferredoxin III, nif-specific  48.94 
 
 		 102 aa  95.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000308557 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1354  ferredoxin III, nif-specific  50.5 
 
 		 102 aa  94.7  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2320  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  52.75 
 
 		 102 aa  91.3  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00672555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1562  ferredoxin III, nif-specific  60 
 
 		 94 aa  90.1  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1885  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  49.5 
 
 		 99 aa  89  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1475  hypothetical protein  49.45 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320737 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1191  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.27 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000682014 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4805  ferredoxin III, nif-specific  47.78 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.866548 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4259  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  45.56 
 
 		 98 aa  77.8  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2643  ferredoxin III  51.61 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.405945  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2102  ferredoxin family protein  41.3 
 
 		 87 aa  75.5  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2079  ferredoxin III, nif-specific  41.11 
 
 		 87 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1830  ferredoxin III, nif-specific  47.78 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2139  ferredoxin III, nif-specific  41.11 
 
 		 87 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480151 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1802  ferredoxin III, nif-specific  47.78 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0445  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  47.42 
 
 		 97 aa  73.6  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.16262 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3489  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.38 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1510  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  47.31 
 
 		 89 aa  70.9  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0633  ferredoxin III, nif-specific  40 
 
 		 89 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0632  ferredoxin III, nif-specific  42.55 
 
 		 87 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.531149  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1055  ferredoxin III, nif-specific  32.65 
 
 		 86 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0672  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  37.21 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.534446 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2804  ferredoxin family protein  38.37 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3208  ferredoxin III, nif-specific  36.47 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.478664  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.37 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0168328  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3025  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  35.71 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1695  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  58.33 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0398493  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2122  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.41 
 
 		 421 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00612142  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0533  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  31.76 
 
 		 286 aa  44.3  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1569  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.89 
 
 		 431 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0586  ferredoxin  34.12 
 
 		 289 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1602  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.52 
 
 		 206 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0849  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.35 
 
 		 204 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.478766  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01510  nitrogen fixation (4Fe-4S) ferredoxin-like protein  42.11 
 
 		 51 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41732  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2754  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.59 
 
 		 426 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.964993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0832  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.25 
 
 		 314 aa  42  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00148758  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35 
 
 		 86 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1527  hypothetical protein  29.73 
 
 		 654 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0499  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  32.88 
 
 		 268 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156783  hitchhiker  0.0000260777 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0639  NADH dehydrogenase I, 23 kDa subunit  27.96 
 
 		 200 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0799  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  30.53 
 
 		 1192 aa  40.8  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000076441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1096  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  34.67 
 
 		 266 aa  40.8  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0514529  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3918  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  27.72 
 
 		 1212 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1261  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  30.68 
 
 		 1222 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1868  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.65 
 
 		 214 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0847  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 		 206 aa  40.4  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.879675  normal  0.609652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4369  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  28 
 
 		 1193 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.278517 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3656  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.59 
 
 		 948 aa  40  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.480327 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>