More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5052 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  77.58 
 
 		 525 aa  742    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  100 
 
 		 520 aa  1032    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  58.77 
 
 		 527 aa  545  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  56.81 
 
 		 526 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  57.8 
 
 		 523 aa  534  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  56.48 
 
 		 523 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  56.2 
 
 		 528 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  56.02 
 
 		 528 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  57.61 
 
 		 516 aa  521  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  53.21 
 
 		 504 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  53.24 
 
 		 508 aa  464  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  50 
 
 		 529 aa  464  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  51.71 
 
 		 502 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  50.7 
 
 		 524 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  53.14 
 
 		 501 aa  444  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  49.25 
 
 		 520 aa  443  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  53.68 
 
 		 503 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  53.68 
 
 		 503 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  52.77 
 
 		 513 aa  436  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  52.77 
 
 		 513 aa  436  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  52.44 
 
 		 496 aa  434  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  53.46 
 
 		 496 aa  435  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  52.23 
 
 		 496 aa  430  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  48.95 
 
 		 537 aa  426  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  45.78 
 
 		 517 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  45.52 
 
 		 527 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  48.69 
 
 		 491 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  45.07 
 
 		 527 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  47.4 
 
 		 491 aa  392  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  47.42 
 
 		 505 aa  374  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  47.32 
 
 		 483 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  50.98 
 
 		 509 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  47.1 
 
 		 483 aa  365  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  45.96 
 
 		 483 aa  363  3e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  42.66 
 
 		 506 aa  363  3e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  45.26 
 
 		 535 aa  351  2e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  43.63 
 
 		 501 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  43.19 
 
 		 500 aa  339  8e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  43.33 
 
 		 514 aa  338  9e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  45.57 
 
 		 498 aa  338  9.999999999999999e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  42.43 
 
 		 506 aa  333  6e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  42.43 
 
 		 493 aa  332  8e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  42.16 
 
 		 511 aa  331  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  41.22 
 
 		 524 aa  329  9e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  41.22 
 
 		 524 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  47.12 
 
 		 498 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  44.02 
 
 		 501 aa  327  3e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  40.63 
 
 		 520 aa  326  6e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  43.92 
 
 		 508 aa  324  2e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  40.72 
 
 		 528 aa  324  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  41.37 
 
 		 487 aa  323  4e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  42.83 
 
 		 500 aa  323  5e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  46.53 
 
 		 497 aa  323  6e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  41.88 
 
 		 493 aa  323  7e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  46.39 
 
 		 496 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  43.74 
 
 		 501 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  41.76 
 
 		 501 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  40.9 
 
 		 518 aa  320  5e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  42.36 
 
 		 511 aa  319  7.999999999999999e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  40.83 
 
 		 501 aa  319  9e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  42.16 
 
 		 511 aa  317  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  39.23 
 
 		 471 aa  316  6e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  38.77 
 
 		 588 aa  316  7e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  46.37 
 
 		 497 aa  316  8e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  47.91 
 
 		 524 aa  315  9.999999999999999e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  41.2 
 
 		 499 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  43.05 
 
 		 476 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  42.43 
 
 		 498 aa  312  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  46.29 
 
 		 462 aa  311  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  44.37 
 
 		 516 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  42.35 
 
 		 457 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  43.11 
 
 		 473 aa  309  6.999999999999999e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  37.96 
 
 		 578 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  37.74 
 
 		 522 aa  307  3e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  39.75 
 
 		 515 aa  306  5.0000000000000004e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  42.25 
 
 		 472 aa  306  8.000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  42.92 
 
 		 464 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  38.53 
 
 		 497 aa  301  2e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  40.74 
 
 		 485 aa  301  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  40.82 
 
 		 508 aa  301  2e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  40.26 
 
 		 523 aa  300  3e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3331  peptidase S1C, Do  41.1 
 
 		 510 aa  300  4e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107916  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  40.38 
 
 		 499 aa  300  4e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  41.19 
 
 		 458 aa  298  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2014  protease Do  41.13 
 
 		 502 aa  298  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  42.41 
 
 		 481 aa  299  1e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  41.03 
 
 		 482 aa  296  7e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  40.04 
 
 		 485 aa  292  8e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3889  protease Do  41.96 
 
 		 524 aa  292  9e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42007  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  39.91 
 
 		 476 aa  291  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0922  protease Do family protein  40.33 
 
 		 496 aa  290  3e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.726985  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  40.4 
 
 		 475 aa  289  7e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  41.02 
 
 		 476 aa  289  8e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  40.73 
 
 		 476 aa  288  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  38.93 
 
 		 459 aa  286  5e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  40.27 
 
 		 476 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  38.48 
 
 		 475 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  40.04 
 
 		 513 aa  282  9e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  38.71 
 
 		 464 aa  282  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  37.31 
 
 		 466 aa  282  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>