54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4969 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4969  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  308  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4380  hypothetical protein  78 
 
 		 150 aa  247  5e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  78 
 
 		 150 aa  232  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6915  YchN-like domain-containing protein  64.63 
 
 		 151 aa  209  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.521749 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  57.38 
 
 		 151 aa  167  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2894  hypothetical protein  50.99 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3669  hypothetical protein  56.92 
 
 		 150 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.522918  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4164  protein of unknown function DUF1791  48.95 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3678  hypothetical protein  34.72 
 
 		 144 aa  97.1  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3025  hypothetical protein  43.44 
 
 		 162 aa  93.2  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0173  hypothetical protein  38.84 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.129014  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2583  hypothetical protein  38.06 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2157  hypothetical protein  34.43 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2758  hypothetical protein  33.61 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3670  hypothetical protein  32.52 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0563  hypothetical protein  30 
 
 		 246 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0056  hypothetical protein  31.97 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0140  hypothetical protein  32.79 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3049  hypothetical protein  31.94 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2302  Domain of unknown function DUF1791  24.81 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.162762  normal  0.0557387 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0180  hypothetical protein  31.54 
 
 		 181 aa  62  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0526709  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0779  hypothetical protein  28.23 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.790907  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0468  hypothetical protein  35.54 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1835  hypothetical protein  22.9 
 
 		 242 aa  57  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292483 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  30.65 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  30.4 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1146  hypothetical protein  28.24 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.545594  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0692  Domain of unknown function DUF1791  29.41 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0872755 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0805  hypothetical protein  26.09 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  27.87 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  27.63 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6946  Domain of unknown function DUF1791  28.36 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3197  hypothetical protein  29.57 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4871  hypothetical protein  26.15 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0466  hypothetical protein  26.02 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  25.62 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1822  Domain of unknown function DUF1791  30.97 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.699958  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0015  hypothetical protein  24.59 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000351673  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3213  hypothetical protein  24.31 
 
 		 177 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0095  Domain of unknown function DUF1791  27.21 
 
 		 176 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.921438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1837  hypothetical protein  28.07 
 
 		 150 aa  47  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3680  hypothetical protein  30.3 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0547  hypothetical protein  26.36 
 
 		 169 aa  45.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.733611  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0267  hypothetical protein  24.6 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000206306  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0691  Domain of unknown function DUF1791  29.87 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0623346 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0461  hypothetical protein  23.39 
 
 		 251 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.114453  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2158  hypothetical protein  24.05 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1472  hypothetical protein  22.37 
 
 		 151 aa  42  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00198336  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0171  hypothetical protein  23.2 
 
 		 256 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.471424  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1803  hypothetical protein  19.83 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.268314 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2005  hypothetical protein  24.44 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00242078  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0065  hypothetical protein  28.32 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0093  hypothetical protein  25.2 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2431  putative signal peptide protein  28.74 
 
 		 137 aa  40  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>