More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4858 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  84.25 
 
 
461 aa  764  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  74.78 
 
 
461 aa  696  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  74.37 
 
 
464 aa  684  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  84.47 
 
 
476 aa  767  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  73.06 
 
 
464 aa  677  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  100 
 
 
463 aa  943  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  81.09 
 
 
489 aa  743  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  57.89 
 
 
469 aa  494  1e-138  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2863  peptidase M16 domain protein  58.75 
 
 
457 aa  491  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631519 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1801  peptidase M16 domain-containing protein  55.96 
 
 
469 aa  472  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2217  peptidase M16 domain-containing protein  55.21 
 
 
454 aa  465  1e-130  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.800004  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0394  peptidase M16 domain protein  54.48 
 
 
459 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0405646  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1009  peptidase M16 domain-containing protein  54.08 
 
 
468 aa  461  1e-128  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2328  peptidase M16 domain-containing protein  54.24 
 
 
460 aa  456  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.977171  normal  0.638567 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2605  peptidase M16 domain protein  54.24 
 
 
460 aa  456  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.204595 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4178  peptidase M16 domain-containing protein  52.28 
 
 
459 aa  456  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2283  peptidase M16 domain protein  53.98 
 
 
460 aa  455  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366903  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  50.43 
 
 
448 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  50.43 
 
 
448 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  51.45 
 
 
448 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  48.85 
 
 
477 aa  420  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  48.25 
 
 
513 aa  420  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0290  peptidase M16 domain-containing protein  48.01 
 
 
456 aa  411  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  47.38 
 
 
514 aa  412  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0361  peptidase M16 protein  49.1 
 
 
453 aa  402  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  48.21 
 
 
459 aa  393  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2715  peptidase M16 domain-containing protein  49.64 
 
 
472 aa  379  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395042  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7810  putative zinc protease  43.54 
 
 
467 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129356  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4045  peptidase M16-like  45.52 
 
 
463 aa  363  5e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  43.41 
 
 
453 aa  355  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  41.16 
 
 
470 aa  300  3e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  39.15 
 
 
453 aa  296  4e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  39.8 
 
 
465 aa  294  2e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  39.3 
 
 
452 aa  290  5e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0849  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  38.2 
 
 
438 aa  286  8e-76  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.745956  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  40.24 
 
 
466 aa  285  2e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  42.08 
 
 
459 aa  284  3e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  38.39 
 
 
504 aa  282  7e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1057  M16 family peptidase  36.98 
 
 
439 aa  279  1e-73  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  36.79 
 
 
441 aa  278  2e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  36.79 
 
 
441 aa  278  2e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  38.22 
 
 
470 aa  276  5e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  38.36 
 
 
462 aa  274  2e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  36.85 
 
 
453 aa  274  3e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  38.57 
 
 
506 aa  272  9e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  37.17 
 
 
459 aa  272  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  38.72 
 
 
501 aa  270  4e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  36.54 
 
 
454 aa  269  6e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  36.93 
 
 
494 aa  267  3e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  35.7 
 
 
455 aa  266  4e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  38.13 
 
 
492 aa  266  8e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  37.41 
 
 
477 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  36.87 
 
 
451 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  36.41 
 
 
451 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  36.3 
 
 
450 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  35.94 
 
 
451 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  36.3 
 
 
450 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  36.99 
 
 
448 aa  261  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  37.22 
 
 
499 aa  259  8e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4985  peptidase M16 domain-containing protein  35.94 
 
 
451 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2306  peptidase M16 domain-containing protein  39.13 
 
 
443 aa  258  2e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  34.78 
 
 
453 aa  257  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  34.27 
 
 
493 aa  256  5e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  35.17 
 
 
493 aa  255  1e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1671  peptidase M16-like  37.5 
 
 
509 aa  254  2e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  35.32 
 
 
465 aa  254  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  35.32 
 
 
465 aa  254  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  35.57 
 
 
442 aa  252  1e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  37.03 
 
 
484 aa  251  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  35.32 
 
 
459 aa  250  3e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  36.74 
 
 
479 aa  250  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5338  peptidase M16-like  35.88 
 
 
451 aa  250  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  36.97 
 
 
484 aa  249  8e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1279  peptidase M16-like  38.72 
 
 
481 aa  247  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  34.18 
 
 
530 aa  245  1e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  33.41 
 
 
489 aa  244  3e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  34.38 
 
 
484 aa  243  6e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  35.31 
 
 
455 aa  242  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4373  peptidase M16 domain protein  38.37 
 
 
473 aa  240  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2658  peptidase M16 domain-containing protein  34.62 
 
 
460 aa  239  9e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.287658  hitchhiker  0.000609596 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  33.56 
 
 
443 aa  233  4e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  32.89 
 
 
443 aa  231  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0761  insulinase family protease  33.97 
 
 
446 aa  231  2e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.126087  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  32.24 
 
 
443 aa  229  7e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  32.46 
 
 
443 aa  229  9e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  36.67 
 
 
458 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  36.26 
 
 
458 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  32.46 
 
 
443 aa  229  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  32.24 
 
 
443 aa  227  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0102  peptidase M16-like  36.41 
 
 
458 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49801  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  32.88 
 
 
441 aa  225  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  35.05 
 
 
441 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  34.8 
 
 
457 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  32.02 
 
 
443 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  32.02 
 
 
443 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  32.02 
 
 
443 aa  223  8e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  34.56 
 
 
457 aa  223  8e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  32.66 
 
 
443 aa  221  2e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  33.26 
 
 
443 aa  219  7e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0627  peptidase, M16 family  31.88 
 
 
417 aa  219  9e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>