166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4853 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 183 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  81.72 
 
 		 186 aa  286  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3885  MarR family transcriptional regulator  79.46 
 
 		 185 aa  275  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0480045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1387  MarR family transcriptional regulator  75.96 
 
 		 185 aa  266  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207985  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  78.18 
 
 		 169 aa  251  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  74.57 
 
 		 182 aa  248  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  81.38 
 
 		 169 aa  229  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2557  MarR family transcriptional regulator  60.37 
 
 		 183 aa  184  8e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6016  MarR family transcriptional regulator  56.44 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  55.23 
 
 		 191 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7271  transcriptional regulator, MarR family  61.48 
 
 		 184 aa  170  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  55.23 
 
 		 191 aa  170  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  62.88 
 
 		 160 aa  169  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2510  transcriptional regulator, MarR family  58.99 
 
 		 179 aa  166  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  55.83 
 
 		 187 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  61.31 
 
 		 163 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  57.04 
 
 		 172 aa  161  6e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  60.58 
 
 		 163 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2141  MarR family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 174 aa  159  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223544  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1645  MarR family transcriptional regulator  54.19 
 
 		 173 aa  157  8e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4070  MarR family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 181 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.650138  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1520  MarR family transcriptional regulator  56.49 
 
 		 179 aa  153  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935208  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1470  MarR family transcriptional regulator  56.49 
 
 		 237 aa  153  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  56.15 
 
 		 154 aa  144  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 179 aa  125  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3300  transcriptional regulator  48.48 
 
 		 168 aa  123  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2800  MarR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 169 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  48.46 
 
 		 172 aa  119  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1139  MarR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0093  MarR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 169 aa  115  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.560358 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2925  MarR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.652436 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2601  MarR family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 172 aa  101  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2787  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3619  MarR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 157 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43140  MarR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 158 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00364645  normal  0.320995 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3286  transcriptional regulator, MarR family  43.17 
 
 		 183 aa  95.5  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3510  transcriptional regulator, MarR family  44.55 
 
 		 167 aa  94.7  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2652  MarR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 151 aa  94.7  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 175 aa  94.7  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2708  regulatory protein MarR  34.96 
 
 		 151 aa  94.7  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  38.74 
 
 		 148 aa  94.4  8e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3578  transcriptional regulator, MarR family  44.55 
 
 		 167 aa  94.4  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3429  MarR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 152 aa  93.6  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.063999  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3279  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 148 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861844  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2518  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 160 aa  89  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000237934  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1988  MarR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 147 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27646  hitchhiker  0.00136525 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2292  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 158 aa  88.6  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00249883  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1840  regulatory protein, MarR  38.46 
 
 		 156 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.076526  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1712  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 147 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2672  MarR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 145 aa  87.8  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273141  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0772  MarR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 146 aa  87  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1793  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 160 aa  86.3  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2441  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 		 160 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2894  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 		 160 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195714  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2582  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 		 160 aa  85.1  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000123065  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2312  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 160 aa  84.3  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.986519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2233  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 160 aa  84.3  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2487  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 160 aa  84.3  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.229452  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2508  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 160 aa  84.3  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.888447 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2280  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 160 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0185424  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2086  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.788837  hitchhiker  0.000000978102 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2138  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.14968  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 321 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 325 aa  52  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 336 aa  51.6  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 		 161 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 326 aa  51.6  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7681  CbaR  26.61 
 
 		 166 aa  51.2  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0113297  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 160 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2471  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 321 aa  48.9  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.536093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3730  transcriptional regulator, MarR family  23 
 
 		 151 aa  48.5  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 162 aa  48.5  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1971  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  48.5  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  28.16 
 
 		 140 aa  48.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  26.55 
 
 		 180 aa  47.8  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 326 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3239  transcriptional regulatory protein  27.59 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.616739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 326 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4054  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 323 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0352596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  23.58 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 326 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 326 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 329 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4307  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 152 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1620  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 140 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664296  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0095  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 142 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 146 aa  45.4  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5077  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  45.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 		 164 aa  45.1  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 137 aa  45.4  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  28.72 
 
 		 140 aa  45.1  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0413  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 151 aa  45.4  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.019986  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  22.31 
 
 		 150 aa  45.4  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2651  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 143 aa  45.1  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 		 162 aa  45.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 143 aa  44.7  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>