43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4848 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4848  Protein of unknown function DUF1790  100 
 
 		 166 aa  345  2e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4170  hypothetical protein  87.35 
 
 		 166 aa  311  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3881  hypothetical protein  87.95 
 
 		 179 aa  310  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.832488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1407  hypothetical protein  81.93 
 
 		 166 aa  298  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.246502 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2513  hypothetical protein  78.31 
 
 		 166 aa  284  4e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.31273 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3105  hypothetical protein  80.12 
 
 		 179 aa  270  7e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1744  hypothetical protein  72.29 
 
 		 166 aa  262  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111746 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4947  hypothetical protein  53.25 
 
 		 169 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.399738  hitchhiker  0.000000153474 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2546  hypothetical protein  54.82 
 
 		 166 aa  194  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1137  Protein of unknown function DUF1790  55.19 
 
 		 166 aa  194  6e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643359 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0854  hypothetical protein  52.83 
 
 		 167 aa  192  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2756  Protein of unknown function DUF1790  51.2 
 
 		 166 aa  190  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3019  Protein of unknown function DUF1790  51.2 
 
 		 166 aa  190  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1376  Protein of unknown function DUF1790  52.2 
 
 		 167 aa  190  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0660662  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2148  hypothetical protein  53.01 
 
 		 166 aa  190  7e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.8454  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2250  hypothetical protein  51.2 
 
 		 166 aa  189  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1475  hypothetical protein  51.2 
 
 		 243 aa  187  8e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0717176  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1525  hypothetical protein  51.2 
 
 		 220 aa  186  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1641  hypothetical protein  51.81 
 
 		 166 aa  186  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2264  hypothetical protein  52.56 
 
 		 167 aa  186  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652496 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3169  hypothetical protein  50.6 
 
 		 166 aa  184  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4064  Protein of unknown function DUF1790  50.97 
 
 		 168 aa  184  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3770  hypothetical protein  50.97 
 
 		 168 aa  184  5e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.757189 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4025  Protein of unknown function DUF1790  50.97 
 
 		 168 aa  184  7e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.377233  normal  0.351333 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1259  hypothetical protein  49.69 
 
 		 166 aa  182  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00906465 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3280  hypothetical protein  45.57 
 
 		 166 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0991  hypothetical protein  45.57 
 
 		 166 aa  159  2e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0359037  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2703  hypothetical protein  42.41 
 
 		 167 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.600419  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1096  Protein of unknown function DUF1790  44.52 
 
 		 167 aa  151  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.820328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0763  hypothetical protein  42.86 
 
 		 167 aa  139  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.396097 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0676  hypothetical protein  38.96 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.298237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0622  hypothetical protein  36.75 
 
 		 166 aa  128  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0039  hypothetical protein  41.67 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.158376  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4471  hypothetical protein  37.82 
 
 		 170 aa  121  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.39855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1141  hypothetical protein  32.03 
 
 		 167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1322  hypothetical protein  35.06 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.19423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2646  hypothetical protein  34.73 
 
 		 176 aa  112  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.364701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2199  hypothetical protein  34.34 
 
 		 166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00724399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3330  hypothetical protein  33.77 
 
 		 167 aa  107  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.635014  normal  0.855915 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3008  hypothetical protein  33.53 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.719619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3363  hypothetical protein  33.53 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1940  hypothetical protein  33.72 
 
 		 151 aa  44.7  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.473224  normal  0.0765452 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0545  hypothetical protein  27.19 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>