166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4843 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4843  protein of unknown function DUF185  100 
 
 		 379 aa  766    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4165  hypothetical protein  81.87 
 
 		 376 aa  634    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.576249  normal  0.0725771 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3876  hypothetical protein  83.06 
 
 		 376 aa  638    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1764  hypothetical protein  71.31 
 
 		 375 aa  566  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526416  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1412  hypothetical protein  71.2 
 
 		 375 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00525557  normal  0.308753 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3094  hypothetical protein  70.46 
 
 		 375 aa  555  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2503  hypothetical protein  71.59 
 
 		 390 aa  553  1e-156  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156222  normal  0.549612 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2549  hypothetical protein  52.66 
 
 		 368 aa  358  9.999999999999999e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2261  hypothetical protein  50.71 
 
 		 356 aa  321  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2759  protein of unknown function DUF185  48.48 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3022  protein of unknown function DUF185  46.83 
 
 		 366 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.838138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5412  hypothetical protein  51.52 
 
 		 356 aa  309  5e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3172  hypothetical protein  46.67 
 
 		 377 aa  301  9e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0778857  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5254  protein of unknown function DUF185  48.11 
 
 		 367 aa  299  6e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3534  hypothetical protein  43.39 
 
 		 386 aa  292  6e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1134  protein of unknown function DUF185  47.89 
 
 		 369 aa  291  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0347191 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2253  hypothetical protein  44.51 
 
 		 367 aa  287  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3290  hypothetical protein  49.86 
 
 		 367 aa  286  4e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_004310  BR1529  hypothetical protein  42.98 
 
 		 365 aa  272  8.000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1478  hypothetical protein  42.7 
 
 		 365 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00590219  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2884  hypothetical protein  48.63 
 
 		 361 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1638  hypothetical protein  43.14 
 
 		 363 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2151  hypothetical protein  44.26 
 
 		 358 aa  266  4e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3007  protein of unknown function DUF185  48.03 
 
 		 362 aa  266  5e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3110  protein of unknown function DUF185  48.73 
 
 		 361 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.922104  normal  0.232642 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0760  hypothetical protein  40 
 
 		 366 aa  258  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.562403 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2212  hypothetical protein  45.26 
 
 		 355 aa  257  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0487  hypothetical protein  43.38 
 
 		 356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1230  hypothetical protein  42.98 
 
 		 351 aa  249  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.369365  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0619  hypothetical protein  43.42 
 
 		 357 aa  248  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2650  hypothetical protein  45.11 
 
 		 363 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0995  hypothetical protein  38.59 
 
 		 366 aa  246  6e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199095  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0642  hypothetical protein  44 
 
 		 364 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175347  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0259  hypothetical protein  46.05 
 
 		 353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.655158 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3334  hypothetical protein  46.76 
 
 		 371 aa  241  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0231  hypothetical protein  46.5 
 
 		 353 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1579  hypothetical protein  49.66 
 
 		 351 aa  230  4e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0717  hypothetical protein  33.9 
 
 		 349 aa  227  3e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1092  protein of unknown function DUF185  42.69 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.192418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0673  hypothetical protein  39.64 
 
 		 402 aa  224  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41366  predicted protein  37.6 
 
 		 461 aa  223  4e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.151662  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0679  hypothetical protein  40.68 
 
 		 351 aa  217  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00510  conserved hypothetical protein  37.37 
 
 		 449 aa  216  4e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0424  hypothetical protein  38.87 
 
 		 324 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0313  hypothetical protein  32.46 
 
 		 335 aa  210  4e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.368023  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0762  hypothetical protein  31.99 
 
 		 335 aa  209  9e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.244362  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68115  predicted protein  32.32 
 
 		 515 aa  199  1.0000000000000001e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06041  DUF185 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09740)  30.82 
 
 		 504 aa  179  5.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.115857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0601  hypothetical protein  32.39 
 
 		 323 aa  176  9e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.434393  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15641  predicted protein  33.24 
 
 		 349 aa  142  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  31.64 
 
 		 370 aa  136  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  30.89 
 
 		 393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  28.44 
 
 		 386 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  0.0000000752417 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1815  hypothetical protein  30.19 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.520553  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  30.94 
 
 		 386 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  26.65 
 
 		 384 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1049  hypothetical protein  32.18 
 
 		 392 aa  121  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0950573  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  31.18 
 
 		 384 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1451  hypothetical protein  31.81 
 
 		 410 aa  119  7e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2922  hypothetical protein  28.97 
 
 		 370 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0697  protein of unknown function DUF185  31.58 
 
 		 391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2776  hypothetical protein  29.56 
 
 		 370 aa  116  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  32.7 
 
 		 393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0115  hypothetical protein  29 
 
 		 400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629873  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  32.11 
 
 		 387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3384  hypothetical protein  31.3 
 
 		 410 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000710511  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0523  hypothetical protein  31.3 
 
 		 410 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3057  hypothetical protein  31.3 
 
 		 396 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.797312  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2036  hypothetical protein  31.3 
 
 		 396 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0330  hypothetical protein  31.42 
 
 		 396 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0343  hypothetical protein  31.3 
 
 		 396 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2248  hypothetical protein  31.3 
 
 		 396 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  30 
 
 		 388 aa  114  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  29.74 
 
 		 417 aa  113  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  32.3 
 
 		 398 aa  113  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  29.74 
 
 		 397 aa  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  28.87 
 
 		 404 aa  112  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  30.68 
 
 		 396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0155  hypothetical protein  31.54 
 
 		 397 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0048  protein of unknown function DUF185  29.57 
 
 		 397 aa  109  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07541  hypothetical protein  28.21 
 
 		 396 aa  109  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07411  hypothetical protein  28.26 
 
 		 400 aa  109  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15581  hypothetical protein  29.48 
 
 		 405 aa  109  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.540295 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2887  hypothetical protein  30.05 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0203  hypothetical protein  30.47 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0294  hypothetical protein  30.87 
 
 		 410 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3886  hypothetical protein  29.87 
 
 		 394 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.643173  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  29.43 
 
 		 393 aa  107  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0812  hypothetical protein  29.8 
 
 		 375 aa  107  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  28.87 
 
 		 385 aa  106  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0337  hypothetical protein  29.89 
 
 		 424 aa  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4813  hypothetical protein  28.25 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2988  hypothetical protein  25.74 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2793  protein of unknown function DUF185  29.22 
 
 		 386 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.425322  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0551  hypothetical protein  31.17 
 
 		 358 aa  105  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2895  hypothetical protein  29.51 
 
 		 397 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3733  protein of unknown function DUF185  30.83 
 
 		 396 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.709484 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6326  hypothetical protein  30.62 
 
 		 397 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1418  protein of unknown function DUF185  28.39 
 
 		 385 aa  103  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2363  hypothetical protein  30.68 
 
 		 396 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>