More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4815 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  100 
 
 		 313 aa  646    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  91.37 
 
 		 313 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  87.54 
 
 		 313 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  77.56 
 
 		 313 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0410  aldo/keto reductase  59.24 
 
 		 320 aa  362  3e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213987  normal  0.0921299 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0069  aldo/keto reductase  53.31 
 
 		 323 aa  324  9e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1649  aldo/keto reductase  55.21 
 
 		 325 aa  320  9.999999999999999e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.328017  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4281  aldo/keto reductase  53.57 
 
 		 317 aa  319  3e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198466  hitchhiker  0.0048015 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  53.38 
 
 		 309 aa  316  3e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6154  aldo/keto reductase  53.46 
 
 		 316 aa  315  4e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.775736  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1641  aldo/keto reductase  53.33 
 
 		 325 aa  313  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000385668 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3890  aldo/keto reductase  52.23 
 
 		 319 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.872462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0458  aldo/keto reductase  52.55 
 
 		 317 aa  312  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5072  aldo/keto reductase  53.33 
 
 		 325 aa  309  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1691  aldo/keto reductase  52.65 
 
 		 336 aa  303  2.0000000000000002e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0210969 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10970  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  52.98 
 
 		 327 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6159  aldo/keto reductase  49.84 
 
 		 317 aa  296  3e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145044  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13010  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  51.9 
 
 		 324 aa  291  8e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118581  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4777  aldo/keto reductase  50.16 
 
 		 321 aa  286  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4073  aldo/keto reductase  49.84 
 
 		 311 aa  286  5e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.492904 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1876  aldo/keto reductase  47 
 
 		 317 aa  281  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0609138 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3670  aldo/keto reductase  44.98 
 
 		 311 aa  255  6e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  41.95 
 
 		 338 aa  249  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  43.34 
 
 		 341 aa  246  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  43.79 
 
 		 349 aa  246  4e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  43.17 
 
 		 332 aa  244  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  45.71 
 
 		 340 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  41.25 
 
 		 349 aa  242  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1849  aldo/keto reductase  42.77 
 
 		 337 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0475646  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3416  aldo/keto reductase  41.25 
 
 		 348 aa  238  9e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  42.09 
 
 		 341 aa  238  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  42.46 
 
 		 350 aa  238  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  42.68 
 
 		 352 aa  237  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  41.54 
 
 		 353 aa  237  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  41.38 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  43.4 
 
 		 345 aa  236  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  40.94 
 
 		 344 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7154  aldo/keto reductase  39.69 
 
 		 347 aa  236  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2549  aldo/keto reductase  40.43 
 
 		 344 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.943239 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  43.22 
 
 		 322 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  40.81 
 
 		 325 aa  235  7e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  42.86 
 
 		 332 aa  235  8e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4044  aldo/keto reductase  39.44 
 
 		 344 aa  234  9e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3180  aldo/keto reductase  39.45 
 
 		 345 aa  235  9e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2911  aldo/keto reductase  40.19 
 
 		 343 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187668  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6213  aldo/keto reductase  41.56 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.344018 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  45.89 
 
 		 341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1556  aldo/keto reductase  40.62 
 
 		 349 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.568157 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4856  aldo/keto reductase  41.72 
 
 		 343 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3210  aldo/keto reductase  42.06 
 
 		 342 aa  233  3e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0255002 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2808  aldo/keto reductase  40.43 
 
 		 344 aa  232  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  41.96 
 
 		 327 aa  232  5e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0948  aldo/keto reductase  43.17 
 
 		 333 aa  232  6e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00901952  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6644  aldo/keto reductase  41.1 
 
 		 342 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000695523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  42.36 
 
 		 343 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0585  aldo/keto reductase  41.07 
 
 		 344 aa  229  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  40.38 
 
 		 345 aa  229  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  41.64 
 
 		 344 aa  229  4e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  42.32 
 
 		 342 aa  228  9e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  39.5 
 
 		 331 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6197  aldo/keto reductase  41.4 
 
 		 339 aa  227  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5984  aldo/keto reductase  42.86 
 
 		 368 aa  227  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  39.62 
 
 		 325 aa  226  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6124  aldo/keto reductase  40.62 
 
 		 326 aa  226  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3045  aldo/keto reductase  39.38 
 
 		 326 aa  226  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  42.44 
 
 		 343 aa  226  6e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  39.69 
 
 		 336 aa  225  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4161  aldo/keto reductase  39.14 
 
 		 344 aa  225  7e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  39.14 
 
 		 344 aa  225  8e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4437  putative oxidoreductase  38.75 
 
 		 340 aa  225  8e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  40.74 
 
 		 352 aa  224  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2751  aldo/keto family dehydrogenase  39.06 
 
 		 329 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000178849 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3852  aldo/keto reductase  39.14 
 
 		 389 aa  224  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3378  aldo/keto reductase  38.2 
 
 		 337 aa  224  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  39.06 
 
 		 331 aa  223  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3015  putative oxidoreductase, MocA  39.81 
 
 		 341 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  39.56 
 
 		 315 aa  224  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  39.32 
 
 		 329 aa  224  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2914  aldo/keto reductase  42.24 
 
 		 345 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  40.63 
 
 		 333 aa  223  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  42.31 
 
 		 343 aa  223  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4540  aldo/keto reductase  38.12 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  41.8 
 
 		 352 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1427  aldo/keto reductase  39.2 
 
 		 341 aa  223  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3340  aldo/keto reductase  40.94 
 
 		 343 aa  223  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  0.0837708 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  39.51 
 
 		 349 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  42.63 
 
 		 354 aa  223  4e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0950  aldo/keto reductase  40.63 
 
 		 334 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493854  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  40 
 
 		 349 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5173  aldo/keto reductase  41.23 
 
 		 345 aa  223  4.9999999999999996e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  40 
 
 		 349 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3268  aldo/keto reductase  40.94 
 
 		 345 aa  222  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  38.82 
 
 		 331 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  40.58 
 
 		 333 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  40.13 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  39.63 
 
 		 357 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  39.18 
 
 		 343 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  39.62 
 
 		 344 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5127  aldo/keto reductase  40.94 
 
 		 345 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  42.11 
 
 		 352 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.8158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>