More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4717 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4717  protein of unknown function DUF140  100 
 
 		 382 aa  762    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819225  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  84.88 
 
 		 378 aa  642    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  85.07 
 
 		 378 aa  641    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  75.2 
 
 		 388 aa  566  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  74.34 
 
 		 378 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  71.66 
 
 		 378 aa  547  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4485  protein of unknown function DUF140  57.6 
 
 		 383 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1315  hypothetical protein  58.02 
 
 		 377 aa  427  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1627  hypothetical protein  56.15 
 
 		 383 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  0.63791 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5557  putative ABC transporter (permease protein)  57.87 
 
 		 377 aa  420  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.396746 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1636  hypothetical protein  55.88 
 
 		 383 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3500  hypothetical protein  55.5 
 
 		 376 aa  401  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1452  hypothetical protein  54.4 
 
 		 377 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  58.21 
 
 		 344 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4113  hypothetical protein  54.09 
 
 		 474 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0817  protein of unknown function DUF140  51.68 
 
 		 382 aa  349  5e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000758551  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0851  protein of unknown function DUF140  51.4 
 
 		 381 aa  347  1e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0891  hypothetical protein  51.4 
 
 		 382 aa  346  5e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.250825 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3668  hypothetical protein  47.06 
 
 		 377 aa  341  1e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0702453 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1952  hypothetical protein  47.75 
 
 		 384 aa  323  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0257894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2807  protein of unknown function DUF140  47.61 
 
 		 379 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1540  hypothetical protein  44.71 
 
 		 395 aa  311  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2195  protein of unknown function DUF140  45.16 
 
 		 394 aa  305  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130725  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4961  protein of unknown function DUF140  48.39 
 
 		 386 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.77669  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1893  ABC transporter membrane spanning protein  45.52 
 
 		 376 aa  301  9e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.228416  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1019  toulene ABC transporter, permease protein, putative  46.11 
 
 		 391 aa  301  2e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1984  protein of unknown function DUF140  46.24 
 
 		 383 aa  299  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.622106 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0986  putative toulene ABC transporter, permease protein  45.83 
 
 		 365 aa  298  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4933  hypothetical protein  46.58 
 
 		 394 aa  292  8e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0419987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2107  hypothetical protein  44.83 
 
 		 391 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  40.97 
 
 		 387 aa  285  9e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  43.1 
 
 		 366 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  44.02 
 
 		 384 aa  278  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1554  hypothetical protein  46.58 
 
 		 379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  44.44 
 
 		 366 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  44.14 
 
 		 366 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  40.87 
 
 		 406 aa  262  8e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  40.55 
 
 		 365 aa  260  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  42.01 
 
 		 364 aa  258  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03183  ABC transporter permease  38.69 
 
 		 370 aa  255  8e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  36.1 
 
 		 396 aa  247  2e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  36.36 
 
 		 372 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000296062  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  40.54 
 
 		 430 aa  245  8e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  37.57 
 
 		 384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  39.7 
 
 		 372 aa  240  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  37.4 
 
 		 382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0524  protein of unknown function DUF140  36.93 
 
 		 373 aa  239  5.999999999999999e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  38.86 
 
 		 382 aa  238  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  38.11 
 
 		 368 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  37.31 
 
 		 385 aa  233  6e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1915  ABC transporter permease  37.33 
 
 		 381 aa  222  9e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  33.95 
 
 		 383 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  37.67 
 
 		 413 aa  219  5e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22680  putative permease of ABC transporter  36.77 
 
 		 381 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590843 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0158  hypothetical protein  36.13 
 
 		 377 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  37.77 
 
 		 384 aa  219  8.999999999999998e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  33.05 
 
 		 370 aa  216  5e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5085  hypothetical protein  37.37 
 
 		 377 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0160  hypothetical protein  36.86 
 
 		 377 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0142  hypothetical protein  35.64 
 
 		 377 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  32.53 
 
 		 376 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0373  hypothetical protein  34.68 
 
 		 379 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  35.64 
 
 		 377 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  32.07 
 
 		 373 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0247  ABC transport system permease protein  37.35 
 
 		 364 aa  209  5e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3564  hypothetical protein  33.8 
 
 		 371 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.777285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04780  ABC transporter protein  33.93 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1839  hypothetical protein  34.03 
 
 		 376 aa  204  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  29.92 
 
 		 369 aa  204  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  35.84 
 
 		 382 aa  203  3e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  29.92 
 
 		 369 aa  204  3e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  31.83 
 
 		 377 aa  202  8e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  31.83 
 
 		 377 aa  202  9e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  29.38 
 
 		 369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  32.88 
 
 		 380 aa  195  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  34.23 
 
 		 368 aa  193  4e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  35.79 
 
 		 386 aa  193  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0378  protein of unknown function DUF140  33.43 
 
 		 370 aa  193  5e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0306  hypothetical protein  33.52 
 
 		 375 aa  190  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45629  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  31.34 
 
 		 374 aa  189  7e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  31.34 
 
 		 374 aa  189  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  33.15 
 
 		 368 aa  186  4e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  32.1 
 
 		 447 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  32.1 
 
 		 374 aa  186  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0577  ABC transport system permease  31.02 
 
 		 367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  32.1 
 
 		 374 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  32 
 
 		 374 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  33.51 
 
 		 383 aa  184  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2277  protein of unknown function DUF140  37.73 
 
 		 371 aa  182  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  31.73 
 
 		 374 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0313  hypothetical protein  34.45 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0072  hypothetical protein  30.91 
 
 		 376 aa  179  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0299  protein of unknown function DUF140  32.51 
 
 		 388 aa  179  9e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.675312  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0182  hypothetical protein  33.69 
 
 		 382 aa  176  6e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3917  hypothetical protein  42.79 
 
 		 376 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843162  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0205  hypothetical protein  32.38 
 
 		 379 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1981  hypothetical protein  32.06 
 
 		 378 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0175  protein of unknown function DUF140  33.84 
 
 		 374 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0168  protein of unknown function DUF140  33.84 
 
 		 374 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.710497 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0373  ABC transporter, permease protein  32.63 
 
 		 404 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>