242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4665 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3597  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  66.5 
 
 		 617 aa  829    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.794644  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2877  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  67.84 
 
 		 601 aa  817    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0929363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2603  oligoendopeptidase  55.48 
 
 		 611 aa  664    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0093862 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2754  pepF/M3 family oligoendopeptidase  67.17 
 
 		 625 aa  825    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0081  oligoendopeptidase F  68.47 
 
 		 620 aa  857    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2576  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  68.66 
 
 		 620 aa  851    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.855226 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2070  pepF/M3 family oligoendopeptidase  70.92 
 
 		 634 aa  885    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.024965  normal  0.33011 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3148  pepF/M3 family oligoendopeptidase  67.05 
 
 		 616 aa  816    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629046 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2803  pepF/M3 family oligoendopeptidase  67.12 
 
 		 623 aa  807    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0993  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  83.5 
 
 		 625 aa  1073    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2412  oligoendopeptidase F  55.8 
 
 		 606 aa  662    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0632065  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2052  pepF/M3 family oligoendopeptidase  64.69 
 
 		 614 aa  778    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841739  hitchhiker  0.00000309933 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2192  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  53.4 
 
 		 597 aa  637    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246068  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1431  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  93.06 
 
 		 610 aa  1149    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.838587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3392  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  55.32 
 
 		 607 aa  679    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.935472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3974  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  85.11 
 
 		 626 aa  1121    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.221188  normal  0.896374 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1411  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  88.4 
 
 		 632 aa  1165    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.249086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1225  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  82.12 
 
 		 626 aa  1077    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100343  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0569  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  54.83 
 
 		 606 aa  659    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0425519  hitchhiker  0.00000722694 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2730  pepF/M3 family oligoendopeptidase  67.6 
 
 		 616 aa  840    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797581  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2981  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  66.34 
 
 		 625 aa  825    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.54197  normal  0.947222 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4665  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  100 
 
 		 638 aa  1309    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3296  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  65.65 
 
 		 617 aa  826    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1832  pepF/M3 family oligoendopeptidase  56.8 
 
 		 620 aa  672    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3702  oligoendopeptidase F  63.23 
 
 		 619 aa  812    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1075  pepF/M3 family oligoendopeptidase  55.63 
 
 		 606 aa  662    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1570  pepF/M3 family oligoendopeptidase  56.97 
 
 		 606 aa  672    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.713222  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1482  pepF/M3 family oligoendopeptidase  56.61 
 
 		 615 aa  649    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6862  putative oligoendopeptidase F  82.12 
 
 		 664 aa  1070    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916639  normal  0.20394 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0213  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  67.21 
 
 		 616 aa  837    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227297  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0076  oligoendopeptidase F  68.47 
 
 		 620 aa  858    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0370  pepF/M3 family oligoendopeptidase  68.05 
 
 		 622 aa  838    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2684  pepF/M3 family oligoendopeptidase  65.38 
 
 		 627 aa  832    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.667149 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4260  pepF/M3 family oligoendopeptidase  66.83 
 
 		 620 aa  856    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0329  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  54.44 
 
 		 615 aa  628  1e-178  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0882  pepF/M3 family oligoendopeptidase  45.04 
 
 		 608 aa  504  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83984  normal  0.332504 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0533  pepF/M3 family oligoendopeptidase  42.11 
 
 		 589 aa  447  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18439  normal  0.721981 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1896  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  42.66 
 
 		 601 aa  422  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4566  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  43.94 
 
 		 607 aa  414  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0554379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2299  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  39.13 
 
 		 598 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2674  oligoendopeptidase F, putative  39.13 
 
 		 598 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2169  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  37.58 
 
 		 601 aa  369  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1636  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  35.76 
 
 		 573 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0701  putative oligoendopeptidase F  34.52 
 
 		 571 aa  357  3.9999999999999996e-97  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1382  pepF/M3 family oligoendopeptidase  36.73 
 
 		 589 aa  352  8e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000209164  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1295  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  35.54 
 
 		 588 aa  348  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778267  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1242  oligoendopeptidase F  35.66 
 
 		 573 aa  347  4e-94  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.906065  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2988  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  35.71 
 
 		 588 aa  347  4e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.68469e-23 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0623  oligoendopeptidase F  36.02 
 
 		 573 aa  347  4e-94  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0719  oligoendopeptidase F, putative  34.91 
 
 		 569 aa  346  7e-94  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.954418  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1873  oligoendopeptidase F  36.39 
 
 		 596 aa  346  8.999999999999999e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.201769  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1117  oligoendopeptidase F  36.55 
 
 		 572 aa  344  2.9999999999999997e-93  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1105  peptidase  33.86 
 
 		 566 aa  343  5e-93  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1993  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  34.58 
 
 		 592 aa  340  4e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000167694  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0066  rhomboid family protein  34.36 
 
 		 573 aa  340  4e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.411672  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1295  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  37.07 
 
 		 612 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104369  hitchhiker  0.000569902 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2055  pepF/M3 family oligoendopeptidase  35.3 
 
 		 591 aa  337  5.999999999999999e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00862679  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1054  oligoendopeptidase F  33.16 
 
 		 573 aa  333  7.000000000000001e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34179  predicted protein  34.97 
 
 		 577 aa  317  4e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.137613  normal  0.109742 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2068  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  33.28 
 
 		 603 aa  308  1.0000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0884  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  29.66 
 
 		 578 aa  238  2e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000022902  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1694  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  27.32 
 
 		 584 aa  230  5e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1177  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.91 
 
 		 590 aa  230  7e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1212  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.9 
 
 		 586 aa  229  1e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0407734  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1817  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  27.56 
 
 		 597 aa  224  4.9999999999999996e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2647  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  29.82 
 
 		 584 aa  223  9e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00961781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1211  oligoendopeptidase pepF/M3 family  31.3 
 
 		 587 aa  199  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000802852  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0099  oligoendopeptidase F  27.95 
 
 		 619 aa  196  1e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.893555  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3298  pepF/M3 family oligoendopeptidase  25.05 
 
 		 582 aa  196  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2001  oligoendopeptidase F, putative  26.3 
 
 		 597 aa  194  3e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0875927  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1422  oligoendopeptidase F  28.83 
 
 		 596 aa  191  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0811423  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2626  oligoendopeptidase F  27.68 
 
 		 618 aa  185  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2457  oligoendopeptidase F  26.51 
 
 		 595 aa  182  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0101459  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08170  Oligoendopeptidase F  25.46 
 
 		 598 aa  181  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6864  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  26.09 
 
 		 612 aa  180  7e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.176327 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1167  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  30.05 
 
 		 593 aa  180  8e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1998  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.49 
 
 		 603 aa  178  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0738  oligoendopeptidase F  26.43 
 
 		 609 aa  177  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3050  oligoendopeptidase F  27.56 
 
 		 599 aa  177  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1169  oligoendopeptidase F  28.62 
 
 		 644 aa  177  8e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.325773 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0490  oligoendopeptidase F  25 
 
 		 603 aa  173  9e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3273  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.17 
 
 		 603 aa  173  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.474589 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0253  oligoendopeptidase F  25.65 
 
 		 590 aa  172  2e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0130  Oligopeptidase F  23.48 
 
 		 593 aa  171  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4682  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  25.3 
 
 		 606 aa  169  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2055  oligopeptidase F  29.22 
 
 		 646 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.443818  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2755  oligoendopeptidase F  27.32 
 
 		 606 aa  167  5.9999999999999996e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000210431  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2002  oligoendopeptidase F  27.31 
 
 		 594 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000655164  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1902  oligoendopeptidase F  32.07 
 
 		 649 aa  164  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1823  oligoendopeptidase F  32.23 
 
 		 654 aa  164  7e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1539  oligoendopeptidase F  25.99 
 
 		 622 aa  163  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003689  oligoendopeptidase F  24.67 
 
 		 598 aa  163  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02130  oligopeptidase  23.64 
 
 		 599 aa  162  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5579  putative oligoendopeptidase F  25.91 
 
 		 605 aa  162  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0757693  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2452  oligopeptidase F  26.05 
 
 		 602 aa  160  7e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0856  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  25.21 
 
 		 598 aa  160  8e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5250  oligoendopeptidase F  25.58 
 
 		 605 aa  159  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1255  oligoendopeptidase F  32.35 
 
 		 600 aa  158  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012526 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3699  oligoendopeptidase F  27.08 
 
 		 597 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0489  oligopeptidase  28.18 
 
 		 601 aa  157  5.0000000000000005e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>