More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4588 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 457 aa  941    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5773  Methyltransferase type 12  31.55 
 
 		 303 aa  97.1  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14071  hypothetical protein  27.32 
 
 		 354 aa  87.4  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0536684  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1243  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.01 
 
 		 329 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  33.11 
 
 		 330 aa  72.4  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1350  methyltransferase type 12  27.41 
 
 		 1046 aa  71.2  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.041094  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  26.79 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  27.93 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  31.79 
 
 		 214 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2170  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  28.5 
 
 		 303 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0560601  hitchhiker  0.0000129076 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.3 
 
 		 345 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  25.6 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  24.66 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5454  methyltransferase type 11  29.21 
 
 		 317 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.80361 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 194 aa  65.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2893  methyltransferase type 11  27.67 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3719  methyltransferase type 12  29.65 
 
 		 211 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000247431  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  29.45 
 
 		 1124 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3105  methyltransferase type 12  23.41 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  28.3 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  26.53 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  29.84 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2729  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4654  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.302301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3006  methyltransferase type 12  33.04 
 
 		 681 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.633739  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  30.52 
 
 		 308 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  32.73 
 
 		 746 aa  62  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3318  methyltransferase type 12  25.35 
 
 		 383 aa  61.6  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434757 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  28.66 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  26.42 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  26.67 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  31.09 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  25.69 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3452  methyltransferase type 11  25.15 
 
 		 231 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0773  methyltransferase type 12  30.28 
 
 		 281 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.876458  normal  0.677345 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  26.58 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  31.37 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  39.6 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1277  Methyltransferase type 11  24.74 
 
 		 572 aa  58.2  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0939  Methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2892  methyltransferase type 12  25 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  26.04 
 
 		 1340 aa  57.4  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  30.66 
 
 		 457 aa  57  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  26.98 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 		 1287 aa  57.4  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0617  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.85 
 
 		 232 aa  57  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.48837 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1349  methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 581 aa  56.6  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00108025  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0794  Methyltransferase type 12  26.71 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  26.39 
 
 		 305 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  27.17 
 
 		 672 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  27.07 
 
 		 336 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1690  methyltransferase type 11  25.7 
 
 		 235 aa  56.2  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  26.39 
 
 		 335 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.35 
 
 		 239 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  26.88 
 
 		 275 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 199 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  31.47 
 
 		 1106 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  26.77 
 
 		 310 aa  55.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4310  hypothetical protein  31.68 
 
 		 261 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 261 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  27.91 
 
 		 1162 aa  55.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.37 
 
 		 234 aa  55.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  32.58 
 
 		 1312 aa  55.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1321  methyltransferase type 12  26.51 
 
 		 396 aa  54.7  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.35 
 
 		 232 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2861  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.35 
 
 		 240 aa  54.7  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0308666  decreased coverage  0.000000000135895 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3397  methyltransferase, putative  24.04 
 
 		 407 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1490  hypothetical protein  30.17 
 
 		 302 aa  54.3  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  30.56 
 
 		 273 aa  54.7  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  32.67 
 
 		 285 aa  53.9  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  27.7 
 
 		 196 aa  53.9  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.17 
 
 		 262 aa  54.3  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  31.53 
 
 		 263 aa  53.9  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  25.31 
 
 		 267 aa  53.9  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.07 
 
 		 232 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 		 1314 aa  53.5  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  31.82 
 
 		 270 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1216  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 510 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.218616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 323 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0448  methyltransferase type 12  23.53 
 
 		 307 aa  53.1  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00834451  normal  0.0296348 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.7 
 
 		 205 aa  53.1  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 323 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  25.61 
 
 		 323 aa  53.1  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2592  methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 219 aa  53.1  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3375  methyltransferase  24.32 
 
 		 407 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2166  Methyltransferase type 12  24.52 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  24.56 
 
 		 303 aa  53.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3071  methyltransferase  24.04 
 
 		 407 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  26.53 
 
 		 353 aa  53.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.37 
 
 		 232 aa  53.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  29.7 
 
 		 274 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  26.53 
 
 		 353 aa  53.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  30.99 
 
 		 261 aa  52.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3401  methyltransferase  22.6 
 
 		 407 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2471  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.35 
 
 		 253 aa  53.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 266 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.48 
 
 		 258 aa  52.8  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  23.94 
 
 		 306 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 333 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  21.35 
 
 		 310 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>