278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4407 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4407  flagellar biosynthesis protein FliR  100 
 
 		 255 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605024  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  83.14 
 
 		 255 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1697  flagellar biosynthesis protein FliR  83.92 
 
 		 255 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.708349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5493  flagellar biosynthesis protein FliR  77.65 
 
 		 255 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  77.56 
 
 		 256 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1136  flagellar biosynthesis protein FliR  75 
 
 		 256 aa  381  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1396  flagellar biosynthesis protein FliR  77.17 
 
 		 256 aa  347  8e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401205  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2574  flagellar biosynthesis protein FliR  51.38 
 
 		 253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553295 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2231  flagellar biosynthetic protein FliR  45.38 
 
 		 253 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5534  flagellar biosynthetic protein FliR  47.11 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5151  flagellar biosynthetic protein FliR  46.34 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2827  flagellar biosynthetic protein FliR  46.89 
 
 		 258 aa  191  7e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24941  normal  0.254342 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2604  flagellar biosynthetic protein FliR  46.47 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  0.406904 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1931  flagellar biosynthetic protein FliR  40.85 
 
 		 250 aa  178  7e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.852325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2634  flagellar biosynthetic protein FliR  46.47 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1383  flagellar biosynthesis protein FliR  40.38 
 
 		 251 aa  162  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2822  flagellar biosynthesis protein FliR  34.44 
 
 		 253 aa  149  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104106  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  32.74 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  31.98 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  33.33 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  32.05 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  30.96 
 
 		 264 aa  122  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  30 
 
 		 261 aa  122  7e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0773  flagellar biosynthesis protein FliR  32.17 
 
 		 250 aa  119  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  34.22 
 
 		 261 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2980  type III secretion system inner membrane R protein  37.25 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1321  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  37.25 
 
 		 260 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  35.59 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3442  putative flagellar biosynthetic protein FliR  32.19 
 
 		 253 aa  115  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  35.56 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  32.51 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  32.62 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1119  flagellar biosynthesis protein FliR  30.1 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294704  normal  0.892593 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  35.86 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  30.08 
 
 		 261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  32.62 
 
 		 258 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  32.74 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  28.63 
 
 		 261 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2612  type III secretion system inner membrane R protein  37.25 
 
 		 258 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.151679 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  30 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  34.11 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4187  flagellar biosynthetic protein FliR  32.5 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  32.23 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  28.81 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2130  type III secretion system inner membrane R protein  33.06 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  30.9 
 
 		 265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  32.33 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  30.74 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  30.9 
 
 		 265 aa  109  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1159  flagellar biosynthesis protein FliR  30.74 
 
 		 265 aa  109  5e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  30.9 
 
 		 265 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0346  flagellar biosynthesis protein FliR  28.33 
 
 		 250 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233596  normal  0.715402 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  29.61 
 
 		 265 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  32.44 
 
 		 262 aa  107  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  30.9 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0378  flagellar biosynthesis protein FliR  28.76 
 
 		 250 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4185  flagellar biosynthesis protein FliR  32.5 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  29.26 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1131  flagellar biosynthesis protein FliR  32.46 
 
 		 255 aa  105  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.715022  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  29.63 
 
 		 265 aa  105  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1798  flagellar biosynthesis protein FliR  27.56 
 
 		 254 aa  105  5e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  30.71 
 
 		 255 aa  105  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000389137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  30 
 
 		 265 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  29.57 
 
 		 267 aa  105  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  30 
 
 		 265 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  30 
 
 		 265 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  32.75 
 
 		 258 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  28.33 
 
 		 260 aa  105  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0284  flagellar biosynthesis protein FliR  27.9 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3879  flagellar biosynthesis protein FliR  33.48 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  34.39 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  25.45 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1513  flagellar biosynthesis protein FliR  32.31 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859445  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  29.82 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1373  flagellar biosynthesis protein FliR  30.57 
 
 		 266 aa  103  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1258  flagellar biosynthesis protein FliR  29.39 
 
 		 253 aa  102  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0798452  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  31.86 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  30.34 
 
 		 261 aa  102  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4353  flagellar biosynthesis protein FliR  32.31 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  28.45 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0700656  normal  0.100777 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0691  flagellar biosynthesis protein FliR  28.45 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0302872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1091  flagellar biosynthesis protein FliR  30 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2924  flagellar biosynthetic protein FliR  29.63 
 
 		 259 aa  99.8  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0050  type III secretion system inner membrane R protein  26.92 
 
 		 249 aa  99.8  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  28.1 
 
 		 259 aa  99.4  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02875  flagellar biosynthesis protein FliR  28.57 
 
 		 259 aa  99.4  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  29.18 
 
 		 267 aa  99  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1036  flagellar biosynthesis protein FliR  33.33 
 
 		 239 aa  98.6  8e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308173  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0373  flagellar biosynthetic fliR transmembrane protein  28.38 
 
 		 262 aa  98.6  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  31.6 
 
 		 256 aa  98.6  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0665  flagellar biosynthesis protein FliR  28.02 
 
 		 256 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.840101  normal  0.246293 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3682  flagellar biosynthetic protein FliR  27.51 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0756404  normal  0.879793 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4759  flagellar biosynthetic protein FliR  27.51 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0696365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1675  flagellar biosynthesis protein FliR  27.15 
 
 		 260 aa  97.8  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  32.43 
 
 		 265 aa  97.1  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  29.24 
 
 		 260 aa  97.1  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  28.7 
 
 		 261 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1966  flagellar biosynthetic protein FliR  32.13 
 
 		 266 aa  97.1  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  33.79 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  28.92 
 
 		 260 aa  96.7  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>