More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4369 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4369  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 592 aa  1147    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3734  sodium/hydrogen exchanger  83.61 
 
 		 591 aa  919    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1572  sodium/hydrogen exchanger  73.65 
 
 		 591 aa  756    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.187931  decreased coverage  0.00050527 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1735  sodium/hydrogen exchanger  83.14 
 
 		 593 aa  908    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4634  sodium/hydrogen exchanger  46.89 
 
 		 630 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136405 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0254  sodium/hydrogen exchanger  48.27 
 
 		 595 aa  462  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.711555  normal  0.0321516 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5097  sodium/hydrogen exchanger  46.54 
 
 		 630 aa  463  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5173  sodium/hydrogen exchanger  46.72 
 
 		 632 aa  458  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5461  sodium/hydrogen exchanger  48.27 
 
 		 597 aa  456  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1943  sodium/hydrogen exchanger  46.06 
 
 		 629 aa  451  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409828  normal  0.0242024 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4668  sodium/hydrogen exchanger  46.82 
 
 		 594 aa  438  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0852287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1239  sodium/hydrogen exchanger  43.24 
 
 		 608 aa  429  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.333753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0802  sodium/hydrogen exchanger  44.85 
 
 		 583 aa  425  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1457  K+ efflux antiporter, putative (KEA1)  41.39 
 
 		 583 aa  390  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0395  potassium efflux system protein  45.84 
 
 		 577 aa  383  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1281  sodium/hydrogen exchanger  38.93 
 
 		 594 aa  373  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119428  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4566  sodium/hydrogen exchanger  44.11 
 
 		 578 aa  355  1e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.218526 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0454  sodium/hydrogen exchanger  37.67 
 
 		 594 aa  353  4e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.400108  normal  0.559822 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2280  sodium/hydrogen exchanger  43.26 
 
 		 590 aa  345  2e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1965  sodium/hydrogen exchanger  39.55 
 
 		 594 aa  342  2e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.507467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  37.95 
 
 		 661 aa  334  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235169 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  37.95 
 
 		 661 aa  334  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  36.54 
 
 		 650 aa  333  4e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2194  potassium efflux system protein  41.16 
 
 		 574 aa  332  1e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11843  predicted protein  39.01 
 
 		 533 aa  328  1.0000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  34.03 
 
 		 662 aa  325  1e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  34.91 
 
 		 652 aa  323  4e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  35.86 
 
 		 648 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  35.69 
 
 		 648 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  36.49 
 
 		 668 aa  317  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  36.13 
 
 		 648 aa  317  3e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  36.21 
 
 		 648 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  36.03 
 
 		 648 aa  317  5e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  34.9 
 
 		 649 aa  316  6e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  36.67 
 
 		 678 aa  316  7e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  36.49 
 
 		 668 aa  316  8e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  36.49 
 
 		 668 aa  316  8e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  36.49 
 
 		 668 aa  316  9e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1866  hypothetical protein  35.43 
 
 		 601 aa  316  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1861  hypothetical protein  35.33 
 
 		 601 aa  315  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2945  potassium efflux system protein  36.43 
 
 		 589 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  37.46 
 
 		 669 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0596  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  35.46 
 
 		 621 aa  314  3.9999999999999997e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1481  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  35.83 
 
 		 589 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  35.43 
 
 		 649 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2847  potassium efflux system protein  36.11 
 
 		 589 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.128131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  37.86 
 
 		 680 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  36.47 
 
 		 648 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  36.47 
 
 		 648 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  37.54 
 
 		 663 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2769  potassium efflux system protein  36.11 
 
 		 589 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000462118  normal  0.230816 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  35.27 
 
 		 648 aa  311  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1236  potassium efflux system protein  36.09 
 
 		 589 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  37.63 
 
 		 663 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  37.63 
 
 		 669 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  37.63 
 
 		 669 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  37.63 
 
 		 669 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  37.63 
 
 		 669 aa  310  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  37.63 
 
 		 669 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1314  potassium efflux system protein  35.83 
 
 		 589 aa  310  5e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.208859  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0300  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  38.11 
 
 		 596 aa  310  6.999999999999999e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2845  sodium/hydrogen exchanger  36.84 
 
 		 670 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0613147  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  36.86 
 
 		 667 aa  309  9e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4900  potassium efflux system protein  37.46 
 
 		 664 aa  309  9e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  37.3 
 
 		 648 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3552  potassium efflux system protein  34.57 
 
 		 620 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2703  sodium/hydrogen exchanger  36.67 
 
 		 670 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  35.92 
 
 		 649 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0049  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  35.11 
 
 		 620 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.709743 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0096  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  35.82 
 
 		 620 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.467251 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3608  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  34.57 
 
 		 620 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457228 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0089  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  35.82 
 
 		 620 aa  307  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  35.82 
 
 		 620 aa  307  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  35.82 
 
 		 620 aa  307  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.422534 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  34.57 
 
 		 620 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00050  hypothetical protein  34.57 
 
 		 620 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0095  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  35.82 
 
 		 620 aa  307  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0053  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  34.57 
 
 		 620 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  36.33 
 
 		 661 aa  307  4.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0041  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  34.57 
 
 		 620 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0716  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  35.22 
 
 		 617 aa  306  5.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.32849 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  35.92 
 
 		 660 aa  306  5.0000000000000004e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  34.57 
 
 		 620 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.903961  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  34.55 
 
 		 649 aa  306  6e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1729  glutathione-regulated K+ efflux antiporter  34.72 
 
 		 628 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.367731 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  36.86 
 
 		 666 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  34.93 
 
 		 620 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  35.75 
 
 		 660 aa  303  4.0000000000000003e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3407  potassium efflux system protein  35.49 
 
 		 624 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  36.69 
 
 		 667 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00068  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  38.38 
 
 		 598 aa  304  4.0000000000000003e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  38.73 
 
 		 658 aa  303  5.000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4109  sodium/hydrogen exchanger  36.94 
 
 		 661 aa  303  5.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324646  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2184  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  39.32 
 
 		 600 aa  303  5.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000842132  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1760  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.96 
 
 		 654 aa  303  7.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303253  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0554  potassium efflux system protein  37.19 
 
 		 624 aa  303  7.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00935447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4171  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.65 
 
 		 613 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3340  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  37.12 
 
 		 610 aa  302  9e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4703  potassium efflux system protein  38.32 
 
 		 638 aa  302  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829451  normal  0.614792 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3930  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  36.29 
 
 		 602 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.423778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>