183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4352 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_4352  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  544  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.174132  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3722  hypothetical protein  84.07 
 
 
273 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1745  hypothetical protein  81.78 
 
 
276 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2180  hypothetical protein  63.2 
 
 
271 aa  347  8e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0150751  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5017  putative methylisocitrate lyase or carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  58.58 
 
 
271 aa  325  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.467428 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4153  hypothetical protein  57.46 
 
 
274 aa  298  8e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.847864 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0568  hypothetical protein  56.72 
 
 
274 aa  293  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6009  hypothetical protein  53.85 
 
 
280 aa  279  4e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00237397 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1612  PEP phosphonomutase  56.13 
 
 
279 aa  277  1e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4222  hypothetical protein  57.2 
 
 
275 aa  276  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.333624  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0122  hypothetical protein  57.62 
 
 
276 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1688  PEP phosphonomutase  56.51 
 
 
279 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.251205  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7278  hypothetical protein  56.54 
 
 
280 aa  258  6e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00843163  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2263  PEP phosphonomutase  56.88 
 
 
279 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.978238  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3644  hypothetical protein  50.19 
 
 
276 aa  227  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.354902 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1325  hypothetical protein  49.26 
 
 
275 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4107  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  48.54 
 
 
276 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1510  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  47.45 
 
 
276 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.685837  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1389  hypothetical protein  50 
 
 
275 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000372272  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1074  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  47.21 
 
 
278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1372  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  48.51 
 
 
278 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.831005  normal  0.137367 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4212  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  47.08 
 
 
276 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.558651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1115  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  47.08 
 
 
276 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3650  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  46.97 
 
 
286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.822886  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1448  hypothetical protein  49.63 
 
 
279 aa  206  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8089  PEP phosphonomutase  48.13 
 
 
274 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5224  hypothetical protein  46.32 
 
 
278 aa  205  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0320197  normal  0.104885 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3694  PEP phosphonomutase  47.91 
 
 
286 aa  204  9e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329743  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2802  hypothetical protein  46.27 
 
 
278 aa  199  6e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317432  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4063  hypothetical protein  44.49 
 
 
267 aa  193  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.196405  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1600  hypothetical protein  41.91 
 
 
276 aa  191  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.768763  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4869  PEP phosphonomutase  48.47 
 
 
286 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21038  hitchhiker  0.00000793453 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2258  hypothetical protein  45.72 
 
 
276 aa  189  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1456  hypothetical protein  43.07 
 
 
274 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5368  PEP phosphonomutase  46.95 
 
 
286 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0658873  normal  0.17569 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3448  PEP phosphonomutase  46.95 
 
 
286 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.36236  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4919  PEP phosphonomutase  46.95 
 
 
286 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0062527  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4353  PEP phosphonomutase  48.85 
 
 
286 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16740  hypothetical protein  42.7 
 
 
274 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1626  hypothetical protein  42.65 
 
 
287 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298645  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3087  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  43.65 
 
 
278 aa  183  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439719  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0773  PEP phosphonomutase  46.95 
 
 
286 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314114  normal  0.0162406 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4820  PEP phosphonomutase  43.77 
 
 
275 aa  165  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2201  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  43.17 
 
 
281 aa  154  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00814551  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3894  hypothetical protein  43.98 
 
 
274 aa  153  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.077508  normal  0.524503 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1920  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein  41.95 
 
 
271 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181834 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2774  hypothetical protein  42.38 
 
 
276 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.167495 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2446  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  35.56 
 
 
284 aa  149  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.111219  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3098  PEP phosphonomutase  37.25 
 
 
288 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2296  hypothetical protein  38.91 
 
 
268 aa  138  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3620  hypothetical protein  36.43 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3525  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase  27.09 
 
 
274 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5270  hypothetical protein  27.49 
 
 
274 aa  129  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5112  hypothetical protein  33.96 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4524  hypothetical protein  30.97 
 
 
269 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.725558  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0706  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  38.1 
 
 
278 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2035  hypothetical protein  36.12 
 
 
255 aa  112  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0247047  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0856  hypothetical protein  32.97 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3070  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  29.82 
 
 
289 aa  105  9e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00410  PEP phosphonomutase-like enzyme  32.12 
 
 
286 aa  103  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0254511 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4021  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  31.85 
 
 
294 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1604  hypothetical protein  36.6 
 
 
289 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0067  putative PEP phosphonomutase protein  34.48 
 
 
256 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103814  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0084  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  31.95 
 
 
256 aa  99.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5113  PEP phosphonomutase  37.92 
 
 
253 aa  98.6  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0235  hypothetical protein  28.28 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12030  hypothetical protein  32.43 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0391  hypothetical protein  34.98 
 
 
253 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.935035  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3097  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  31.2 
 
 
274 aa  95.9  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000706406  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0220  hypothetical protein  31.62 
 
 
267 aa  95.5  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.231437 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2024  hypothetical protein  33.76 
 
 
274 aa  94  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0525538 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3283  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  34.32 
 
 
255 aa  93.2  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053  hypothetical protein  30.43 
 
 
282 aa  92.8  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2157  hypothetical protein  29.59 
 
 
265 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0074  hypothetical protein  32.79 
 
 
258 aa  92.4  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290223  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6199  PEP phosphonomutase-like protein  35.11 
 
 
425 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3328  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0256  hypothetical protein  34.53 
 
 
252 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0266  hypothetical protein  34.53 
 
 
252 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.235193 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0246  hypothetical protein  34.53 
 
 
252 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0044  hypothetical protein  30.97 
 
 
253 aa  90.1  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1593  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  32.84 
 
 
260 aa  89.4  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131647  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3426  hypothetical protein  30.4 
 
 
269 aa  88.6  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0163  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  29.79 
 
 
253 aa  88.2  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.643607  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2281  hypothetical protein  36.44 
 
 
253 aa  88.6  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0289  hypothetical protein  34.98 
 
 
252 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0410  hypothetical protein  37.23 
 
 
258 aa  87  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3483  hypothetical protein  30 
 
 
282 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2645  PEP phosphonomutase  37.17 
 
 
295 aa  86.7  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.327181 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0900  PEP phosphonomutase  32.32 
 
 
259 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3519  hypothetical protein  34.66 
 
 
249 aa  83.2  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.596575  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0552  PEP phosphonomutase and related enzyme-like protein  33.05 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.668619  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3606  hypothetical protein  29.17 
 
 
282 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.647928  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3408  hypothetical protein  29.87 
 
 
277 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3853  hypothetical protein  27.43 
 
 
266 aa  82  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1856  hypothetical protein  31.23 
 
 
259 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000480494 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4372  hypothetical protein  24.54 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  2.11441e-22 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5509  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  34.67 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0879  hypothetical protein  28.33 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4484  PEP phosphonomutase  37.08 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000284716  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2982  PEP phosphonomutase  32.16 
 
 
258 aa  77  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>