More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4333 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4333  ABC transporter related  100 
 
 		 246 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.175987  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3684  ABC transporter related  89.34 
 
 		 246 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1776  ABC transporter related  90.46 
 
 		 244 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1619  ABC transporter related  85.6 
 
 		 244 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.216284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5326  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  84.23 
 
 		 243 aa  410  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740565  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2614  ABC transporter related  82.23 
 
 		 247 aa  402  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796579  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2212  ABC transporter, ATPase subunit  82.43 
 
 		 247 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.618749 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3903  ABC transporter related  74.9 
 
 		 257 aa  350  8.999999999999999e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.784547  normal  0.979503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1743  ABC transporter related  70 
 
 		 258 aa  338  4e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5433  ABC transporter related  70.59 
 
 		 258 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3326  ABC transporter related  69.71 
 
 		 244 aa  333  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.262642  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2394  ABC transporter related  70.37 
 
 		 241 aa  332  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805678  normal  0.040758 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2252  ABC transporter related  69.04 
 
 		 265 aa  332  3e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.54606 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1115  ABC transporter related  68.03 
 
 		 248 aa  330  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000583905  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3512  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  66.8 
 
 		 243 aa  328  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151432  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1722  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  67.21 
 
 		 248 aa  328  6e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3325  ABC transporter related  66.95 
 
 		 247 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3069  ABC transporter related  66.8 
 
 		 247 aa  326  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.986829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2084  ABC transporter related  68.72 
 
 		 245 aa  323  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5393  ABC transporter related protein  69.17 
 
 		 294 aa  319  3e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.802054  normal  0.157485 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  66.11 
 
 		 240 aa  318  5e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0565  ABC transporter related  66.81 
 
 		 238 aa  313  9.999999999999999e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4655  ABC transporter related  59.83 
 
 		 238 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000808014  hitchhiker  0.00473023 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  59.75 
 
 		 233 aa  279  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  59.32 
 
 		 233 aa  279  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4863  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60 
 
 		 238 aa  278  6e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000477464  hitchhiker  0.0000052401 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4741  ABC transporter related  60 
 
 		 238 aa  278  6e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000344378  hitchhiker  0.000000131699 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  58.9 
 
 		 233 aa  278  7e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.92 
 
 		 233 aa  278  8e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  59.75 
 
 		 233 aa  277  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0601  ABC transporter  59 
 
 		 238 aa  276  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.190896  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0556  ABC transporter-like  60 
 
 		 238 aa  276  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000214193  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  58.9 
 
 		 233 aa  276  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  58.9 
 
 		 233 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  58.9 
 
 		 233 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  58.9 
 
 		 233 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  58.9 
 
 		 233 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.07 
 
 		 233 aa  275  6e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4919  ABC transporter related  59.58 
 
 		 238 aa  275  7e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000800081  decreased coverage  0.0000000000000903598 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4915  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.58 
 
 		 238 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  58.47 
 
 		 233 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  63.71 
 
 		 233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  58.47 
 
 		 233 aa  271  6e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0731  ABC transporter related  59.07 
 
 		 237 aa  270  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.05 
 
 		 233 aa  268  5e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  58.05 
 
 		 233 aa  268  5e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26090  ABC transporter, ATP-binding protein  59.17 
 
 		 238 aa  268  5.9999999999999995e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0561039  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2495  ABC transporter related  58.05 
 
 		 238 aa  267  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64860  ABC transporter ATP-binding protein  58.75 
 
 		 238 aa  267  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000027849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3199  ABC transporter-related protein  59.32 
 
 		 234 aa  267  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  57.26 
 
 		 238 aa  266  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3872  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  60.67 
 
 		 237 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0843862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3751  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  60.67 
 
 		 237 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3762  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  60.67 
 
 		 237 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3829  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  60.67 
 
 		 237 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.441456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3931  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  60.67 
 
 		 237 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  57.45 
 
 		 237 aa  263  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0490  ABC transporter related  61.6 
 
 		 244 aa  263  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0438645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  57.45 
 
 		 237 aa  263  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0102  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  61.18 
 
 		 233 aa  262  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0108  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  59.75 
 
 		 233 aa  262  4e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  60.17 
 
 		 233 aa  261  6e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03303  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  60.25 
 
 		 237 aa  261  8.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03256  hypothetical protein  60.25 
 
 		 237 aa  261  8.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5634  ABC transporter ATP-binding protein  57.74 
 
 		 238 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3735  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  60.25 
 
 		 237 aa  261  8.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4770  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  60.25 
 
 		 237 aa  261  8.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.355686 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0261  ABC transporter related protein  60.25 
 
 		 237 aa  260  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0262  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  60.25 
 
 		 237 aa  261  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3933  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  60.25 
 
 		 233 aa  260  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  60.25 
 
 		 241 aa  260  1e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3857  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  58.47 
 
 		 237 aa  260  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4055  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  59.32 
 
 		 233 aa  260  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4335  ABC transporter related  57.69 
 
 		 236 aa  260  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150909  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  55.56 
 
 		 235 aa  259  4e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3652  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  59.83 
 
 		 233 aa  257  9e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  58.12 
 
 		 238 aa  254  6e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3970  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  58.9 
 
 		 233 aa  254  9e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.394941  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3664  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  58.9 
 
 		 233 aa  254  9e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1383  ABC transporter related  60.17 
 
 		 233 aa  254  9e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.334561  normal  0.312332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0248  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  58.47 
 
 		 233 aa  253  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  55.56 
 
 		 239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  56.84 
 
 		 235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1137  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.49 
 
 		 233 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115394 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1171  ABC transporter related  59.49 
 
 		 233 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1154  ABC transporter related  59.49 
 
 		 233 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0140555 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4280  ABC transporter related  59.49 
 
 		 233 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1244  ABC transporter-like  59.07 
 
 		 233 aa  251  7e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  55.13 
 
 		 239 aa  251  7e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  57.69 
 
 		 235 aa  251  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  55 
 
 		 239 aa  250  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  54.39 
 
 		 237 aa  248  5e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  55.23 
 
 		 256 aa  246  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50560  branched-chain amino acid transport protein BraG  56.78 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0125838 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  54.81 
 
 		 237 aa  246  3e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  58.16 
 
 		 236 aa  246  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  55.7 
 
 		 236 aa  246  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  53.53 
 
 		 256 aa  246  3e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4307  branched-chain amino acid transport protein BraG  56.78 
 
 		 233 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3339  ABC transporter related  57.2 
 
 		 233 aa  246  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>