128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4323 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3675  VWA containing CoxE-like  91.11 
 
 		 405 aa  754    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1634  VWA containing CoxE-like  82.62 
 
 		 400 aa  657    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1785  VWA containing CoxE-like  92.44 
 
 		 414 aa  746    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23574  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4323  VWA containing CoxE family protein  100 
 
 		 405 aa  818    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5315  hypothetical protein  77.56 
 
 		 401 aa  633  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.333128 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2604  VWA containing CoxE-like  79.43 
 
 		 410 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2202  VWA containing CoxE-like  72.54 
 
 		 408 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1291  VWA containing CoxE-like  53.37 
 
 		 418 aa  396  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5446  VWA containing CoxE family protein  53.14 
 
 		 394 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.337348 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1753  VWA containing CoxE family protein  53 
 
 		 395 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.094345  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0472  VWA containing CoxE family protein  52.33 
 
 		 403 aa  375  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1484  VWA containing CoxE family protein  52.71 
 
 		 429 aa  358  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.0167248 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4713  VWA containing CoxE family protein  51.31 
 
 		 407 aa  348  1e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2958  VWA containing CoxE family protein  53 
 
 		 403 aa  337  2.9999999999999997e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.958684  hitchhiker  0.00204409 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0328  VWA containing CoxE family protein  47.96 
 
 		 398 aa  320  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1769  VWA containing CoxE-like  47.24 
 
 		 427 aa  319  6e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1932  hypothetical protein  47.45 
 
 		 398 aa  318  9e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0583  VWA containing CoxE family protein  47.19 
 
 		 398 aa  316  5e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0976244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0421  VWA containing CoxE-like  46.65 
 
 		 409 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24773  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2355  hypothetical protein  42.89 
 
 		 420 aa  300  3e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.624268 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4355  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  45.24 
 
 		 459 aa  296  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1414  VWA containing CoxE family protein  43.32 
 
 		 410 aa  296  5e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1350  VWA containing CoxE family protein  43.32 
 
 		 410 aa  295  7e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671625  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0969  VWA containing CoxE-like  46.27 
 
 		 421 aa  295  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285357  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0366  VWA containing CoxE family protein  44.47 
 
 		 460 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0361  VWA containing CoxE-like protein  44.13 
 
 		 428 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1760  VWA containing CoxE-like  43.61 
 
 		 419 aa  287  2.9999999999999996e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00982397  normal  0.464632 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2700  VWA containing CoxE family protein  41.65 
 
 		 404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.877474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2376  VWA containing CoxE family protein  46.97 
 
 		 393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.242837  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1465  hypothetical protein  43.56 
 
 		 410 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0091  VWA containing CoxE family protein  44.09 
 
 		 411 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2833  VWA containing CoxE family protein  42.33 
 
 		 405 aa  281  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1523  VWA containing CoxE family protein  39.3 
 
 		 389 aa  258  9e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2165  VWA containing CoxE family protein  39.49 
 
 		 401 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1453  VWA containing CoxE family protein  39.53 
 
 		 407 aa  240  4e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0115  VWA containing CoxE-like protein  38.06 
 
 		 380 aa  236  6e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2252  VWA containing CoxE family protein  38.76 
 
 		 424 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589481 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1141  VWA containing CoxE family protein  35.42 
 
 		 415 aa  228  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0574  VWA containing CoxE-like  38.02 
 
 		 394 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1597  VWA containing CoxE family protein  36.34 
 
 		 404 aa  222  9e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.795789  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4536  VWA containing CoxE family protein  37.76 
 
 		 414 aa  211  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4314  VWA containing CoxE family protein  36.6 
 
 		 364 aa  196  6e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0238  VWA containing CoxE family protein  35.26 
 
 		 375 aa  191  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2979  VWA containing CoxE family protein  35.64 
 
 		 379 aa  189  8e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000279133  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3974  VWA containing CoxE family protein  37.3 
 
 		 370 aa  187  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0702062  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2035  VWA containing CoxE family protein  34.9 
 
 		 415 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0522892  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13090  protein containing von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  34.13 
 
 		 395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3031  VWA containing CoxE family protein  35.92 
 
 		 404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  0.0122091 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4953  VWA containing CoxE family protein  32.72 
 
 		 379 aa  178  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1751  carbon monoxide dehydrogenase, coxE accessory protein  33.97 
 
 		 371 aa  176  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2844  VWA containing CoxE family protein  33.16 
 
 		 389 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800418  normal  0.0397253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6197  VWA containing CoxE family protein  35.38 
 
 		 385 aa  171  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.787747  normal  0.0617522 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1384  VWA containing CoxE family protein  32.26 
 
 		 398 aa  168  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0863864 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4107  VWA containing CoxE family protein  33.04 
 
 		 401 aa  159  7e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5290  VWA containing CoxE family protein  34.35 
 
 		 419 aa  158  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2769  VWA containing CoxE family protein  32.56 
 
 		 386 aa  156  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2093  VWA containing CoxE-like  29.63 
 
 		 393 aa  142  9e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1214  VWA containing CoxE family protein  30.65 
 
 		 392 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1566  VWA containing CoxE family protein  29.95 
 
 		 377 aa  124  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2149  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  28.68 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406985  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4806  hypothetical protein  31.46 
 
 		 372 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0034  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  28.03 
 
 		 400 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1566  VWA containing CoxE family protein  30.98 
 
 		 364 aa  117  5e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0211  VWA containing CoxE-like protein  29.73 
 
 		 414 aa  110  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10373  hypothetical protein  29.38 
 
 		 403 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0495  VWA containing CoxE-like protein  28.72 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0506  VWA containing CoxE family protein  28.72 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0484  VWA containing CoxE family protein  28.5 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.258737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1374  VWA containing CoxE family protein  26.55 
 
 		 401 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.400555 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4081  VWA containing CoxE family protein  24.65 
 
 		 444 aa  95.5  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000060057  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0103  VWA containing CoxE-like  23.18 
 
 		 456 aa  75.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2181  VWA containing CoxE family protein  23.89 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0718  VWA containing CoxE-like  30.48 
 
 		 460 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0807  VWA containing CoxE family protein  22.43 
 
 		 479 aa  69.7  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0395672 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0655  VWA containing CoxE family protein  26.51 
 
 		 462 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0813  VWA containing CoxE family protein  30.3 
 
 		 463 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1264  VWA containing CoxE family protein  23.53 
 
 		 492 aa  67.8  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2692  hypothetical protein  31.28 
 
 		 458 aa  67  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917977 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0535  VWA containing CoxE family protein  25.98 
 
 		 462 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0614  VWA containing CoxE-like  29.63 
 
 		 462 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.846272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0292  VWA containing CoxE family protein  27.38 
 
 		 455 aa  64.3  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.298693  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1956  VWA containing CoxE family protein  25.79 
 
 		 481 aa  64.3  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1230  VWA containing CoxE-like  28.33 
 
 		 482 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717442  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1583  VWA containing CoxE-like  26.48 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.503012 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0047  VWA containing CoxE family protein  24.29 
 
 		 460 aa  59.7  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3536  VWA containing CoxE-like protein  27.14 
 
 		 480 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3609  VWA containing CoxE family protein  27.14 
 
 		 480 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.521767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1645  VWA containing CoxE family protein  31.75 
 
 		 469 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127622  normal  0.403953 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3541  VWA containing CoxE family protein  27.14 
 
 		 480 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0826  VWA containing CoxE-like  25.89 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0518473  normal  0.175459 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3130  VWA containing CoxE family protein  24.88 
 
 		 482 aa  58.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1605  VWA containing CoxE family protein  30.81 
 
 		 484 aa  57.4  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0333325  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1513  VWA containing CoxE family protein  32.73 
 
 		 466 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0878716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3932  VWA containing CoxE family protein  29.17 
 
 		 478 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2646  VWA containing CoxE family protein  28.12 
 
 		 477 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5254  VWA containing CoxE family protein  28.22 
 
 		 475 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.697295  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7759  VWA containing CoxE family protein  24.83 
 
 		 456 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0779  VWA containing CoxE family protein  28.89 
 
 		 512 aa  54.3  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2809  VWA containing CoxE family protein  26.7 
 
 		 492 aa  54.3  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106976  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3195  VWA containing CoxE family protein  25.69 
 
 		 467 aa  53.5  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>