More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4311 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  100 
 
 		 317 aa  653    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1793  ABC transporter related  88.46 
 
 		 313 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000132087  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  87.95 
 
 		 311 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0718  ABC transporter related  83.23 
 
 		 314 aa  531  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226076  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5304  putative ABC transporter ATP-binding protein  81.43 
 
 		 311 aa  519  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  65.4 
 
 		 318 aa  420  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0457  ABC transporter related  68.92 
 
 		 331 aa  414  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0665642  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  63.19 
 
 		 326 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  62.91 
 
 		 326 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  62.17 
 
 		 323 aa  386  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  59.53 
 
 		 312 aa  382  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0349  ABC transporter-related protein  62.14 
 
 		 328 aa  381  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  61.59 
 
 		 316 aa  378  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  59.54 
 
 		 315 aa  378  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  59.2 
 
 		 309 aa  380  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  60.71 
 
 		 321 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0408  ABC transporter related  62.9 
 
 		 331 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  58.09 
 
 		 318 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  60.4 
 
 		 328 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0403  ABC transporter, ATP-binding protein  61.39 
 
 		 305 aa  369  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  60.73 
 
 		 322 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  59.87 
 
 		 323 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  59.87 
 
 		 323 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3130  ABC transporter component  62.37 
 
 		 316 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00961649  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  58.61 
 
 		 304 aa  355  6.999999999999999e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0699  ATPase  58.04 
 
 		 354 aa  351  8.999999999999999e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1341  ABC transporter related  56.91 
 
 		 317 aa  347  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5056  ABC transporter related  60 
 
 		 302 aa  346  3e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0505  ABC transporter related  55.45 
 
 		 308 aa  325  7e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509772  normal  0.852772 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  57.56 
 
 		 691 aa  310  2e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0738  hypothetical protein  43.58 
 
 		 308 aa  281  1e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0719  hypothetical protein  42.57 
 
 		 308 aa  276  3e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  49.34 
 
 		 315 aa  268  8e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  46.77 
 
 		 346 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  46.45 
 
 		 346 aa  263  4e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  47.65 
 
 		 346 aa  260  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  47.7 
 
 		 314 aa  259  6e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  47.16 
 
 		 318 aa  257  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  46.82 
 
 		 318 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  46.82 
 
 		 318 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  46.82 
 
 		 318 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  47.87 
 
 		 319 aa  256  3e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  44.37 
 
 		 335 aa  255  8e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  48.18 
 
 		 325 aa  253  3e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  47.08 
 
 		 322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  44.41 
 
 		 307 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  48.7 
 
 		 340 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  45.27 
 
 		 317 aa  250  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  46.56 
 
 		 316 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45 
 
 		 322 aa  246  4e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  43.23 
 
 		 313 aa  245  9e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  41.91 
 
 		 322 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  43.83 
 
 		 324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  43.91 
 
 		 320 aa  241  9e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  46.56 
 
 		 333 aa  241  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  45.91 
 
 		 350 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  40.45 
 
 		 319 aa  238  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  44.77 
 
 		 309 aa  238  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  43.51 
 
 		 314 aa  237  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  41.03 
 
 		 327 aa  236  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  38.96 
 
 		 308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  44.74 
 
 		 312 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  40.26 
 
 		 319 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  51.97 
 
 		 512 aa  233  5e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  39.87 
 
 		 323 aa  232  6e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  41.97 
 
 		 323 aa  230  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0115  ABC transporter related  39.4 
 
 		 301 aa  229  4e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  43.73 
 
 		 308 aa  228  8e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  49.54 
 
 		 255 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  39.53 
 
 		 308 aa  226  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  40.07 
 
 		 308 aa  226  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  51.11 
 
 		 510 aa  225  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1763  ABC transporter related  43.28 
 
 		 311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.612212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  41.1 
 
 		 312 aa  216  4e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  41.95 
 
 		 291 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2106  ABC transporter related  41.67 
 
 		 311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  45.02 
 
 		 248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  48.9 
 
 		 582 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  44.86 
 
 		 270 aa  213  3.9999999999999995e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  48 
 
 		 576 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  48.42 
 
 		 585 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  47.64 
 
 		 581 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  49.77 
 
 		 1171 aa  210  3e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3070  ABC transporter related protein  39.8 
 
 		 307 aa  209  4e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127936  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2447  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  41.04 
 
 		 305 aa  209  6e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.436893  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1108  ABC transporter related  48.13 
 
 		 255 aa  209  6e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.298542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  47.32 
 
 		 594 aa  208  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  44.86 
 
 		 247 aa  206  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  42.62 
 
 		 322 aa  206  6e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  44.7 
 
 		 580 aa  205  9e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  48.64 
 
 		 593 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  43.83 
 
 		 314 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  42.72 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1045  ABC transporter related  38.05 
 
 		 311 aa  203  2e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 		 580 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1901  ABC transporter related  42.21 
 
 		 323 aa  203  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.298526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  42.11 
 
 		 580 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  45.29 
 
 		 667 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  42.98 
 
 		 582 aa  202  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  48.84 
 
 		 580 aa  202  4e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>