45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4293 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4293  PGAP1 family protein  100 
 
 		 263 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000482527  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1818  hypothetical protein  79.92 
 
 		 262 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.100365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3646  hypothetical protein  79.05 
 
 		 265 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1654  hypothetical protein  73.09 
 
 		 262 aa  351  8e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.876458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2302  hypothetical protein  55.04 
 
 		 282 aa  235  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00342801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1705  hypothetical protein  53.97 
 
 		 284 aa  228  8e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4797  hypothetical protein  52.51 
 
 		 257 aa  225  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1474  hypothetical protein  49.6 
 
 		 265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3470  PGAP1 family protein  49.57 
 
 		 264 aa  208  8e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595037  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3553  PGAP1 family protein  44.14 
 
 		 259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11216  hypothetical protein  49.33 
 
 		 275 aa  194  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2469  hypothetical protein  45.49 
 
 		 248 aa  185  6e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505624  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1301  hypothetical protein  44.73 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130537  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1764  hypothetical protein  47.34 
 
 		 284 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.560768  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2778  hypothetical protein  33.76 
 
 		 269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0282  hypothetical protein  34.33 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0784  PGAP1 family protein  35.75 
 
 		 269 aa  96.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.174438  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1065  PGAP1 family protein  32 
 
 		 281 aa  93.2  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0349  hypothetical protein  36.21 
 
 		 264 aa  92.4  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16990  PGAP1-like protein  31.1 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  31.12 
 
 		 298 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  27.23 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  30.17 
 
 		 338 aa  49.3  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  30.56 
 
 		 342 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0275  Alpha/beta hydrolase fold  32.56 
 
 		 414 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  29.1 
 
 		 338 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 		 284 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3210  alpha/beta hydrolase fold protein  35.92 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.45774  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0200  alpha/beta hydrolase fold protein  34 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  28.75 
 
 		 303 aa  43.5  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0111  alpha/beta hydrolase fold  43.48 
 
 		 287 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1076  PGAP1 family protein  34.48 
 
 		 211 aa  43.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  33.65 
 
 		 270 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1109  alpha/beta hydrolase fold  34.95 
 
 		 248 aa  43.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00126644  hitchhiker  0.00394602 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  28.57 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  35.24 
 
 		 269 aa  43.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  30.13 
 
 		 361 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  28.75 
 
 		 303 aa  42.4  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  23.36 
 
 		 267 aa  42.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 263 aa  42  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  35.35 
 
 		 278 aa  42.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  31.19 
 
 		 367 aa  42  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  31.19 
 
 		 367 aa  42  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  31.19 
 
 		 367 aa  42  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  31.19 
 
 		 367 aa  42  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>