50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4099 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4099  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 		 132 aa  273  4e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000310906  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5476  hypothetical protein  66.41 
 
 		 128 aa  187  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.880512  normal  0.34526 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4135  protein of unknown function DUF1486  62.31 
 
 		 134 aa  183  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0561  hypothetical protein  61.83 
 
 		 134 aa  183  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0475  hypothetical protein  62.5 
 
 		 130 aa  174  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.882422  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1364  hypothetical protein  65.85 
 
 		 127 aa  173  8e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0619  hypothetical protein  60.94 
 
 		 128 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6920  hypothetical protein  60.94 
 
 		 128 aa  165  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2712  protein of unknown function DUF1486  58.59 
 
 		 138 aa  165  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4491  hypothetical protein  60.94 
 
 		 128 aa  164  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4033  hypothetical protein  60.94 
 
 		 128 aa  164  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.243937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3766  hypothetical protein  59.38 
 
 		 128 aa  160  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4602  hypothetical protein  59.38 
 
 		 128 aa  160  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170557  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5702  hypothetical protein  59.38 
 
 		 128 aa  160  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161292 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4044  hypothetical protein  59.38 
 
 		 151 aa  158  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.541602 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3939  hypothetical protein  59.38 
 
 		 135 aa  158  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46310  hypothetical protein  61.16 
 
 		 135 aa  151  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0677929  normal  0.0352526 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4437  hypothetical protein  56.1 
 
 		 126 aa  150  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.195339  normal  0.857866 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1364  hypothetical protein  55.65 
 
 		 138 aa  149  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646938  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4630  protein of unknown function DUF1486  54.47 
 
 		 126 aa  147  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1135  hypothetical protein  53.85 
 
 		 136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4171  hypothetical protein  51.91 
 
 		 286 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4095  hypothetical protein  51.91 
 
 		 286 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4326  hypothetical protein  51.91 
 
 		 286 aa  138  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0121723  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2254  protein of unknown function DUF1486  50 
 
 		 134 aa  138  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4646  protein of unknown function DUF1486  44.54 
 
 		 134 aa  120  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.701678  normal  0.971312 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  34.21 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  30.43 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0339  protein of unknown function DUF1486  26.72 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  32.61 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  29.1 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  27.2 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3831  hypothetical protein  31.25 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709956  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0819  hypothetical protein  33.73 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0659  protein of unknown function DUF1486  26.6 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0498  hypothetical protein  26.6 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0035037  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3219  protein of unknown function DUF1486  33.04 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247367  hitchhiker  0.000405951 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36501  predicted protein  24 
 
 		 284 aa  46.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260623  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  28.69 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2953  ester cyclase-like  22.05 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4925  hypothetical protein  23.02 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1710  hypothetical protein  29.55 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.518536  normal  0.0462427 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4914  hypothetical protein  22.22 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  26.32 
 
 		 138 aa  41.2  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4651  hypothetical protein  29.49 
 
 		 186 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1261  protein of unknown function DUF1486  32.91 
 
 		 182 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00537261  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1447  hypothetical protein  33.78 
 
 		 185 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0560331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  23.91 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6186  protein of unknown function DUF1486  26.92 
 
 		 146 aa  40  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6742  protein of unknown function DUF1486  29.27 
 
 		 144 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>