More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4080 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  100 
 
 		 283 aa  567  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  83.52 
 
 		 276 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  79.86 
 
 		 271 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1201  arsenite S-adenosylmethyltransferase  56.52 
 
 		 270 aa  296  3e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  54.07 
 
 		 265 aa  255  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0104  Methyltransferase type 11  57.68 
 
 		 260 aa  231  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0499  Methyltransferase type 11  51.3 
 
 		 264 aa  221  8e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000709402  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  50.18 
 
 		 246 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  52.08 
 
 		 276 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3346  Methyltransferase type 11  54.77 
 
 		 265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.408224  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0110  methyltransferase type 11  46.74 
 
 		 274 aa  217  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  50 
 
 		 262 aa  215  7e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3743  methyltransferase type 11  53.23 
 
 		 267 aa  215  7e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1224  methyltransferase type 11  48.91 
 
 		 282 aa  215  8e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.158383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  45.32 
 
 		 272 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  46.32 
 
 		 266 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0591  Methyltransferase type 11  54.69 
 
 		 263 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.812194 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3376  Methyltransferase type 11  54.85 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0407493  hitchhiker  0.00438973 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  48.12 
 
 		 279 aa  205  6e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  43.53 
 
 		 268 aa  203  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  48.51 
 
 		 263 aa  201  8e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  60.45 
 
 		 355 aa  199  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  51.12 
 
 		 273 aa  199  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  44.53 
 
 		 265 aa  199  5e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3423  Methyltransferase type 11  60.45 
 
 		 241 aa  198  7.999999999999999e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.101773 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  47.64 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  50 
 
 		 237 aa  196  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  45.45 
 
 		 277 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  45.06 
 
 		 280 aa  193  3e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  47.13 
 
 		 288 aa  192  5e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  39.58 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  42.28 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  39.58 
 
 		 280 aa  186  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  42.15 
 
 		 298 aa  185  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  44.49 
 
 		 267 aa  185  9e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  56.88 
 
 		 248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1926  Methyltransferase type 11  42.65 
 
 		 281 aa  182  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04625  arsenic methyltransferase Cyt19, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G15020)  51.58 
 
 		 282 aa  179  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1514  arsenite S-adenosylmethyltransferase  37.3 
 
 		 280 aa  178  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.732855  normal  0.394631 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2791  arsenite S-adenosylmethyltransferase  39.78 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  48.9 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  40.17 
 
 		 1014 aa  159  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2645  methyltransferase type 11  48.02 
 
 		 262 aa  158  9e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1710  methyltransferase type 11  44.15 
 
 		 262 aa  156  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00700  conserved hypothetical protein  47.27 
 
 		 239 aa  149  4e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1027  Methyltransferase type 11  40.61 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 1000 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0411  hypothetical protein  37.98 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0624483  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0923  Methyltransferase type 11  44.94 
 
 		 1039 aa  144  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804895  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1196  Methyltransferase type 11  40.8 
 
 		 259 aa  143  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1636  methyltransferase type 11  41.49 
 
 		 261 aa  142  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.431948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1418  methyltransferase type 11  36.8 
 
 		 379 aa  142  7e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.685062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04771  putative methyltransferase  37.6 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  37.79 
 
 		 1002 aa  140  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  39.78 
 
 		 1005 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0586  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.93 
 
 		 346 aa  138  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  37.62 
 
 		 209 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3308  methyltransferase type 11  45.51 
 
 		 239 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.358181  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08531  putative methyltransferase  38.91 
 
 		 267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04351  putative methyltransferase  36.05 
 
 		 264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04661  putative methyltransferase  36.05 
 
 		 264 aa  136  4e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2358  methyltransferase type 11  44.51 
 
 		 216 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.53267  normal  0.0101141 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4114  Methyltransferase type 11  33.1 
 
 		 365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.199074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3171  methyltransferase type 11  46.5 
 
 		 204 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3113  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 350 aa  133  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00520497  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04141  putative methyltransferase  38.5 
 
 		 241 aa  133  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4075  Methyltransferase type 11  33.1 
 
 		 365 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1156  methyltransferase  40.18 
 
 		 355 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3607  Methyltransferase type 11  33.21 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.289928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0301  methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 380 aa  130  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1984  methyltransferase-like  37.8 
 
 		 270 aa  130  3e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1612  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.37 
 
 		 356 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2227  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 396 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372982 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39627  predicted protein  37.27 
 
 		 410 aa  127  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  40.11 
 
 		 409 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3557  Methyltransferase type 11  40.95 
 
 		 369 aa  126  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0896  Methyltransferase type 11  40.17 
 
 		 350 aa  126  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1991  methyltransferase type 11  31.93 
 
 		 411 aa  126  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0677  methyltransferase-like  34.85 
 
 		 266 aa  125  7e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1914  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28006  predicted protein  44.44 
 
 		 418 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.122244 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_25654  predicted protein  41.95 
 
 		 200 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3620  hypothetical protein  39.13 
 
 		 346 aa  112  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.615774  normal  0.159076 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1715  Methyltransferase type 11  36.26 
 
 		 411 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2318  methyltransferase type 11  36.86 
 
 		 349 aa  110  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399773  normal  0.0108051 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2550  methyltransferase type 11  39.67 
 
 		 348 aa  105  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00904798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3797  hypothetical protein  34.52 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0388  type 11 methyltransferase  33.17 
 
 		 322 aa  104  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05015  hypothetical protein  28.91 
 
 		 322 aa  101  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  44.44 
 
 		 415 aa  89.4  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  38.71 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  38.65 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  34.15 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.8 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.33 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4641  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.76 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00562  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  44.86 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4305  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.9 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4357  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.9 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4057  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.9 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>