71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3954 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3954  dehydratase  100 
 
 		 293 aa  591  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21274  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2103  hypothetical protein  70.07 
 
 		 294 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0785743  normal  0.016568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3316  hypothetical protein  68.38 
 
 		 297 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38940  acyl dehydratase  29.32 
 
 		 286 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.234343 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0140  dehydratase  30.26 
 
 		 297 aa  93.6  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0308  MaoC domain protein dehydratase  30.26 
 
 		 284 aa  90.5  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188637  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1760  MaoC domain protein dehydratase  30.16 
 
 		 284 aa  85.9  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2939  MaoC domain protein dehydratase  27.67 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2849  dehydratase  28 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2189  MaoC-like dehydratase  32.37 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1893  MaoC domain protein dehydratase  29.49 
 
 		 335 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109024 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3115  MaoC domain protein dehydratase  31.41 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21230  acyl dehydratase  28.99 
 
 		 335 aa  79.7  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0146  dehydratase  27.48 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861571  decreased coverage  0.0000240434 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0611  dehydratase  24.29 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000129975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0625  dehydratase  28.35 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406567 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2146  dehydratase  28.24 
 
 		 307 aa  75.9  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6974  MaoC domain protein dehydratase  27.56 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3017  MaoC domain-containing protein dehydratase  27.96 
 
 		 285 aa  75.5  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176864  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11740  MaoC-like protein  24.8 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0694748  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4455  MaoC domain protein dehydratase  28.28 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00945579  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0742  dehydratase  27.46 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.780848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0430  MaoC domain protein dehydratase  24.41 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1689  MaoC domain protein dehydratase  28.51 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0315419  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0619  dehydratase  28.96 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0197  MaoC domain protein dehydratase  25.11 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3932  dehydratase  25 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.212138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4026  MaoC domain protein dehydratase  27.05 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139302  normal  0.123863 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4341  dehydratase  22.27 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.18708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2077  dehydratase  26.2 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0518  dehydratase  25 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177397  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3750  MaoC domain protein dehydratase  25 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0600605  normal  0.381685 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0441  dehydratase  24.32 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000513118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3721  dehydratase  23.18 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000101981  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0580  MaoC domain-containing protein  28.19 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3806  dehydratase  24.55 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000417553  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1258  dehydratase  26.24 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196595  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2380  MaoC domain protein dehydratase  23.46 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.087809 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1388  dehydratase  22.57 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000424588  unclonable  0.000000000439784 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0524  MaoC-like dehydratase  23.18 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000449112  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3157  MaoC-like dehydratase  25.75 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00547969  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0654  MaoC-like dehydratase  27.15 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23460  acyl dehydratase  26.83 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.260821  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34970  acyl dehydratase  27.23 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3522  dehydratase  23.18 
 
 		 288 aa  67  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3587  MaoC domain protein dehydratase  29.3 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0643  MaoC-like dehydratase  27.18 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4584  dehydratase  28.08 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03008  MaoC domain protein dehydratase  23.15 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104203  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0249  dehydratase  23.48 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0229  dehydratase  23.48 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200402  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0239  MaoC-like dehydratase  23.48 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0742  MaoC-like domain protein  26.34 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81902  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3471  dehydratase  22.53 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0559  dehydratase  22.53 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3315  dehydratase  23.32 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000241426  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10244  hypothetical protein  24.69 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0093701  normal  0.943124 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1308  hypothetical protein  23.56 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000275009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0558  dehydratase  22.73 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.742818  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0559  MaoC domain-containing protein  22.92 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3148  MaoC domain-containing protein  21.91 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1070  MaoC-like dehydratase  22.52 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000325805  normal  0.560447 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0413  dehydratase  24.19 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0697277 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0415  MaoC domain protein dehydratase  27.1 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0258  dehydratase  24.77 
 
 		 284 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115215 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5510  hypothetical protein  26.94 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63290  hypothetical protein  26.67 
 
 		 285 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.230888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2776  putative (R)-specific enoyl-CoA hydratase, MaoC- like  23.47 
 
 		 311 aa  52.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.272996  normal  0.286691 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1674  MaoC domain protein dehydratase  26.29 
 
 		 314 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394438 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0426  MaoC domain protein dehydratase  25.99 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.252327  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1702  dehydratase  32.26 
 
 		 305 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00665806  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>