More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3882 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3882  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 210 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  70.87 
 
 		 216 aa  285  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.86361 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  68.1 
 
 		 214 aa  280  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  67.63 
 
 		 213 aa  279  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0914  transcriptional regulatory protein  65.87 
 
 		 210 aa  270  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626019  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 210 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  63.33 
 
 		 210 aa  267  7e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444335 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4758  TetR family transcriptional regulator  63.77 
 
 		 210 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.939945 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  64.73 
 
 		 225 aa  265  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4689  TetR family transcriptional regulator  68.16 
 
 		 243 aa  263  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5445  TetR family transcriptional regulator  63.77 
 
 		 225 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5417  TetR family transcriptional regulator  63.77 
 
 		 225 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.618934  decreased coverage  0.00324744 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  66.18 
 
 		 210 aa  262  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4852  TetR family transcriptional regulator  63.29 
 
 		 225 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4856  TetR family transcriptional regulator  68.6 
 
 		 219 aa  252  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3393  TetR family transcriptional regulator  56.73 
 
 		 263 aa  221  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158575  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  58.45 
 
 		 218 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  36.5 
 
 		 209 aa  91.7  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 74 aa  85.1  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  61.9 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  50.65 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  51.39 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1272  transcriptional regulator, TetR family  43.81 
 
 		 176 aa  72  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  58.06 
 
 		 203 aa  72  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  58.06 
 
 		 203 aa  72  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5515  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2408  transcriptional regulator, TetR family  47.83 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5134  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5223  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  57.41 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  40.7 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3465  TetR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6881  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0734971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2968  TetR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.85525 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5773  transcriptional regulator TetR family  46.15 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  30.48 
 
 		 216 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  48.53 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1551  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6278  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7032  transcriptional regulator TetR family  40.62 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3251  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.831278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  50.85 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6770  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  43.1 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  30.72 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  43.75 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4953  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281079  normal  0.71404 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_1892  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000800916  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 190 aa  54.7  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_1704  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 285 aa  53.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0517004  n/a   
 
 
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NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  40.23 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 236 aa  52.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
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NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013161  Cyan8802_0857  transcriptional regulator, TetR family  45.71 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.999415 
 
 
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NC_011726  PCC8801_0829  transcriptional regulator, TetR family  45.71 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 218 aa  52.4  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
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NC_008347  Mmar10_1981  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 217 aa  52.4  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.992174  normal  1 
 
 
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NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 234 aa  52  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
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NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 197 aa  51.6  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_2679  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196743  normal  1 
 
 
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NC_011884  Cyan7425_1901  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal  1 
 
 
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NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
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NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
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NC_009943  Dole_1323  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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