218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3771 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  100 
 
 		 378 aa  740    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  37.64 
 
 		 342 aa  156  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4681  acyltransferase 3  35.03 
 
 		 356 aa  149  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  35.88 
 
 		 354 aa  146  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  35.42 
 
 		 367 aa  144  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  33.04 
 
 		 339 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1528  acyltransferase 3  35.18 
 
 		 363 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.469566 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2102  acyltransferase 3  33.69 
 
 		 382 aa  138  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188806  normal  0.600649 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3379  acyltransferase 3  33.25 
 
 		 354 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765152  normal  0.118052 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1766  acyltransferase 3  33.79 
 
 		 366 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  32.73 
 
 		 338 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  30.77 
 
 		 367 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1886  acyltransferase 3  32.63 
 
 		 355 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1653  putative exopolysaccharide production protein ExoZ  31.55 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.463034  normal  0.0385271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  30.68 
 
 		 359 aa  123  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  31.65 
 
 		 342 aa  123  6e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4943  acyltransferase 3  35.04 
 
 		 335 aa  123  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.306637 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3881  acyltransferase 3  32.22 
 
 		 356 aa  121  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645656  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6786  acyltransferase 3  31.18 
 
 		 354 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0759  acyltransferase 3  34.92 
 
 		 336 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.083154  normal  0.109469 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  33.52 
 
 		 340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2734  acetyltransferase family protein  32.21 
 
 		 340 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  32.31 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2871  acyltransferase 3  32.14 
 
 		 351 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  32.01 
 
 		 360 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6862  acyltransferase 3  29.86 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  33.99 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1051  putative acyltransferase, putative membrane protein  32.17 
 
 		 391 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1270  acyltransferase 3  29.38 
 
 		 348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2291  acyltransferase 3  34.13 
 
 		 382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0403995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0913  acyltransferase 3  33.12 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1984  acyltransferase 3  33.79 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  30.24 
 
 		 353 aa  106  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3318  acyltransferase 3  33.15 
 
 		 344 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862368 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2377  acyltransferase 3  32.41 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.623012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1890  acyltransferase 3  33.24 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3179  acyltransferase 3  30.28 
 
 		 362 aa  104  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488055  decreased coverage  0.000870466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3333  acyltransferase 3  30.52 
 
 		 346 aa  102  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2281  acyltransferase 3  31.05 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2694  acyltransferase 3  35.11 
 
 		 327 aa  100  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1080  putative acyltransferase, putative membrane protein  31.02 
 
 		 364 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  28.91 
 
 		 354 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1683  acyltransferase 3  30.11 
 
 		 357 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.610394 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4275  acyltransferase 3  30.28 
 
 		 379 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.271112  hitchhiker  0.000000000988837 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  32.38 
 
 		 354 aa  95.9  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0183  acyltransferase 3  33.99 
 
 		 362 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.585084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  31.94 
 
 		 368 aa  92.8  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1379  putative acyltransferase transmembrane protein  29.9 
 
 		 374 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3629  acyltransferase 3  27.65 
 
 		 309 aa  91.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00464208  normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  29.85 
 
 		 383 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1166  acyltransferase 3  33.07 
 
 		 357 aa  89  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  31.17 
 
 		 395 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  31.17 
 
 		 395 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0833  acyltransferase 3  33.95 
 
 		 337 aa  86.7  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  27.84 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2119  acyltransferase 3  29.32 
 
 		 356 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0270936  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_003296  RS03732  putative acyltransferase transmembrane protein  31.15 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.477787  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0996  hypothetical protein  31.44 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0376747  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2335  exopolysaccharide production protein ExoZ, putative  29.67 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7246  acyltransferase  28.28 
 
 		 354 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0488  acyltransferase 3  38.82 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0297786  hitchhiker  0.00634173 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2826  acyltransferase 3  31.43 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  26.85 
 
 		 353 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  28.75 
 
 		 382 aa  64.3  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1134  acyltransferase 3  30.73 
 
 		 391 aa  62.8  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5590  acyltransferase 3  28.14 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0727  acyltransferase-like protein  31.85 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3191  acyltransferase 3  30.94 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.300481  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5770  acyltransferase 3  31.32 
 
 		 394 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  27.91 
 
 		 639 aa  58.9  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  27.42 
 
 		 675 aa  58.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5194  acyltransferase 3  26.45 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1872  acyltransferase 3  25.88 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.341977  normal  0.27235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8167  acyltransferase 3  29.26 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5495  acyltransferase 3  27.94 
 
 		 587 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126637  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2796  acyltransferase 3  28.28 
 
 		 393 aa  56.2  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562541  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2658  cyclic nucleotide-binding protein  23.22 
 
 		 348 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5890  acyltransferase 3  35.37 
 
 		 384 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.12724 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3459  acyltransferase 3  31.85 
 
 		 420 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2626  acyltransferase 3  31.36 
 
 		 358 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.571513 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0673  acyltransferase 3  24.2 
 
 		 354 aa  54.3  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3578  acyltransferase 3  26.11 
 
 		 378 aa  53.9  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  28.68 
 
 		 658 aa  53.9  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3345  hypothetical protein  26.82 
 
 		 363 aa  53.9  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0212  acyltransferase 3  33.73 
 
 		 403 aa  54.3  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2300  acyltransferase 3  24.87 
 
 		 372 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3862  acyltransferase 3  33.92 
 
 		 374 aa  53.1  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.419554 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0897  acyltransferase family protein  29.01 
 
 		 352 aa  53.1  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000451682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5160  acyltransferase 3  26.42 
 
 		 378 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0781  acyltransferase 3  28.43 
 
 		 397 aa  53.1  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  27.76 
 
 		 658 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4745  acyltransferase 3  24.04 
 
 		 398 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0151092  normal  0.0124888 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0298  acyltransferase 3  25.18 
 
 		 603 aa  51.6  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.613325  normal  0.199243 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4138  acyltransferase 3  31.11 
 
 		 379 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  31.98 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4789  acyltransferase 3  31.11 
 
 		 379 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  23.99 
 
 		 616 aa  51.6  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3378  acyltransferase 3  31.11 
 
 		 379 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00401  acyltransferase  29.1 
 
 		 696 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0194  acyltransferase 3  30.85 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>