More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3679 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0269  heavy metal translocating P-type ATPase  59.89 
 
 
713 aa  790  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3467  heavy metal translocating P-type ATPase  70.67 
 
 
634 aa  823  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1096  heavy metal translocating P-type ATPase  54.95 
 
 
731 aa  685  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1627  heavy metal translocating P-type ATPase  54.29 
 
 
718 aa  683  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4129  heavy metal translocating P-type ATPase  52.22 
 
 
955 aa  666  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594841  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2752  heavy metal translocating P-type ATPase  55.21 
 
 
722 aa  668  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  52.95 
 
 
793 aa  701  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  65.24 
 
 
712 aa  879  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  53.31 
 
 
738 aa  705  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.174649 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  64.15 
 
 
711 aa  849  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3679  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
709 aa  1397  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4117  heavy metal translocating P-type ATPase  54.76 
 
 
731 aa  666  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194383  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1791  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  50.89 
 
 
740 aa  637  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4535  heavy metal translocating P-type ATPase  52.78 
 
 
734 aa  669  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3643  heavy metal translocating P-type ATPase  51.73 
 
 
726 aa  661  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1505  heavy metal translocating P-type ATPase  51.91 
 
 
716 aa  650  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.724781  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  53.38 
 
 
904 aa  702  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  49.44 
 
 
734 aa  637  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0212  heavy metal translocating P-type ATPase  50.95 
 
 
758 aa  646  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0438  heavy metal translocating P-type ATPase  51.24 
 
 
740 aa  642  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4071  heavy metal translocating P-type ATPase  54.77 
 
 
712 aa  664  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.515155 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1942  cadmium-translocating P-type ATPase  53.93 
 
 
704 aa  679  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2018  cadmium-translocating P-type ATPase  54.04 
 
 
814 aa  688  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7421  lead, cadmium, zinc and mercury-transporting ATPase  49.87 
 
 
764 aa  652  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.396456 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3336  heavy metal translocating P-type ATPase  53.13 
 
 
744 aa  658  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.812406 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0921  heavy metal translocating P-type ATPase  53.52 
 
 
844 aa  689  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3208  heavy metal translocating P-type ATPase  69.63 
 
 
720 aa  965  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3796  heavy metal translocating P-type ATPase  49.47 
 
 
756 aa  637  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.304079  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3411  hypothetical protein  51.44 
 
 
803 aa  630  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5561  P type cation (metal) transporter ATPase component  55.63 
 
 
757 aa  631  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.85793  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7259  lead, cadmium, zinc and mercury-transporting ATPase  54.57 
 
 
678 aa  622  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.482594 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2344  heavy metal translocating P-type ATPase  51.57 
 
 
732 aa  615  1e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.442895  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004007  copper-translocating P-type ATPase  48 
 
 
768 aa  612  1e-174  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3978  heavy metal translocating P-type ATPase  51.95 
 
 
759 aa  614  1e-174  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39503  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3338  heavy metal translocating P-type ATPase  51.88 
 
 
759 aa  614  1e-174  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.837764  normal  0.51996 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2067  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  48.35 
 
 
773 aa  605  1e-172  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3501  heavy metal translocating P-type ATPase  55 
 
 
758 aa  603  1e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.968413 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0551  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  50.43 
 
 
768 aa  601  1e-170  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01515  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  46.85 
 
 
689 aa  591  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1611  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  46.91 
 
 
803 aa  578  1e-163  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.730441  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0209  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  47.44 
 
 
771 aa  561  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0277781 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3873  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  47.58 
 
 
728 aa  558  1e-157  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0472181  normal  0.24383 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3845  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  48.29 
 
 
732 aa  552  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4789  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  48.65 
 
 
732 aa  553  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3948  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  48.43 
 
 
732 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03271  hypothetical protein  48.65 
 
 
732 aa  553  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03318  zinc, cobalt and lead efflux system  48.65 
 
 
732 aa  553  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0247  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  48.58 
 
 
732 aa  553  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3951  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  48.79 
 
 
732 aa  553  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3888  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  48.29 
 
 
732 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3768  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  48.14 
 
 
732 aa  552  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3778  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  47.86 
 
 
732 aa  551  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3853  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  48.65 
 
 
732 aa  551  1e-155  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3668  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  48.58 
 
 
732 aa  551  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0246  heavy metal translocating P-type ATPase  48.72 
 
 
732 aa  551  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3752  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  48.44 
 
 
732 aa  550  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1027  (Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  48.74 
 
 
777 aa  550  1e-155  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0093  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  46.58 
 
 
787 aa  545  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0088  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  46.08 
 
 
784 aa  543  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.473574  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  41.55 
 
 
712 aa  535  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  41.76 
 
 
712 aa  532  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  41.83 
 
 
712 aa  533  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  42.36 
 
 
783 aa  520  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  43.16 
 
 
707 aa  512  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3985  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  45.99 
 
 
782 aa  515  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0571  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  45.71 
 
 
782 aa  513  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  39.37 
 
 
767 aa  506  1e-142  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0233  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  45.19 
 
 
788 aa  508  1e-142  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  40.08 
 
 
709 aa  494  1e-138  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2242  heavy metal translocating P-type ATPase  41.8 
 
 
750 aa  490  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781921 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2450  heavy metal translocating P-type ATPase  42.51 
 
 
738 aa  486  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0805426  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4225  heavy metal translocating P-type ATPase  42.29 
 
 
734 aa  480  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  43.24 
 
 
713 aa  478  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  38.73 
 
 
751 aa  474  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5284  heavy metal translocating P-type ATPase  41.93 
 
 
800 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225774  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1643  heavy metal translocating P-type ATPase  41.93 
 
 
800 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960315  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  40.71 
 
 
833 aa  474  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18520  heavy metal translocating P-type ATPase  42.42 
 
 
712 aa  469  1e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1448  cadmium-translocating P-type ATPase  42.13 
 
 
748 aa  471  1e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  47.24 
 
 
800 aa  471  1e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  47.24 
 
 
799 aa  472  1e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  41.5 
 
 
984 aa  468  1e-130  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0854  heavy metal translocating P-type ATPase  47.26 
 
 
812 aa  468  1e-130  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  41.5 
 
 
984 aa  468  1e-130  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0026  heavy metal translocating P-type ATPase  40.9 
 
 
701 aa  463  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260901  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2810  heavy metal translocating P-type ATPase  41.43 
 
 
800 aa  464  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1677  heavy metal translocating P-type ATPase  39.61 
 
 
726 aa  459  1e-128  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  46.31 
 
 
673 aa  459  1e-128  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16660  putative metal-transporting P-type ATPase  41.16 
 
 
742 aa  462  1e-128  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  39.8 
 
 
735 aa  459  1e-128  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1049  hypothetical protein  38.19 
 
 
713 aa  461  1e-128  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2550  heavy metal translocating P-type ATPase  40.51 
 
 
748 aa  459  1e-128  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4439  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  45.71 
 
 
709 aa  454  1e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0479  heavy metal translocating P-type ATPase  40.57 
 
 
939 aa  452  1e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5371  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  40.9 
 
 
769 aa  453  1e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  43.7 
 
 
737 aa  454  1e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0922  heavy metal translocating P-type ATPase  40.36 
 
 
868 aa  453  1e-126  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  39.29 
 
 
734 aa  451  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5279  cadmium-translocating P-type ATPase  40.34 
 
 
752 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2390  heavy metal translocating P-type ATPase  40.92 
 
 
800 aa  446  1e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0451824  normal  0.128679 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>