More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3641 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 139 aa  285  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  92.65 
 
 		 137 aa  261  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  91.37 
 
 		 136 aa  260  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2320  50S ribosomal protein L17  89.93 
 
 		 138 aa  256  8e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116353  normal  0.244368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  88.49 
 
 		 138 aa  250  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  88.49 
 
 		 138 aa  250  5.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  84.33 
 
 		 135 aa  234  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  73.38 
 
 		 142 aa  214  4e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  75 
 
 		 138 aa  211  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  72.86 
 
 		 140 aa  208  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4773  50S ribosomal protein L17  79.84 
 
 		 140 aa  208  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000039604 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  72.93 
 
 		 137 aa  207  5e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  72.14 
 
 		 140 aa  204  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  70.5 
 
 		 139 aa  201  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2453  50S ribosomal protein L17  69.78 
 
 		 138 aa  200  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0612359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  77.42 
 
 		 143 aa  200  7e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2175  50S ribosomal protein L17  69.06 
 
 		 138 aa  199  8e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283997 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2138  50S ribosomal protein L17  71.54 
 
 		 138 aa  197  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.968449 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  75.81 
 
 		 141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  75 
 
 		 141 aa  195  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  76.61 
 
 		 140 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  75.81 
 
 		 140 aa  194  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2190  50S ribosomal protein L17  70.23 
 
 		 136 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.407841  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  73.6 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  73.6 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  70.5 
 
 		 140 aa  192  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  73.6 
 
 		 142 aa  192  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  73.39 
 
 		 141 aa  189  8e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  69.77 
 
 		 146 aa  181  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0564  50S ribosomal protein L17  65.47 
 
 		 139 aa  181  4.0000000000000006e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684509  normal  0.93978 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  68.55 
 
 		 140 aa  180  5.0000000000000004e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  66.13 
 
 		 138 aa  180  7e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  68.55 
 
 		 138 aa  179  8.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  68.55 
 
 		 140 aa  179  9.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1325  50S ribosomal protein L17  66.43 
 
 		 140 aa  179  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.355864 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  66.94 
 
 		 141 aa  179  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2526  50S ribosomal protein L17  65.25 
 
 		 141 aa  177  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505003  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  67.44 
 
 		 141 aa  177  5.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1740  50S ribosomal protein L17  64.52 
 
 		 139 aa  176  7e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219561  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0386  50S ribosomal protein L17  64.52 
 
 		 139 aa  176  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2509  50S ribosomal protein L17  65.32 
 
 		 139 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.745035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3922  ribosomal protein L17  59.02 
 
 		 132 aa  147  6e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  58.2 
 
 		 131 aa  146  7e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03145  50S ribosomal protein L17  58.06 
 
 		 127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  58.06 
 
 		 127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  58.06 
 
 		 127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3505  50S ribosomal protein L17  60 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0276  50S ribosomal protein L17  60 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0461081 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  58.06 
 
 		 127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4616  50S ribosomal protein L17  58.06 
 
 		 127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00563678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  58.06 
 
 		 127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3142  50S ribosomal protein L17  60 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2604  50S ribosomal protein L17  60 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  58.06 
 
 		 127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3749  50S ribosomal protein L17  60 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648028  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1951  50S ribosomal protein L17  60 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3041  50S ribosomal protein L17  60 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490666  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4216  ribosomal protein L17  56.3 
 
 		 132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719281  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  58.06 
 
 		 127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3777  50S ribosomal protein L17  60 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3719  50S ribosomal protein L17  60 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3311  50S ribosomal protein L17  59.17 
 
 		 132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.666345  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03096  hypothetical protein  58.06 
 
 		 127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363749  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0354  50S ribosomal protein L17  59.17 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.341272 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0588  50S ribosomal protein L17  58.54 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.348029  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3474  50S ribosomal protein L17  59.17 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  60.17 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2732  50S ribosomal protein L17  59.17 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0294  50S ribosomal protein L17  59.17 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0375  50S ribosomal protein L17  59.17 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0303  50S ribosomal protein L17  59.17 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  0.0244082 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  58.68 
 
 		 128 aa  145  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  59.17 
 
 		 127 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  59.17 
 
 		 127 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04495  50S ribosomal protein L17  61.86 
 
 		 127 aa  144  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2812  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 		 131 aa  144  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0476754  normal  0.443503 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3610  50S ribosomal protein L17  59.17 
 
 		 127 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  0.379851 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  59.17 
 
 		 127 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  59.17 
 
 		 127 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  58.68 
 
 		 129 aa  144  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  58.82 
 
 		 130 aa  144  5e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  58.82 
 
 		 130 aa  144  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0627  50S ribosomal protein L17P  52.52 
 
 		 134 aa  143  8.000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0793  ribosomal protein L17  57.5 
 
 		 131 aa  143  9e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0240293  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  59.32 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3617  50S ribosomal protein L17  59.32 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201184  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  59.32 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0341  50S ribosomal protein L17  59.32 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0245552 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0079  50S ribosomal protein L17  60 
 
 		 129 aa  143  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0085  50S ribosomal protein L17  57.14 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000013942  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  59.32 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0407  50S ribosomal protein L17  57.5 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0399  50S ribosomal protein L17  57.5 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  59.32 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0345  50S ribosomal protein L17  58.33 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  59.32 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  59.32 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  54.62 
 
 		 175 aa  140  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0077  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 		 131 aa  141  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000148079 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0502  50S ribosomal protein L17  58.33 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>