More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3501 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1499  amidophosphoribosyltransferase  62.63 
 
 		 529 aa  647    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338535  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3487  amidophosphoribosyltransferase  72.69 
 
 		 503 aa  716    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746658  normal  0.621078 
 
 
-
 
NC_004310  BR0446  amidophosphoribosyltransferase  67.36 
 
 		 485 aa  636    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0453  amidophosphoribosyltransferase  65.86 
 
 		 509 aa  637    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2599  amidophosphoribosyltransferase  75.42 
 
 		 499 aa  741    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0391838  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2017  amidophosphoribosyltransferase  83.2 
 
 		 504 aa  785    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2400  amidophosphoribosyltransferase  79.83 
 
 		 514 aa  779    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3787  amidophosphoribosyltransferase  80.12 
 
 		 510 aa  825    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3894  amidophosphoribosyltransferase  74.79 
 
 		 491 aa  741    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2502  amidophosphoribosyltransferase  66.25 
 
 		 500 aa  667    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0413  amidophosphoribosyltransferase  77.44 
 
 		 491 aa  756    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.577853 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3501  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 		 509 aa  1030    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2452  amidophosphoribosyltransferase  91.05 
 
 		 514 aa  904    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4300  amidophosphoribosyltransferase  74.38 
 
 		 491 aa  738    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.182299  normal  0.0484415 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2311  amidophosphoribosyltransferase  77.94 
 
 		 501 aa  756    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2282  amidophosphoribosyltransferase  89.19 
 
 		 503 aa  903    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.235461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2997  amidophosphoribosyltransferase  91.44 
 
 		 514 aa  938    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.807987  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2293  amidophosphoribosyltransferase  81.87 
 
 		 504 aa  796    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0560  amidophosphoribosyltransferase  65.38 
 
 		 496 aa  653    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.605887  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0727  amidophosphoribosyltransferase  63.78 
 
 		 496 aa  647    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0983  amidophosphoribosyltransferase  65.12 
 
 		 490 aa  644    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.592161  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4629  amidophosphoribosyltransferase  73.96 
 
 		 500 aa  729    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691036  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4407  amidophosphoribosyltransferase  72.29 
 
 		 491 aa  736    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1187  amidophosphoribosyltransferase  65.28 
 
 		 496 aa  647    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44974 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1042  amidophosphoribosyltransferase  65.7 
 
 		 496 aa  651    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.236184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3932  amidophosphoribosyltransferase  74.38 
 
 		 491 aa  738    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.961822  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0486  amidophosphoribosyltransferase  63.35 
 
 		 496 aa  629  1e-179  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.937235  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0405  amidophosphoribosyltransferase  63.19 
 
 		 493 aa  631  1e-179  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1541  amidophosphoribosyltransferase  62.82 
 
 		 502 aa  625  1e-178  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0404  amidophosphoribosyltransferase  62.45 
 
 		 488 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305555  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1763  amidophosphoribosyltransferase  60.41 
 
 		 496 aa  612  9.999999999999999e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.644721  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0578  amidophosphoribosyltransferase  62.39 
 
 		 486 aa  614  9.999999999999999e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2878  amidophosphoribosyltransferase  60.04 
 
 		 517 aa  598  1e-170  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.116336 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1205  amidophosphoribosyltransferase  56.18 
 
 		 493 aa  577  1.0000000000000001e-163  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1117  amidophosphoribosyltransferase  58.15 
 
 		 487 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.981489  normal  0.353735 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1062  amidophosphoribosyltransferase  57.63 
 
 		 486 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.739126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2454  amidophosphoribosyltransferase  58.15 
 
 		 487 aa  561  1e-158  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1707  amidophosphoribosyltransferase  55.94 
 
 		 497 aa  561  1e-158  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0317953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3939  amidophosphoribosyltransferase  56.69 
 
 		 499 aa  558  1e-158  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2132  amidophosphoribosyltransferase  57.38 
 
 		 508 aa  555  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.864953  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  55.23 
 
 		 467 aa  533  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  54.91 
 
 		 466 aa  535  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  53.26 
 
 		 468 aa  530  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  52.75 
 
 		 477 aa  521  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  52.75 
 
 		 477 aa  522  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  52.09 
 
 		 474 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0265  amidophosphoribosyltransferase  52.8 
 
 		 476 aa  516  1.0000000000000001e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  54.08 
 
 		 475 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1722  amidophosphoribosyltransferase  54.6 
 
 		 481 aa  514  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.56305  normal  0.196104 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2064  amidophosphoribosyltransferase  54.6 
 
 		 475 aa  514  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  51.62 
 
 		 474 aa  505  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1109  amidophosphoribosyltransferase  52.17 
 
 		 461 aa  502  1e-141  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  51.07 
 
 		 482 aa  491  1e-137  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4338  amidophosphoribosyltransferase  54.14 
 
 		 485 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4361  amidophosphoribosyltransferase  54.14 
 
 		 485 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1032  amidophosphoribosyltransferase  51.61 
 
 		 495 aa  485  1e-136  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4206  amidophosphoribosyltransferase  54.14 
 
 		 485 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.975393  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4354  amidophosphoribosyltransferase  54.26 
 
 		 484 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.463043 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  52.85 
 
 		 470 aa  482  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0139  amidophosphoribosyltransferase  49.13 
 
 		 462 aa  480  1e-134  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  50.87 
 
 		 471 aa  476  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  50.87 
 
 		 471 aa  476  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  50.87 
 
 		 471 aa  476  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  50.87 
 
 		 471 aa  476  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  50.87 
 
 		 471 aa  476  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  50.87 
 
 		 471 aa  477  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  50.87 
 
 		 471 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  50.65 
 
 		 471 aa  474  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  50.65 
 
 		 471 aa  473  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  50.65 
 
 		 471 aa  474  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  50.43 
 
 		 471 aa  472  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  52.43 
 
 		 470 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  51.51 
 
 		 480 aa  465  9.999999999999999e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  48.45 
 
 		 461 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2307  amidophosphoribosyltransferase  47.91 
 
 		 467 aa  462  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1618  amidophosphoribosyltransferase  48.37 
 
 		 506 aa  463  1e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  50 
 
 		 503 aa  464  1e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0090  amidophosphoribosyltransferase  49.56 
 
 		 462 aa  460  9.999999999999999e-129  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  51.64 
 
 		 480 aa  460  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1102  amidophosphoribosyltransferase  50.43 
 
 		 466 aa  460  9.999999999999999e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  49.35 
 
 		 472 aa  457  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0026  amidophosphoribosyltransferase  46.2 
 
 		 484 aa  457  1e-127  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  51.65 
 
 		 469 aa  456  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0063  amidophosphoribosyltransferase  50.42 
 
 		 472 aa  458  1e-127  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0051  amidophosphoribosyltransferase  47.19 
 
 		 479 aa  457  1e-127  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  48.39 
 
 		 474 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5556  amidophosphoribosyltransferase  51.3 
 
 		 511 aa  450  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1130  amidophosphoribosyltransferase  48.41 
 
 		 494 aa  449  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  50.11 
 
 		 488 aa  450  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1152  amidophosphoribosyltransferase  48.41 
 
 		 494 aa  449  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  49.46 
 
 		 494 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  49.46 
 
 		 494 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 		 496 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2807  amidophosphoribosyltransferase  46.9 
 
 		 462 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2109  amidophosphoribosyltransferase  46.65 
 
 		 475 aa  443  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3588  amidophosphoribosyltransferase  49.36 
 
 		 503 aa  445  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.51846 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1871  amidophosphoribosyltransferase  48.24 
 
 		 451 aa  444  1e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.10696  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  46.04 
 
 		 487 aa  442  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  48.67 
 
 		 487 aa  444  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0299  amidophosphoribosyltransferase  49 
 
 		 446 aa  444  1e-123  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>