19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3420 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3420  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.625895  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3786  hypothetical protein  55.24 
 
 		 223 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1681  hypothetical protein  42.99 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1241  hypothetical protein  41.12 
 
 		 218 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00985067  unclonable  0.0000000232118 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4445  hypothetical protein  38.79 
 
 		 220 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.651537 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4030  hypothetical protein  37.85 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2397  hypothetical protein  36.15 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438725  normal  0.127627 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3784  hypothetical protein  36.11 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0249757 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4029  hypothetical protein  61.54 
 
 		 96 aa  98.2  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.624414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3783  hypothetical protein  60.26 
 
 		 96 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0242454 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3785  hypothetical protein  47.32 
 
 		 143 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1682  hypothetical protein  51.85 
 
 		 97 aa  91.7  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2396  hypothetical protein  56.41 
 
 		 96 aa  91.7  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.390521  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4443  hypothetical protein  54.26 
 
 		 145 aa  88.6  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2395  hypothetical protein  56.41 
 
 		 145 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.951183  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3776  hypothetical protein  47.62 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4444  hypothetical protein  63.49 
 
 		 66 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.385928 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1242  hypothetical protein  47.56 
 
 		 89 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0176057  unclonable  0.0000000175361 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3084  hypothetical protein  34.46 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>