220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3417 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1232  K potassium transporter  62.3 
 
 
636 aa  761    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4765  K potassium transporter  53.16 
 
 
652 aa  638    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.266428 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3417  K potassium transporter  100 
 
 
634 aa  1278    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120836  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5050  K potassium transporter  55.84 
 
 
657 aa  662    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992645 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0927  potassium uptake protein  54.93 
 
 
634 aa  642    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.137865  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1537  K potassium transporter  61.17 
 
 
637 aa  739    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1238  K+ potassium transporter  55.82 
 
 
651 aa  667    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.261795  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0308  K potassium transporter  62.38 
 
 
637 aa  760    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.938116  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1122  K potassium transporter  61.57 
 
 
569 aa  702    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0179  K potassium transporter  62.46 
 
 
637 aa  758    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2102  K+ potassium transporter  55.23 
 
 
630 aa  711    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2692  K+ potassium transporter  82.18 
 
 
634 aa  1039    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0189185  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1497  K+ potassium transporter  55.97 
 
 
666 aa  672    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1877  K potassium transporter  55.59 
 
 
668 aa  673    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.119842  normal  0.0678898 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2327  K potassium transporter  57.52 
 
 
658 aa  674    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163546 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1262  K potassium transporter  56.08 
 
 
643 aa  680    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0285347 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1643  K potassium transporter  55.75 
 
 
670 aa  676    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3932  K potassium transporter  55.28 
 
 
672 aa  680    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0963001  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5357  K potassium transporter  55.84 
 
 
656 aa  681    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00124872  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0551  K potassium transporter  54.19 
 
 
632 aa  668    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861026  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3512  Kup family low affinity potassium transporter  56.07 
 
 
632 aa  683    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3513  Kup family low affinity potassium transporter  59.25 
 
 
640 aa  734    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1596  K potassium transporter  55.59 
 
 
668 aa  674    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.923122  normal  0.0938769 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6041  K potassium transporter  53.81 
 
 
633 aa  648    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420233  normal  0.917457 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6370  K potassium transporter  53.17 
 
 
633 aa  637    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649313  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0444  K potassium transporter  53.91 
 
 
630 aa  662    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0753432 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2222  K potassium transporter  55.56 
 
 
629 aa  662    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.569984  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1811  K potassium transporter  51.43 
 
 
651 aa  637    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3923  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0508  K potassium transporter  54.35 
 
 
632 aa  673    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845054  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5940  K potassium transporter  51.06 
 
 
633 aa  634  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0821691  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6870  K potassium transporter  50.9 
 
 
633 aa  634  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5868  K potassium transporter  50.08 
 
 
633 aa  634  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1383  potassium uptake protein  51.22 
 
 
651 aa  626  1e-178  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601106  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2252  K potassium transporter  53.14 
 
 
633 aa  627  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1856  K+ potassium transporter  51.54 
 
 
620 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1339  potassium uptake protein  51.22 
 
 
651 aa  627  1e-178  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3926  K potassium transporter  51.27 
 
 
641 aa  624  1e-177  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.147688 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3556  K+ potassium transporter  50.08 
 
 
626 aa  616  1e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2565  K potassium transporter  52.83 
 
 
633 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1184  K+ potassium transporter  49.35 
 
 
621 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0485  K+ potassium transporter  50.08 
 
 
630 aa  597  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2512  K+ potassium transporter  48.86 
 
 
620 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201429  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2932  K+ potassium transporter  48.7 
 
 
620 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00598935  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3436  K potassium transporter  49.43 
 
 
620 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2539  K+ potassium transporter  48.55 
 
 
625 aa  592  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2065  potassium uptake protein  49.92 
 
 
624 aa  589  1e-167  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1334  K+ potassium transporter  49.35 
 
 
636 aa  586  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.508351  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2350  potassium uptake protein, Kup system  49.76 
 
 
631 aa  585  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00598886  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0629  K potassium transporter  47.62 
 
 
664 aa  582  1.0000000000000001e-165  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0514546 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0201  K+ potassium transporter  47.48 
 
 
632 aa  581  1e-164  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4252  K+ potassium transporter  49.11 
 
 
641 aa  580  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3517  K potassium transporter  47.5 
 
 
628 aa  581  1e-164  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00569528 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1231  K+ potassium transporter  49.51 
 
 
656 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0916765  normal  0.143534 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5996  K potassium transporter  46.93 
 
 
627 aa  572  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106648  hitchhiker  0.00272836 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3993  potassium uptake protein  47.57 
 
 
631 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2528  K potassium transporter  48.74 
 
 
628 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00494923  hitchhiker  0.0000000660434 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1512  K+ potassium transporter  50.72 
 
 
634 aa  573  1.0000000000000001e-162  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1407  K potassium transporter  49.59 
 
 
628 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196511  decreased coverage  0.0000000731332 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0976  potassium uptake protein, Kup system  48.48 
 
 
626 aa  571  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0427  K potassium transporter  46.08 
 
 
639 aa  570  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215652  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1394  K+ potassium transporter  47.09 
 
 
631 aa  569  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.886731  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1394  K+ potassium transporter  48.21 
 
 
648 aa  570  1e-161  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4541  K+ potassium transporter  46.13 
 
 
622 aa  569  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0174  potassium uptake protein  46.49 
 
 
628 aa  569  1e-161  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.506892 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0943  K potassium transporter  46.38 
 
 
634 aa  565  1e-160  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0764  K+ potassium transporter  46.29 
 
 
622 aa  568  1e-160  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.44581  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1608  KUP family K(+) transporter  48.11 
 
 
628 aa  566  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.191618 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3125  K potassium transporter  48.54 
 
 
639 aa  566  1e-160  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3762  K potassium transporter  48.62 
 
 
650 aa  567  1e-160  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6716  K potassium transporter  48.7 
 
 
641 aa  565  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19104  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0572  K potassium transporter  46.43 
 
 
620 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1621  potassium uptake transmembrane protein  48.6 
 
 
633 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1331  potassium uptake protein  48.33 
 
 
630 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00641911  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1710  K potassium transporter  48.12 
 
 
637 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00353606  normal  0.989137 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2247  potassium uptake protein  48.41 
 
 
660 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438776  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4723  K potassium transporter  49.26 
 
 
640 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0485791 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5005  K potassium transporter  48.04 
 
 
647 aa  565  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00761853  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1820  potassium uptake protein  48.33 
 
 
630 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0076  potassium uptake protein  48.33 
 
 
630 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.210813  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1823  K potassium transporter  47.81 
 
 
638 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0350815  normal  0.623135 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3258  K potassium transporter  45.48 
 
 
622 aa  560  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0402943  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1062  potassium uptake protein  46.01 
 
 
634 aa  561  1e-158  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2341  kup system potassium uptake protein  48.17 
 
 
660 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.357755  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1857  K potassium transporter  44.68 
 
 
637 aa  559  1e-158  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000427943  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4582  K+ potassium transporter  45.21 
 
 
622 aa  559  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6280  K+ potassium transporter  47.81 
 
 
688 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1475  K potassium transporter  48.47 
 
 
638 aa  560  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765149  normal  0.163846 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1737  K+ potassium transporter  47.73 
 
 
637 aa  561  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1799  K+ potassium transporter  47.81 
 
 
638 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1926  K potassium transporter  48.19 
 
 
633 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0406918  normal  0.0407314 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3909  K+ potassium transporter  45.48 
 
 
622 aa  560  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000284388  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1253  K+ potassium transporter  45.48 
 
 
622 aa  560  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22459  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2175  potassium uptake protein  48.17 
 
 
630 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2213  potassium uptake protein  48.17 
 
 
630 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1092  potassium uptake protein  48.48 
 
 
622 aa  561  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0884975  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1463  K+ potassium transporter  47.24 
 
 
647 aa  560  1e-158  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.954899  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0101  K+ potassium transporter  47.81 
 
 
648 aa  560  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.185505  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5100  K+ transporter  47.63 
 
 
638 aa  558  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0141  K+ potassium transporter  49.02 
 
 
630 aa  555  1e-157  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3454  Kup family low affinity potassium transporter  48.78 
 
 
611 aa  557  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.565497 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>