More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3196 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_3196  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  100 
 
 
110 aa  220  6e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2752  HesB/YadR/YfhF  91.82 
 
 
110 aa  204  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.271088 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2797  HesB/YadR/YfhF  90.91 
 
 
110 aa  204  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0272946  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1756  HesB/YadR/YfhF  83.64 
 
 
110 aa  190  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1809  HesB/YadR/YfhF  83.64 
 
 
110 aa  189  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2506  HesB/YadR/YfhF  84.11 
 
 
109 aa  184  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4426  hypothetical protein  85.44 
 
 
113 aa  181  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.939817  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3020  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  64.49 
 
 
116 aa  142  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0866  HesB/YadR/YfhF family protein  62.86 
 
 
108 aa  142  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0875  HesB/YadR/YfhF family protein  62.86 
 
 
108 aa  142  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.699772  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2678  hypothetical protein  56.36 
 
 
110 aa  140  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0428066  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1480  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  59.09 
 
 
110 aa  139  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.692508  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2353  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  60.95 
 
 
108 aa  139  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.130413  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2468  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  57.94 
 
 
108 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.698044  normal  0.0161049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2171  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  59.09 
 
 
108 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.367568  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1915  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  56.07 
 
 
109 aa  135  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3125  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  57.27 
 
 
110 aa  134  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185787  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1815  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  59.05 
 
 
116 aa  133  8e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.444261  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0751  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  55.66 
 
 
107 aa  130  5e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.118128  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3583  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  56.19 
 
 
108 aa  130  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2770  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  55.24 
 
 
108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2712  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.46 
 
 
118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.573216 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3701  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  55.24 
 
 
108 aa  127  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3392  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  55.24 
 
 
108 aa  127  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.585208  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1678  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  58.18 
 
 
110 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4243  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  54.81 
 
 
141 aa  127  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0493  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.85 
 
 
114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1196  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  56.31 
 
 
108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0627654  normal  0.819271 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2658  HesB/YadR/YfhF family protein  53.4 
 
 
108 aa  120  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0379695  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1316  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  53.4 
 
 
108 aa  120  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1156  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  55.56 
 
 
109 aa  120  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293906  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0928  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  55.34 
 
 
111 aa  115  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1781  HesB/YadR/YfhF  54.84 
 
 
124 aa  114  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0748  HesB/YadR/YfhF family protein  45.95 
 
 
130 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00160104  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1830  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.87 
 
 
128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1504  HesB/YadR/YfhF  51.46 
 
 
109 aa  111  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0901  HesB/YadR/YfhF  54.37 
 
 
107 aa  112  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1730  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.96 
 
 
110 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146386  normal  0.864334 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1763  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.04 
 
 
128 aa  110  8.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.910662  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3448  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.79 
 
 
121 aa  110  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0379124 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1303  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.04 
 
 
116 aa  110  9e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00012282 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2343  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.38 
 
 
122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3701  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.04 
 
 
130 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3419  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.38 
 
 
122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000312086  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.38 
 
 
122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000525551  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0255  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.38 
 
 
122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3376  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.38 
 
 
122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000296578  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1117  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.38 
 
 
122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3412  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.38 
 
 
122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217175  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2521  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.38 
 
 
122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2562  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.12 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000254091  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2702  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45 
 
 
123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.840574  normal  0.551617 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0575  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45 
 
 
123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0103846  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0535  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.11 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110729  normal  0.812504 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0601  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45 
 
 
123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00222893  normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3352  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.15 
 
 
121 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00016934  hitchhiker  0.0000376167 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3153  putative HesB-like protein  44.86 
 
 
121 aa  108  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937161 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0609  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.15 
 
 
121 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000901773  normal  0.437639 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02949  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46 
 
 
102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4109  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.6 
 
 
121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0648  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.12 
 
 
123 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010158  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3767  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.17 
 
 
123 aa  107  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.877653  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0198  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.12 
 
 
123 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0800429  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0681  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.12 
 
 
123 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0105609  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0060  HesB/YadR/YfhF  44.86 
 
 
117 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00961876  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4049  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.59 
 
 
121 aa  106  9.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0629  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.59 
 
 
124 aa  106  9.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0608  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.59 
 
 
124 aa  106  9.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.581475  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2642  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.99 
 
 
121 aa  106  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0615003  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0725  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.93 
 
 
120 aa  106  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0385  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.67 
 
 
124 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105816  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0494  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.67 
 
 
124 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0471  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.27 
 
 
122 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0242787  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0456  HesB-like protein  46.3 
 
 
116 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00139708  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5912  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.23 
 
 
124 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106934  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0349  HesB/YadR/YfhF  40.74 
 
 
113 aa  105  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0370  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.67 
 
 
124 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.828818  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1413  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.15 
 
 
118 aa  105  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4676  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.81 
 
 
121 aa  105  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0414  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.27 
 
 
122 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  0.0298557 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1883  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.81 
 
 
124 aa  103  8e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0104444  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4622  HesB/YadR/YfhF family protein  44.04 
 
 
113 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5101  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.24 
 
 
116 aa  102  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105722  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3912  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.81 
 
 
111 aa  102  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2279  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.79 
 
 
130 aa  102  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000000652366  hitchhiker  0.00000000102221 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0605  HesB/YadR/YfhF family protein  43.24 
 
 
116 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4568  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.24 
 
 
116 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420029  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2408  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.52 
 
 
120 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00136541  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3299  HesB/YadR/YfhF  46.3 
 
 
117 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3032  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.04 
 
 
121 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1012  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.51 
 
 
115 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.82 
 
 
116 aa  101  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.014396  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0653  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.66 
 
 
116 aa  101  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.8310399999999997e-21  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1587  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.06 
 
 
128 aa  102  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000319223  normal  0.730386 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0836  hypothetical protein  45.28 
 
 
117 aa  101  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0132349  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2772  HesB/YadR/YfhF  46.3 
 
 
141 aa  101  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2887  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.19 
 
 
120 aa  100  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3930  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.24 
 
 
116 aa  100  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0777842  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1208  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.55 
 
 
116 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.371848  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3149  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.55 
 
 
116 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.025262  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>