More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2954 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  100 
 
 		 272 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  82.72 
 
 		 272 aa  474  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  63.82 
 
 		 259 aa  322  3e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  61.79 
 
 		 260 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  60.16 
 
 		 259 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  55.14 
 
 		 289 aa  288  9e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  55.14 
 
 		 293 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  55.14 
 
 		 293 aa  285  4e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  54.32 
 
 		 287 aa  285  7e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16920  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  58.1 
 
 		 269 aa  282  4.0000000000000003e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.407228  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  51.82 
 
 		 251 aa  280  2e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  53.66 
 
 		 308 aa  271  9e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  52.24 
 
 		 272 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  55.19 
 
 		 253 aa  270  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  51.34 
 
 		 271 aa  269  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  53.36 
 
 		 267 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  52.19 
 
 		 253 aa  268  5e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  52.1 
 
 		 272 aa  268  7e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  52.1 
 
 		 272 aa  267  1e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  52.1 
 
 		 272 aa  267  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  50.96 
 
 		 271 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  53.42 
 
 		 304 aa  266  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  48.26 
 
 		 263 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  53.54 
 
 		 307 aa  265  4e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  52.23 
 
 		 254 aa  265  5e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  49.39 
 
 		 254 aa  265  5.999999999999999e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  52.92 
 
 		 271 aa  265  7e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  51.82 
 
 		 254 aa  264  1e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  52.44 
 
 		 258 aa  264  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  51.82 
 
 		 254 aa  262  3e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  53.25 
 
 		 267 aa  263  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  53.25 
 
 		 304 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  55.51 
 
 		 283 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  53.25 
 
 		 304 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  48.37 
 
 		 252 aa  261  8e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  50.61 
 
 		 261 aa  260  2e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  47.67 
 
 		 260 aa  258  7e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  48.69 
 
 		 306 aa  257  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  50.19 
 
 		 279 aa  256  3e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  52.3 
 
 		 252 aa  255  4e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  52.82 
 
 		 264 aa  255  6e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  51.71 
 
 		 254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  52.24 
 
 		 274 aa  254  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  51.41 
 
 		 267 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  51.26 
 
 		 315 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  49.81 
 
 		 261 aa  253  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  52.68 
 
 		 261 aa  248  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  49.61 
 
 		 297 aa  249  5e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  50.86 
 
 		 303 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  50.86 
 
 		 303 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  50.86 
 
 		 303 aa  248  9e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  50.4 
 
 		 274 aa  247  2e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  50.99 
 
 		 264 aa  247  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  47.37 
 
 		 258 aa  246  2e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  48.95 
 
 		 253 aa  247  2e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  50.63 
 
 		 282 aa  246  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  49.19 
 
 		 259 aa  246  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  49.8 
 
 		 259 aa  245  4.9999999999999997e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  49.57 
 
 		 269 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  48.39 
 
 		 261 aa  244  9e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  48.56 
 
 		 263 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  47.15 
 
 		 264 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  52.31 
 
 		 256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  47.15 
 
 		 260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  51.82 
 
 		 260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  50.62 
 
 		 286 aa  242  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  50.21 
 
 		 259 aa  242  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  54.5 
 
 		 279 aa  242  6e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  44.9 
 
 		 256 aa  241  7.999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  49.19 
 
 		 259 aa  241  7.999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  49.19 
 
 		 261 aa  241  9e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  47.37 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  46.92 
 
 		 287 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  48.02 
 
 		 259 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  49.79 
 
 		 259 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  46.53 
 
 		 267 aa  240  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  50.21 
 
 		 255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  49.2 
 
 		 271 aa  239  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08090  ABC transporter, ATP-binding component  46.42 
 
 		 269 aa  238  5.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  47.83 
 
 		 287 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  49.37 
 
 		 291 aa  238  9e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  51.29 
 
 		 281 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3061  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  47.58 
 
 		 259 aa  237  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00453099  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  49.8 
 
 		 280 aa  236  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  49.79 
 
 		 263 aa  237  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3059  taurine import ATP-binding protein TauB  48.39 
 
 		 259 aa  236  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  47.11 
 
 		 257 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  50.63 
 
 		 311 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  50.63 
 
 		 311 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4878  putative ABC transporter, ATP-binding protein  48.96 
 
 		 265 aa  236  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.0921087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  51.28 
 
 		 264 aa  236  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  48.35 
 
 		 286 aa  236  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  47.98 
 
 		 258 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  51.77 
 
 		 257 aa  235  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  53.07 
 
 		 284 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  52.38 
 
 		 278 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4138  ABC transporter related  50.63 
 
 		 311 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  46.12 
 
 		 265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  47.97 
 
 		 259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  48.35 
 
 		 286 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>