295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2948 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_2948  Integral membrane protein TerC  100 
 
 
240 aa  466  1e-130  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2631  integral membrane protein TerC  87.5 
 
 
240 aa  374  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.124087  decreased coverage  3.45218e-05 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4147  hypothetical protein  79.58 
 
 
241 aa  364  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.976198  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1505  integral membrane protein TerC  80.25 
 
 
241 aa  355  3e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0874873 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2045  integral membrane protein TerC  77.92 
 
 
241 aa  347  8e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7344  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3874  integral membrane protein TerC  58.97 
 
 
253 aa  275  6e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3668  integral membrane protein TerC  51.88 
 
 
259 aa  264  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.424271  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2806  integral membrane protein TerC  54.2 
 
 
242 aa  261  5e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.225648  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1686  TerC protein  54.39 
 
 
239 aa  261  8e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0052  integral membrane protein TerC  51.88 
 
 
253 aa  258  5e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.418667 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2105  integral membrane protein TerC  53.33 
 
 
250 aa  257  1e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1782  integral membrane protein TerC  54.62 
 
 
248 aa  256  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72493 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1919  Integral membrane protein TerC  50.42 
 
 
253 aa  254  6e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.996169 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1787  S-adenosylmethionine synthetase (methionineadenosyltransferase; AdoMet synthetase; MAT)  51.67 
 
 
241 aa  254  7e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1487  hypothetical protein  51.71 
 
 
519 aa  252  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal  0.853347 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1303  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  51.71 
 
 
519 aa  252  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344709  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1972  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  51.71 
 
 
519 aa  252  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0865703  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2029  TerC family/CBS/transporter membrane protein  51.71 
 
 
519 aa  252  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34644  normal  0.965687 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1968  membrane protein TerC family/CBS/transporter associated domain protein  51.71 
 
 
519 aa  252  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0339939  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3292  integral membrane protein TerC  51.88 
 
 
248 aa  252  4e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01774  hypothetical protein  50.43 
 
 
518 aa  251  9e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2545  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  50.43 
 
 
518 aa  251  9e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000249241  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01786  fused predicted membrane protein/conserved protein  50.43 
 
 
518 aa  251  9e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1817  integral membrane protein TerC  50.43 
 
 
518 aa  251  9e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.770392  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2044  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  50.43 
 
 
518 aa  251  9e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018059  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1906  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  50.43 
 
 
518 aa  251  9e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.47451e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3180  integral membrane protein TerC  50.21 
 
 
250 aa  251  9e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.492128  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1827  Integral membrane protein TerC  50.43 
 
 
518 aa  251  9e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015366  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1372  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  50.43 
 
 
518 aa  251  9e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0696189  normal  0.0303689 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2082  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  50.43 
 
 
516 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.29507e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0026  protein YegH  49.17 
 
 
238 aa  250  1e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2445  integral membrane protein TerC  50.21 
 
 
250 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0238  integral membrane protein TerC  50.63 
 
 
252 aa  249  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.606793  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3248  integral membrane protein TerC  50.21 
 
 
250 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.152861  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2385  integral membrane protein TerC  50.63 
 
 
518 aa  249  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1926  integral membrane protein TerC  51.46 
 
 
249 aa  250  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.615249  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2223  Integral membrane protein TerC  55 
 
 
259 aa  249  3e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3527  integral membrane protein TerC  50.21 
 
 
250 aa  248  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183926  normal  0.16998 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3839  hypothetical protein  50 
 
 
254 aa  248  5e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0314  inner membrane protein  52.28 
 
 
251 aa  248  8e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00210653  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2812  integral membrane protein TerC  51.05 
 
 
514 aa  247  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0276679 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1601  integral membrane protein TerC  50.85 
 
 
250 aa  246  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1505  protein YegH  48.75 
 
 
246 aa  246  2e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  6.14006e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2220  Integral membrane protein TerC  49.37 
 
 
518 aa  244  1e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0038  Integral membrane protein TerC  50.83 
 
 
249 aa  242  3e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4229  Integral membrane protein TerC  53.2 
 
 
264 aa  242  4e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0769944  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1936  Integral membrane protein TerC  52.99 
 
 
250 aa  241  6e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00215857  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0655  Integral membrane protein TerC  51.68 
 
 
253 aa  241  6e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0273  integral membrane protein TerC  52.87 
 
 
241 aa  240  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0067  Integral membrane protein TerC  52.3 
 
 
253 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.645865  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3418  Integral membrane protein TerC  49.17 
 
 
249 aa  239  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232908  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1942  integral membrane protein TerC  49.58 
 
 
247 aa  240  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0501852  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2234  integral membrane protein TerC  52.72 
 
 
247 aa  239  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0055  Integral membrane protein TerC  52.3 
 
 
253 aa  239  3e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0899  integral membrane protein TerC  54.66 
 
 
257 aa  239  3e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  4.07273e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2424  integral membrane protein TerC  50.42 
 
 
252 aa  239  3e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.350299  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2706  integral membrane protein TerC  52.94 
 
 
255 aa  239  4e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  2.4631e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1336  TerC family membrane protein  53.78 
 
 
245 aa  237  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0051  integral membrane protein TerC  51.46 
 
 
253 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.653903  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3094  integral membrane protein TerC  49.16 
 
 
518 aa  236  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.403437  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0779  integral membrane protein TerC  51.25 
 
 
251 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1260  integral membrane protein TerC  51.25 
 
 
251 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0447301  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0299  hypothetical protein  48.93 
 
 
251 aa  236  2e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.481455  hitchhiker  7.10089e-05 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1180  integral membrane protein TerC  53.16 
 
 
241 aa  236  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  8.73859e-07 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3705  integral membrane protein TerC  49.17 
 
 
249 aa  236  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1753  hypothetical protein  50.21 
 
 
253 aa  235  4e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3663  integral membrane protein TerC  48.52 
 
 
510 aa  234  6e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2058  integral membrane protein TerC  51.93 
 
 
271 aa  234  8e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0939102  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2582  Integral membrane protein TerC  48.1 
 
 
243 aa  234  1e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218501 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1293  Integral membrane protein TerC  46.84 
 
 
528 aa  234  1e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2463  integral membrane protein TerC  52.74 
 
 
514 aa  233  2e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1650  CBS domain-containing protein  52.74 
 
 
522 aa  233  2e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2367  CBS domain-containing protein  52.74 
 
 
514 aa  233  2e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0786  integral membrane protein TerC  53.85 
 
 
253 aa  231  5e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0111606  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2148  Integral membrane protein TerC  49.37 
 
 
250 aa  232  5e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  0.0306348 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0901  Integral membrane protein TerC  47.92 
 
 
238 aa  231  5e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00975959  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1200  Integral membrane protein TerC  47.26 
 
 
529 aa  231  6e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2868  Integral membrane protein TerC  49.16 
 
 
529 aa  231  7e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1762  integral membrane protein TerC  50.21 
 
 
530 aa  231  7e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171934  normal  0.106093 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2187  Integral membrane protein TerC  52.08 
 
 
245 aa  231  8e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1984  Integral membrane protein TerC  51.71 
 
 
517 aa  230  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2326  integral membrane protein TerC  45.99 
 
 
523 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0193  TerC family transport protein  47.9 
 
 
518 aa  231  1e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.026546 
 
 
-
 
NC_004310  BR1332  CBS domain-containing protein  47.68 
 
 
518 aa  231  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4355  Integral membrane protein TerC  51.65 
 
 
253 aa  229  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.695526 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2798  integral membrane protein TerC  49.17 
 
 
251 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.638851 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3437  CBS domain-containing protein  45.99 
 
 
523 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527422  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2436  integral membrane protein TerC  45.99 
 
 
523 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1664  hypothetical protein  52.56 
 
 
247 aa  230  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.898463  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1721  hypothetical protein  52.56 
 
 
247 aa  230  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3038  Integral membrane protein TerC  46.41 
 
 
577 aa  229  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3020  Integral membrane protein TerC  47.84 
 
 
238 aa  229  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000258386  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3194  integral membrane protein TerC  51.65 
 
 
255 aa  228  6e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1927  Integral membrane protein TerC  49.37 
 
 
518 aa  228  6e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2691  membrane protein, TerC family  49.36 
 
 
253 aa  228  7e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.607869  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1292  CBS domain-containing protein  47.26 
 
 
522 aa  228  8e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1232  integral membrane protein TerC  51.07 
 
 
251 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140437  normal  0.537044 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2499  integral membrane protein TerC  45.57 
 
 
523 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124068  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4403  integral membrane protein TerC  52.28 
 
 
263 aa  227  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5729  Integral membrane protein TerC  53.56 
 
 
249 aa  226  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>