More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2886 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2886  Nitrogenase  100 
 
 		 290 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0774  nitrogenase  80 
 
 		 290 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0795  nitrogenase iron protein  64.13 
 
 		 291 aa  366  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.835028  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2008  nitrogenase iron protein  63.14 
 
 		 324 aa  364  1e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.221735  normal  0.365396 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2597  nitrogenase iron protein  61.48 
 
 		 289 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.036256  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0095  Nitrogenase  62.01 
 
 		 299 aa  358  5e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2907  nitrogenase iron protein  62.41 
 
 		 289 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1353  nitrogenase iron protein  60.21 
 
 		 292 aa  353  2e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000220216  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3889  nitrogenase  51.84 
 
 		 288 aa  290  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.290532  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0506  nitrogenase reductase-like protein  48.94 
 
 		 290 aa  290  2e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3090  nitrogenase reductase  51.66 
 
 		 277 aa  278  7e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1158  nitrogenase reductase  50.74 
 
 		 274 aa  275  7e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0803  nitrogenase reductase-like protein  46.1 
 
 		 292 aa  275  7e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.186385  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1573  nitrogenase iron protein subunit NifH  49.45 
 
 		 284 aa  275  8e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1147  nitrogenase reductase-like protein  46.83 
 
 		 292 aa  275  9e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1528  nitrogenase reductase-like protein  45.76 
 
 		 313 aa  273  3e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1616  NifH/frxC-family protein  47.57 
 
 		 276 aa  271  8.000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1152  nitrogenase reductase-like protein  44.75 
 
 		 292 aa  270  2e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2613  nitrogenase reductase  49.82 
 
 		 276 aa  268  7e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1224  nitrogenase reductase-like protein  47.25 
 
 		 278 aa  267  1e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0237  Nitrogenase  50.92 
 
 		 272 aa  267  1e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.848648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0834  nitrogenase reductase  49.26 
 
 		 276 aa  267  1e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1023  nitrogenase iron protein  49.07 
 
 		 275 aa  266  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1019  nitrogenase reductase  49.26 
 
 		 274 aa  266  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855562  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2083  nitrogenase  48.34 
 
 		 270 aa  264  1e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1434  nitrogenase iron protein  48.71 
 
 		 283 aa  263  2e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0793  nitrogenase  50.92 
 
 		 280 aa  263  2e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00476725  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1201  nitrogenase iron protein  48.15 
 
 		 273 aa  263  3e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2821  nitrogenase iron protein  49.07 
 
 		 272 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.436411  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1949  nitrogenase reductase  52.34 
 
 		 274 aa  261  6.999999999999999e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00645764  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0561  nitrogenase iron protein  49.44 
 
 		 276 aa  261  6.999999999999999e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000368653  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1751  nitrogenase reductase  51.17 
 
 		 274 aa  261  6.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.555016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4043  nitrogenase iron protein  47.41 
 
 		 273 aa  261  8e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0162942 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1627  nitrogenase reductase  51.17 
 
 		 274 aa  260  1e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000481616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0685  nitrogenase reductase  51.95 
 
 		 274 aa  258  7e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3030  nitrogenase iron protein  47.6 
 
 		 288 aa  258  7e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1528  nitrogenase reductase  51.95 
 
 		 274 aa  258  9e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1244  nitrogenase reductase  52.34 
 
 		 274 aa  258  1e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000240583  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0143  nitrogenase iron protein  46.86 
 
 		 280 aa  257  1e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.343179  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0744  nitrogenase reductase  51.95 
 
 		 274 aa  256  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1142  nitrogenase iron protein  48.7 
 
 		 276 aa  256  4e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.442855  normal  0.809863 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1049  nitrogenase iron protein  48.34 
 
 		 275 aa  255  8e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0274  nitrogenase iron protein  45.76 
 
 		 291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23577  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01380  Nitrogenase iron protein  46.49 
 
 		 290 aa  253  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3467  nitrogenase iron protein  46.49 
 
 		 288 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3203  nitrogenase iron protein  50.58 
 
 		 288 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1937  nitrogenase  51.29 
 
 		 272 aa  253  3e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.894359  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1815  Nitrogenase  52.67 
 
 		 251 aa  253  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3855  nitrogenase iron protein  46.57 
 
 		 326 aa  252  4.0000000000000004e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430007  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3916  nitrogenase reductase  46.21 
 
 		 295 aa  252  5.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2098  nitrogenase iron protein  45.33 
 
 		 292 aa  251  7e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0171  nitrogenase reductase  46.49 
 
 		 273 aa  251  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.217628  normal  0.670038 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0165  nitrogenase iron protein subunit NifH  49.22 
 
 		 268 aa  249  4e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1415  nitrogenase iron protein subunit NifH  48.46 
 
 		 296 aa  248  6e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.210537 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1202  nitrogenase iron protein subunit NifH  45.76 
 
 		 296 aa  248  6e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.451718  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2120  nitrogenase iron protein  44.72 
 
 		 299 aa  248  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.109902 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02660  vanadium nitrogenase iron protein  49.81 
 
 		 290 aa  247  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2364  nitrogenase iron protein  45.8 
 
 		 298 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0491  nitrogenase iron protein  46.49 
 
 		 293 aa  247  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4054  nitrogenase iron protein subunit NifH  45.85 
 
 		 324 aa  246  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00458685  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0650  nitrogenase iron protein  49.03 
 
 		 288 aa  246  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4488  nitrogenase iron protein subunit NifH  45.39 
 
 		 287 aa  246  4e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49000  nitrogenase reductase  46.49 
 
 		 275 aa  246  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1354  nitrogenase iron protein  46.49 
 
 		 296 aa  245  8e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0969  nitrogenase reductase  47.79 
 
 		 299 aa  245  8e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1073  nitrogenase reductase  47.79 
 
 		 299 aa  245  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4247  nitrogenase iron protein subunit NifH  45.36 
 
 		 296 aa  244  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.252394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2610  nitrogenase reductase  45.02 
 
 		 275 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.343866  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2145  nitrogenase iron protein  48.64 
 
 		 289 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.936237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4046  nitrogenase iron protein  46.21 
 
 		 275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.316801  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2074  nitrogenase iron protein  48.64 
 
 		 289 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1570  nitrogenase reductase  46.55 
 
 		 298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1240  nitrogenase reductase  45.65 
 
 		 296 aa  243  3e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.118183 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0088  nitrogenase reductase  45.59 
 
 		 303 aa  243  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4463  nitrogenase reductase  47.43 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1522  nitrogenase reductase  45.65 
 
 		 296 aa  243  3e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1623  nitrogenase reductase  45.39 
 
 		 275 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5101  nitrogenase reductase  46.32 
 
 		 298 aa  242  5e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0143  nitrogenase reductase  45.59 
 
 		 293 aa  242  6e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0662  nitrogenase iron protein subunit NifH  47.47 
 
 		 289 aa  241  7.999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.24324  normal  0.221237 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3771  nitrogenase iron protein  47.88 
 
 		 299 aa  241  7.999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0377842  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2281  nitrogenase reductase  44.28 
 
 		 275 aa  241  9e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000562599  normal  0.173141 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3534  nitrogenase reductase  46.32 
 
 		 299 aa  241  9e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332377  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6881  nitrogenase iron protein  44.65 
 
 		 289 aa  241  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1395  nitrogenase reductase  45.02 
 
 		 275 aa  241  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4684  nitrogenase reductase  45.39 
 
 		 275 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1803  nitrogenase reductase  44.28 
 
 		 275 aa  241  1e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.736404  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0658  nitrogenase reductase  44.28 
 
 		 275 aa  241  1e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0493156  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1010  nitrogenase reductase  46.32 
 
 		 295 aa  240  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5925  nitrogenase reductase  45.96 
 
 		 295 aa  239  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4478  nitrogenase reductase  47.88 
 
 		 297 aa  239  5e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5879  nitrogenase reductase  45.96 
 
 		 295 aa  239  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0809019  normal  0.897591 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1246  nitrogenase reductase  45.91 
 
 		 312 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.944984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0473  nitrogenase reductase  46.04 
 
 		 290 aa  238  8e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.686958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1175  nitrogenase iron protein  47.47 
 
 		 289 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3996  nitrogenase reductase  45.59 
 
 		 299 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2821  nitrogenase iron protein  47.08 
 
 		 289 aa  237  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0065  nitrogenase reductase  43.91 
 
 		 275 aa  237  2e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1813  nitrogenase iron protein  44.37 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0098  nitrogenase reductase  43.54 
 
 		 275 aa  236  2e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.380897  normal  0.0345089 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>