More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2782 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5806  aminotransferase  80.1 
 
 		 406 aa  681    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.658046  decreased coverage  0.00092388 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2782  aminotransferase  100 
 
 		 406 aa  832    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3995  aminotransferase  91.87 
 
 		 406 aa  752    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1648  aminotransferase  90.64 
 
 		 405 aa  736    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3284  aminotransferase  80.35 
 
 		 406 aa  693    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.081713 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2967  aminotransferase  97.04 
 
 		 406 aa  784    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6029  aminotransferase  79.6 
 
 		 406 aa  681    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0777497  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2817  aminotransferase  93.6 
 
 		 406 aa  760    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2494  aminotransferase  97.04 
 
 		 406 aa  783    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.260589 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2310  aminotransferase  90.89 
 
 		 405 aa  736    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5073  aminotransferase  78.16 
 
 		 409 aa  668    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0054925 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3522  aminotransferase  80.2 
 
 		 406 aa  678    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0878596  normal  0.459618 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3091  aminotransferase  81.09 
 
 		 406 aa  696    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.974806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3411  aminotransferase  80.85 
 
 		 406 aa  694    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1275  aminotransferase  73.09 
 
 		 406 aa  628  1e-179  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1238  aminotransferase  73.09 
 
 		 406 aa  628  1e-179  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0418526  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1738  aminotransferase  72.17 
 
 		 405 aa  628  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.990718  normal  0.152146 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1454  aminotransferase  72.91 
 
 		 405 aa  629  1e-179  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  hitchhiker  0.000434542 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1923  aminotransferase  73.4 
 
 		 405 aa  629  1e-179  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.351936  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1544  aminotransferase  71.92 
 
 		 405 aa  625  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2278  aminotransferase  72.66 
 
 		 405 aa  627  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874685  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1916  aminotransferase  72.35 
 
 		 407 aa  623  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2945  aminotransferase class I and II  69.37 
 
 		 425 aa  597  1e-169  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0558031  hitchhiker  0.0087233 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1299  aminotransferase  66.75 
 
 		 403 aa  569  1e-161  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3016  aminotransferase  64.91 
 
 		 406 aa  558  1e-158  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.562115  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0644  aminotransferase  66.58 
 
 		 402 aa  554  1e-157  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.439805  normal  0.145502 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0864  aminotransferase  66.92 
 
 		 402 aa  544  1e-154  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.565347  normal  0.675575 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2505  aminotransferase  63.86 
 
 		 407 aa  547  1e-154  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.784571  normal  0.124527 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2411  aminotransferase  62.11 
 
 		 413 aa  531  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.306249  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0506  aminotransferase  65.06 
 
 		 406 aa  532  1e-150  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0194715  normal  0.65304 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0501  aminotransferase  65.64 
 
 		 413 aa  528  1e-149  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1755  aminotransferase  53.42 
 
 		 421 aa  457  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000260534  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1267  aspartate aminotransferase  52.53 
 
 		 404 aa  443  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259449 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1282  aminotransferase class I and II  54.05 
 
 		 409 aa  440  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.888913  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1415  aminotransferase  50 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1569  aminotransferase  49.74 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1106  aspartate aminotransferase  51.12 
 
 		 411 aa  437  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.584654 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0472  aminotransferase, class I/II  52.2 
 
 		 393 aa  434  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2455  aminotransferase  50.77 
 
 		 393 aa  432  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1411  aminotransferase class I and II  50.64 
 
 		 394 aa  431  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.80446 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0632  aminotransferase class I and II  52.2 
 
 		 393 aa  434  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1219  aminotransferase, class I and II  51.83 
 
 		 395 aa  433  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1438  aminotransferase class I and II  51.81 
 
 		 399 aa  431  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0371887  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1027  aspartate aminotransferase  50.76 
 
 		 400 aa  431  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000262896  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0126  aminotransferase  52.45 
 
 		 400 aa  429  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0598  aminotransferase  50.64 
 
 		 394 aa  425  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0168  aminotransferase class I and II  50.13 
 
 		 403 aa  427  1e-118  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.391722  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0082  aminotransferase  52.32 
 
 		 428 aa  426  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0510162 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2313  aminotransferase class I and II  51.67 
 
 		 393 aa  425  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2730  aminotransferase  50.13 
 
 		 394 aa  427  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1410  aminotransferase  51.55 
 
 		 403 aa  425  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0957  aspartate aminotransferase  49.75 
 
 		 404 aa  425  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000423208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2093  aminotransferase, class I and II  50.13 
 
 		 397 aa  426  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474721  normal  0.0303336 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1252  aminotransferase  50.78 
 
 		 396 aa  424  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000164192  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1203  aspartate aminotransferase  49.24 
 
 		 403 aa  419  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0124735  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0292  aminotransferase class I and II  50 
 
 		 391 aa  419  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1308  aspartate aminotransferase  50.25 
 
 		 400 aa  421  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.698251  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1823  aminotransferase  52.06 
 
 		 407 aa  421  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1263  aspartate aminotransferase  49.01 
 
 		 425 aa  421  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4268  aminotransferase  51.17 
 
 		 418 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4334  aminotransferase  50.65 
 
 		 402 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.095923  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0218  aspartate aminotransferase  49.24 
 
 		 401 aa  415  9.999999999999999e-116  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0817  aminotransferase  49.48 
 
 		 402 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.241529  normal  0.324364 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5058  aminotransferase, classes I and II  50 
 
 		 402 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0840  aminotransferase  49.48 
 
 		 402 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450019  normal  0.811052 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2764  aminotransferase  49.87 
 
 		 412 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  50.39 
 
 		 412 aa  412  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2593  aminotransferase  49.87 
 
 		 412 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2659  aminotransferase  49.87 
 
 		 412 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2545  aminotransferase  49.87 
 
 		 412 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2634  aminotransferase  49.87 
 
 		 412 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4371  aminotransferase  49.48 
 
 		 402 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4201  aminotransferase  51.44 
 
 		 405 aa  414  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62400  aminotransferase  49.48 
 
 		 411 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5431  aminotransferase  50.13 
 
 		 411 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0292  aspartate aminotransferase  50.51 
 
 		 402 aa  412  1e-114  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3611  aminotransferase  50.13 
 
 		 412 aa  412  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.890867 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02289  hypothetical protein  50.13 
 
 		 412 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.695528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1278  aminotransferase class I and II  50.13 
 
 		 412 aa  410  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1295  aminotransferase  49.87 
 
 		 407 aa  408  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1407  aminotransferase  49.48 
 
 		 413 aa  409  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1290  aminotransferase  49.87 
 
 		 412 aa  408  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0468  aminotransferase  49.48 
 
 		 402 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2668  aminotransferase  50.13 
 
 		 412 aa  410  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2918  aminotransferase  49.87 
 
 		 411 aa  409  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.116672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0854  aminotransferase  49.23 
 
 		 402 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1415  aspartate aminotransferase  48.85 
 
 		 400 aa  410  1e-113  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1466  aminotransferase  49.61 
 
 		 411 aa  410  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2516  aminotransferase  50.13 
 
 		 412 aa  410  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02250  hypothetical protein  50.13 
 
 		 412 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550748  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2583  aminotransferase  49.61 
 
 		 409 aa  409  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117889  normal  0.0369649 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2726  aminotransferase  48.71 
 
 		 411 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2748  aminotransferase  50.13 
 
 		 412 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2866  aminotransferase  49.23 
 
 		 413 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1446  aminotransferase  48.71 
 
 		 411 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1928  aminotransferase class I and II  47.56 
 
 		 390 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0165  aspartate aminotransferase  47.97 
 
 		 400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1334  aminotransferase  48.71 
 
 		 411 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1145  aspartate aminotransferase  48.48 
 
 		 402 aa  406  1.0000000000000001e-112  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0186  aspartate aminotransferase  47.72 
 
 		 400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>