224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2759 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2759  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 278 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468237  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3997  XRE family transcriptional regulator  66.79 
 
 		 278 aa  373  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  66.54 
 
 		 299 aa  366  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1979  transcriptional regulator, XRE family  65.67 
 
 		 277 aa  364  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  64.58 
 
 		 279 aa  352  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2624  transcriptional regulator, XRE family  64.93 
 
 		 274 aa  348  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2287  transcriptional regulator, XRE family  64.55 
 
 		 278 aa  348  7e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  64.81 
 
 		 295 aa  348  7e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6148  XRE family transcriptional regulator  63.06 
 
 		 284 aa  341  5.999999999999999e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.171229 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1487  XRE family transcriptional regulator  62.96 
 
 		 276 aa  339  2.9999999999999998e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5385  XRE family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 289 aa  325  6e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4719  XRE family transcriptional regulator  60.81 
 
 		 285 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3644  XRE family transcriptional regulator  60.81 
 
 		 285 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3876  XRE family transcriptional regulator  60.07 
 
 		 285 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2467  XRE family transcriptional regulator  58.97 
 
 		 285 aa  308  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3547  XRE family transcriptional regulator  60.37 
 
 		 293 aa  297  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0902  XRE family transcriptional regulator  52.22 
 
 		 284 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  42.29 
 
 		 280 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  41 
 
 		 280 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1824  transcriptional regulator, XRE family  37.74 
 
 		 259 aa  172  7.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375176 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1464  helix-turn-helix domain-containing protein  38.89 
 
 		 301 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  39.43 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1269  XRE family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2137  helix-turn-helix domain protein  38.82 
 
 		 283 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.291672  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0524  hypothetical protein  30.83 
 
 		 276 aa  159  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 283 aa  156  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  36.67 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  39.43 
 
 		 281 aa  152  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2494  helix-turn-helix domain protein  37.8 
 
 		 265 aa  151  8.999999999999999e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106258  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4128  hypothetical protein  38.13 
 
 		 287 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20270  hypothetical protein  37.76 
 
 		 277 aa  149  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.161196 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  37.82 
 
 		 277 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8368  XRE family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 288 aa  149  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  37.94 
 
 		 285 aa  146  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  39.76 
 
 		 275 aa  147  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  36.86 
 
 		 302 aa  146  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5755  XRE family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 269 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1066  helix-turn-helix domain-containing protein  36.73 
 
 		 289 aa  145  7.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1431  XRE family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 303 aa  145  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  40.3 
 
 		 289 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3065  helix-turn-helix domain protein  37.72 
 
 		 276 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3948  hypothetical protein  37.13 
 
 		 287 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00019593  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1162  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 281 aa  143  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157815  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7046  helix-turn-helix domain protein  39.02 
 
 		 278 aa  143  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2807  transcriptional regulator, XRE family  36.64 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 288 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  39.92 
 
 		 288 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  36.06 
 
 		 293 aa  142  7e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2702  helix-turn-helix domain protein  38.52 
 
 		 284 aa  142  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47890  hypothetical protein  36.67 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000556405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1731  hypothetical protein  37.97 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  35.63 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  35.79 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  37.64 
 
 		 297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  34.89 
 
 		 309 aa  138  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3211  XRE family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 263 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.663604  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14370  hypothetical protein  34.46 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4269  helix-turn-helix domain protein  37.4 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0718578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  35.21 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3439  transcriptional regulator, XRE family  36.61 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5170  XRE family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.624653  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3700  transcriptional regulator, XRE family  39.69 
 
 		 273 aa  136  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.564208  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3414  XRE family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  38.02 
 
 		 292 aa  135  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3367  transcriptional regulator, XRE family  33.86 
 
 		 278 aa  135  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0869  transcriptional regulator  39.04 
 
 		 271 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.939079  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7525  helix-turn-helix domain protein  35.79 
 
 		 294 aa  135  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3276  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 281 aa  135  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  37.21 
 
 		 298 aa  135  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0725  hypothetical protein  39.04 
 
 		 271 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0212373  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 301 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2666  helix-turn-helix domain-containing protein  37.8 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.372203  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2289  hypothetical protein  39.04 
 
 		 271 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2996  hypothetical protein  39.04 
 
 		 271 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1995  transcriptional regulator, XRE family  39.5 
 
 		 313 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000234374  normal  0.041772 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1066  transcriptional regulator, XRE family  37.45 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2182  XRE family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00977715 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1226  putative DNA-binding protein  38.65 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.179938  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1115  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2622  XRE family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1067  hypothetical protein  38.65 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1073  hypothetical protein  38.65 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  33.6 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1603  hypothetical protein  38.65 
 
 		 271 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0682  transcriptional regulator, XRE family  35.14 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3292  helix-turn-helix domain protein  35.71 
 
 		 266 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2651  XRE family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 297 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  34.73 
 
 		 293 aa  132  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0866  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 269 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4741  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 263 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678188  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3425  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 263 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  37.5 
 
 		 292 aa  131  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2471  XRE family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1766  helix-turn-helix domain protein  35.82 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2337  XRE family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146062 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1816  XRE family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2428  XRE family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1007  XRE family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 284 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>