More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2743 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2743  FeS assembly ATPase SufC  100 
 
 		 252 aa  510  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.858995  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2992  FeS assembly ATPase SufC  91.27 
 
 		 252 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0584869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2457  FeS assembly ATPase SufC  89.68 
 
 		 252 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2839  FeS assembly ATPase SufC  87.55 
 
 		 251 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1663  FeS assembly ATPase SufC  85.02 
 
 		 249 aa  444  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.193199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3967  hypothetical protein  85.48 
 
 		 250 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.147805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2327  FeS assembly ATPase SufC  81.78 
 
 		 249 aa  423  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.486674  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5930  ABC transporter associated with Fe-S cluster assembly, ATP binding protein  69.96 
 
 		 253 aa  378  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4468  FeS assembly ATPase SufC  70.68 
 
 		 249 aa  375  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0085  FeS assembly ATPase SufC  68.77 
 
 		 253 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5108  FeS assembly ATPase SufC  71.49 
 
 		 250 aa  372  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4458  FeS assembly ATPase SufC  70.28 
 
 		 250 aa  367  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236555 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4346  FeS assembly ATPase SufC  69.88 
 
 		 250 aa  364  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5847  FeS assembly ATPase SufC  70.28 
 
 		 250 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0102923  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3978  FeS assembly ATPase SufC  69.88 
 
 		 250 aa  364  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.648444 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0099  FeS assembly ATPase SufC  68.92 
 
 		 251 aa  363  1e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.842965 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0696  FeS assembly ATPase SufC  69.88 
 
 		 250 aa  361  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.730012  normal  0.0776058 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1898  FeS assembly ATPase SufC  68.13 
 
 		 262 aa  360  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111846 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2105  FeS assembly ATPase SufC  67.73 
 
 		 251 aa  359  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147981 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3966  FeS assembly ATPase SufC  68.72 
 
 		 251 aa  356  2.9999999999999997e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.304884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1467  FeS assembly ATPase SufC  66.53 
 
 		 251 aa  354  5.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0406739  normal  0.0473468 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2254  FeS assembly ATPase SufC  67.62 
 
 		 251 aa  352  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2436  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  66.8 
 
 		 251 aa  352  2.9999999999999997e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0558261  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0932  ABC transporter, ATP-binding protein  66.53 
 
 		 251 aa  351  7e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0926  FeS assembly ATPase SufC  67.62 
 
 		 280 aa  350  1e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262969  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2591  FeS assembly ATPase SufC  66.53 
 
 		 248 aa  344  6e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308919  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1780  FeS assembly ATPase SufC  67.62 
 
 		 251 aa  344  8.999999999999999e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2271  FeS assembly ATPase SufC  66.8 
 
 		 247 aa  342  4e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193787  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3261  FeS assembly ATPase SufC  68.35 
 
 		 249 aa  341  7e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2572  FeS assembly ATPase SufC  61.78 
 
 		 273 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.023273  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1627  ATP-dependent transporter  64.75 
 
 		 251 aa  337  9.999999999999999e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  hitchhiker  0.00197674 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2360  FeS assembly ATPase SufC  66.39 
 
 		 252 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2359  FeS assembly ATPase SufC  64.49 
 
 		 251 aa  332  2e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0744397 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1607  FeS assembly ATPase SufC  65.86 
 
 		 249 aa  331  7.000000000000001e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00745955 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0811  FeS assembly ATPase SufC  61.89 
 
 		 251 aa  325  3e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0160025  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5778  FeS assembly ATPase SufC  64.32 
 
 		 252 aa  325  5e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0175  FeS assembly ATPase SufC  62.24 
 
 		 251 aa  323  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.000000823487 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0817  ABC transporter ATP-binding protein  61.79 
 
 		 280 aa  323  2e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01978  FeS assembly ATPase SufC  62.66 
 
 		 254 aa  321  6e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.486472  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0728  FeS assembly ATPase SufC  61.38 
 
 		 280 aa  321  6e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1317  FeS assembly ATPase SufC  61.02 
 
 		 254 aa  320  9.999999999999999e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00252118  normal  0.400998 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1345  FeS assembly ATPase SufC  58.63 
 
 		 261 aa  319  3e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  hitchhiker  0.0000000997935 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0671  FeS assembly ATPase SufC  60.66 
 
 		 247 aa  318  7.999999999999999e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.814843  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0437  SUF C, ATPase  65.71 
 
 		 252 aa  317  1e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0879346  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0999  FeS assembly ATPase SufC  61.98 
 
 		 256 aa  317  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3310  FeS assembly ATPase SufC  64.14 
 
 		 257 aa  316  2e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0266816 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3283  FeS assembly ATPase SufC  62.5 
 
 		 257 aa  316  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429528  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3444  FeS assembly ATPase SufC  62.35 
 
 		 260 aa  315  4e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0371851  hitchhiker  0.0000000668282 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3152  FeS assembly ATPase SufC  60.17 
 
 		 253 aa  315  4e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0929379  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0726  FeS assembly ATPase SufC  61.04 
 
 		 249 aa  315  6e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.860961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2489  FeS assembly ATPase SufC  60.98 
 
 		 258 aa  314  8e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1245  FeS assembly ATPase SufC  65.98 
 
 		 251 aa  314  8e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2917  FeS assembly ATPase SufC  60.74 
 
 		 247 aa  313  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.749779  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1234  FeS assembly ATPase SufC  62.24 
 
 		 250 aa  313  9.999999999999999e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0241  hypothetical protein  60.08 
 
 		 249 aa  313  9.999999999999999e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0425  FeS assembly ATPase SufC  60.8 
 
 		 262 aa  312  2.9999999999999996e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0197  FeS assembly ATPase SufC  60.74 
 
 		 247 aa  311  3.9999999999999997e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2092  FeS assembly ATPase SufC  64.9 
 
 		 252 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0991  FeS assembly ATPase SufC  58.73 
 
 		 254 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2023  FeS assembly ATPase SufC  61.38 
 
 		 254 aa  310  1e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1861  FeS assembly ATPase SufC  63.22 
 
 		 263 aa  310  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0977  iron-regulated ABC transporter, ATP-binding protein  57.66 
 
 		 253 aa  310  1e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  60.17 
 
 		 248 aa  310  1e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1415  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  58.63 
 
 		 249 aa  310  2e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.901133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1468  cysteine desulfurase ATPase component  59.35 
 
 		 248 aa  308  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.630642  normal  0.055193 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1971  cysteine desulfurase ATPase component  59.35 
 
 		 248 aa  308  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000984202 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1503  cysteine desulfurase ATPase component  59.35 
 
 		 248 aa  308  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524279  hitchhiker  0.000000451745 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1800  cysteine desulfurase ATPase component  59.35 
 
 		 248 aa  308  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.018304  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1484  cysteine desulfurase ATPase component  59.35 
 
 		 248 aa  308  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000473069 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  58.87 
 
 		 250 aa  307  1.0000000000000001e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4270  FeS assembly ATPase SufC  58.78 
 
 		 256 aa  306  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0538  FeS assembly ATPase SufC  58.63 
 
 		 250 aa  306  2.0000000000000002e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703052  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0797  FeS assembly ATPase SufC  59.84 
 
 		 261 aa  305  4.0000000000000004e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.554265  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1736  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  59.2 
 
 		 261 aa  305  5.0000000000000004e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1763  cysteine desulfurase ATPase component  58.13 
 
 		 248 aa  305  6e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0226116  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1949  cysteine desulfurase ATPase component  58.13 
 
 		 248 aa  305  6e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1762  cysteine desulfurase ATPase component  58.54 
 
 		 248 aa  304  8.000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.129847  hitchhiker  0.0000268298 
 
 
-
 
NC_002950  PG0258  ABC transporter, ATP-binding protein  58.54 
 
 		 250 aa  303  1.0000000000000001e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0653  hypothetical protein  57.72 
 
 		 250 aa  303  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4356  FeS assembly ATPase SufC  58.63 
 
 		 271 aa  303  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.563554 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1960  FeS assembly ATPase SufC  57.72 
 
 		 248 aa  302  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.470246  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1883  cysteine desulfurase ATPase component  57.72 
 
 		 248 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.729578  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1898  cysteine desulfurase ATPase component  57.72 
 
 		 248 aa  302  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00275975  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1898  FeS assembly ATPase SufC  59.51 
 
 		 261 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01651  cysteine desulfurase ATPase component  57.72 
 
 		 248 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00149783  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2396  cysteine desulfurase ATPase component  57.72 
 
 		 248 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0319212  hitchhiker  0.000467417 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1514  cysteine desulfurase ATPase component  57.72 
 
 		 248 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113093 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01641  hypothetical protein  57.72 
 
 		 248 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0013785  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0637  hypothetical protein  57.32 
 
 		 250 aa  301  6.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1699  FeS assembly ATPase SufC  57.25 
 
 		 257 aa  300  1e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1236  FeS assembly ATPase SufC  58.51 
 
 		 246 aa  298  5e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01361  ABC transporter, ATP binding component  59.09 
 
 		 263 aa  298  6e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.16399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1435  FeS assembly ATPase SufC  59.09 
 
 		 263 aa  298  7e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.157604  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1743  cysteine desulfurase ATPase component  58.92 
 
 		 248 aa  298  8e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0361641  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3039  FeS assembly ATPase SufC  57.68 
 
 		 255 aa  297  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0647641 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1849  cysteine desulfurase ATPase component  58.51 
 
 		 248 aa  296  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116243  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2181  cysteine desulfurase ATPase component  58.51 
 
 		 248 aa  295  7e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0257166  hitchhiker  0.000554392 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0427  FeS assembly ATPase SufC  58.3 
 
 		 256 aa  294  8e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0416  FeS assembly ATPase SufC  58.3 
 
 		 256 aa  294  8e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2750  cysteine desulfurase ATPase component  57.44 
 
 		 248 aa  294  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0544511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>