More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2671 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_2671  ABC transporter related  100 
 
 
314 aa  624  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1442  ABC transporter related  66.78 
 
 
315 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0926  ABC transporter-related protein  41.52 
 
 
290 aa  236  3e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00057204  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0438  ABC transporter related  45.42 
 
 
289 aa  225  9e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0680  ABC transporter related  41.09 
 
 
309 aa  223  2e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1995  ABC transporter related  44.36 
 
 
289 aa  223  4e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0322  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  42.05 
 
 
296 aa  221  8e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0345  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  42.05 
 
 
294 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.127515  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1712  ATPase  45.82 
 
 
299 aa  218  1e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0582  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA (Sulfate-transporting ATPase)  46.21 
 
 
291 aa  216  5e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0371  ABC transporter related  48.48 
 
 
302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0417  ABC transporter related  45.77 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2281  RNA pseudouridine synthase  42.29 
 
 
285 aa  212  7e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1716  ABC transporter related protein  46.59 
 
 
286 aa  211  1e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.604131  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3143  ABC transporter related  47.28 
 
 
275 aa  208  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0360  molybdenum transport ATP-binding protein  43.18 
 
 
283 aa  204  1e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2243  ABC transporter related  46.79 
 
 
281 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2342  ABC transporter related protein  53.3 
 
 
274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477655  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0315  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA (Sulfate-transporting ATPase)  45.62 
 
 
284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.599525  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  44.14 
 
 
338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0454  ABC transporter-related protein  45.76 
 
 
301 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.457213  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  45.34 
 
 
357 aa  179  5.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1034  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.78 
 
 
359 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.330861  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.19 
 
 
349 aa  179  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2664  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.29 
 
 
384 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0379028  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1284  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  37.11 
 
 
289 aa  178  1e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2195  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  48.34 
 
 
339 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643313  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1788  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.11 
 
 
370 aa  177  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0149  ABC transporter-like protein  38.02 
 
 
343 aa  177  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.661807  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3244  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  38.58 
 
 
384 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  0.910388 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3520  ATPase  46.91 
 
 
243 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7604  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.8 
 
 
413 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2789  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.39 
 
 
337 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.669148  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1556  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  34.94 
 
 
385 aa  177  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.57271  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1495  sulphate transport system permease protein 1  47.06 
 
 
338 aa  177  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625572  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1903  sulphate transport system permease protein 1  47.62 
 
 
343 aa  176  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000843013  hitchhiker  0.000000000000895278 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7192  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.66 
 
 
361 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.27359  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1579  ABC transporter related  44.64 
 
 
259 aa  175  8e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5731  ABC transporter-related protein  43.97 
 
 
343 aa  175  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2107  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.53 
 
 
363 aa  175  9e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.06 
 
 
359 aa  175  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0835  ABC transporter related  44.76 
 
 
241 aa  175  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2398  ABC transporter  38.32 
 
 
384 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0142955  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3492  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.45 
 
 
343 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.993193  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.59 
 
 
356 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3479  sulphate transport system permease protein 1  41.45 
 
 
343 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3542  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.45 
 
 
343 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3817  polyamine ABC transporter ATP-binding protein  36.82 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217368  normal  0.691578 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2487  ABC transporter related  40.69 
 
 
379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00872773  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  48.73 
 
 
364 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  47.32 
 
 
353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  39.12 
 
 
342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1465  ABC transporter related  40.31 
 
 
371 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.778579  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  45.1 
 
 
356 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4110  ABC transporter related  46.19 
 
 
345 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 
343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1932  ABC transporter related  37.99 
 
 
382 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0195576 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4043  ABC transporter related  47.78 
 
 
353 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0310974  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2088  ABC transporter related  38.89 
 
 
382 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.619396  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.2 
 
 
352 aa  173  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1391  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  48.33 
 
 
350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5129  ABC transporter related  43.62 
 
 
370 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.701996  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5048  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.83 
 
 
338 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.9 
 
 
353 aa  172  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  42.51 
 
 
333 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4651  ABC transporter related  45.7 
 
 
367 aa  172  5.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1199  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  43.24 
 
 
357 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4362  ABC transporter related  39.76 
 
 
355 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04080  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  35.14 
 
 
316 aa  172  6.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.716043 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3450  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.37 
 
 
351 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.67 
 
 
356 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  43.56 
 
 
336 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0376  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.47 
 
 
380 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000938132  hitchhiker  0.00113993 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3403  sulphate transport system permease protein 1  49.76 
 
 
356 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.270321  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1455  ABC transporter related  39.61 
 
 
380 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1952  ABC transporter related  38.49 
 
 
382 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  45.09 
 
 
328 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50700  ABC transporter ATP binding component  48.75 
 
 
316 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.933141  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.17 
 
 
372 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  45.1 
 
 
353 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5375  ABC transporter related  46.57 
 
 
387 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0766723  normal  0.734389 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.19 
 
 
375 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3450  ABC transporter related  39.2 
 
 
384 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622564  normal  0.365938 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  45.1 
 
 
353 aa  171  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4035  sulfate ABC transporter ATPase subunit  44.2 
 
 
338 aa  171  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1270  ABC transporter related  45.28 
 
 
361 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.117767  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.29 
 
 
357 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  43.2 
 
 
368 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0239  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.11 
 
 
402 aa  171  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0746  ABC transporter related  39.61 
 
 
380 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2681  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.03 
 
 
344 aa  170  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255864  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.43 
 
 
377 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  46.86 
 
 
342 aa  170  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  47.14 
 
 
374 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0390  ABC transporter related  46.34 
 
 
352 aa  171  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0559  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.03 
 
 
327 aa  170  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.387345 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3091  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.04 
 
 
330 aa  170  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1186  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.04 
 
 
330 aa  170  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.67 
 
 
375 aa  170  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.67 
 
 
375 aa  170  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>