69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2596 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2596  Acireductone dioxygenase ARD  100 
 
 		 165 aa  325  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00332409  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4156  Acireductone dioxygenase ARD  44.85 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1146  Acireductone dioxygenase ARD  46.79 
 
 		 182 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1176  Acireductone dioxygenase ARD  46.79 
 
 		 182 aa  107  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0595  Acireductone dioxygenase ARD  42.14 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.415363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0433  dioxygenase, ARD/ARD' family  42.14 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3175  acireductone dioxygenase ARD  48.54 
 
 		 176 aa  102  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178399  hitchhiker  0.00313013 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2668  acireductone dioxygenase, ARD  34.86 
 
 		 181 aa  98.2  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.564741 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1265  Acireductone dioxygenase ARD  38.78 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1141  acireductone dioxygenase, ARD  37.21 
 
 		 180 aa  80.9  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4291  hypothetical protein  31.79 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0920  Acireductone dioxygenase ARD  36.22 
 
 		 180 aa  77.8  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0887  Acireductone dioxygenase ARD  33.33 
 
 		 180 aa  77  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.266171  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0608  hypothetical protein  32.89 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.938645 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21601  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2'-like protein  37.62 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0740094 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0944  acireductone dioxygenase ARD  35.19 
 
 		 180 aa  73.9  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2021  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2'-like  37.11 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2624  Acireductone dioxygenase ARD  37.37 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1513  Acireductone dioxygenase ARD  37.37 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.354648  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0094  Acireductone dioxygenase ARD  33.55 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00113178  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0775  hypothetical protein  25.43 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.123063  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3301  Acireductone dioxygenase ARD  33.33 
 
 		 181 aa  70.9  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3455  Acireductone dioxygenase ARD  33.33 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0018  acireductone dioxygenase, ARD  38.14 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1853  acireductone dioxygenase ARD  33.53 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0739842  normal  0.0828134 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1090  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  36.17 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2046  ARD/ARD' family protein  32.46 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00213486  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4148  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  35 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4249  Acireductone dioxygenase ARD  31.3 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262659  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3781  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  31.58 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566667  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1856  acireductone dioxygenase, ARD  32.46 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0338942  normal  0.893341 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4170  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  31.58 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000017557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4106  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase, putative  35 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3868  acireductone dioxygenase ARD  30.83 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4060  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  36.08 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3796  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  36.08 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3949  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  36.08 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4258  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  36.08 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1725  acireductone dioxygenase, ARD  33.33 
 
 		 201 aa  67.4  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2738  acireductone dioxygenase ARD  34 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00558857  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3319  acireductone dioxygenase ARD  31.48 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06080  dioxygenase  30.3 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00847  dioxygenase  30.3 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00184513  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1344  acireductone dioxygenase ARD  30.23 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3180  ARD/ARD' family dioxygenase  31.48 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3329  ARD/ARD' family dioxygenase  31.48 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.780596 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0651  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2' -like  33.55 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.573573  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1748  Acireductone dioxygenase ARD  30.46 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23790  Acireductone dioxygenase, ARD  34.34 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0798  ARD/ARD' family dioxygenase  30.97 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.665186  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1411  methionine salvage pathway enzyme  30.56 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.13404  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1414  Acireductone dioxygenase ARD  35.05 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1549  Acireductone dioxygenase ARD  33.03 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0853  Acireductone dioxygenase ARD  35.85 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1781  Acireductone dioxygenase ARD  30.56 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.242318 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42730  putative oxidase  31.86 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2725  Acireductone dioxygenase ARD  31.82 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3588  putative oxidase  31.86 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2511  putative oxidase  28.22 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0908  acireductone dioxygenase, ARD  32.32 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25000  predicted protein  34.78 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.19447  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03570  hypothetical protein  29.1 
 
 		 224 aa  54.3  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874392  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37619  conserved hypothetical protein  30.63 
 
 		 178 aa  51.6  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0987  Acireductone dioxygenase ARD  34.25 
 
 		 189 aa  47.8  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06576  ARD/ARD family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04430)  30.19 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0679  normal  0.134553 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2617  hypothetical protein  29.41 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.796687  normal  0.318237 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0812  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.88 
 
 		 91 aa  43.9  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000379382  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4778  hypothetical protein  38.3 
 
 		 124 aa  43.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0156379  hitchhiker  0.00784209 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5012  hypothetical protein  37.7 
 
 		 155 aa  40.8  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120588  normal  0.173507 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>