More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2586 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 435 aa  858    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  46.31 
 
 		 461 aa  348  9e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  44.76 
 
 		 442 aa  342  7e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  42.52 
 
 		 468 aa  339  5e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  42.48 
 
 		 439 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 435 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 435 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 435 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  41.47 
 
 		 439 aa  328  9e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  42.24 
 
 		 439 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  41.98 
 
 		 437 aa  325  9e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  45.19 
 
 		 440 aa  325  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  41.11 
 
 		 461 aa  323  4e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  41.11 
 
 		 461 aa  323  4e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  41.11 
 
 		 461 aa  323  4e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.89 
 
 		 437 aa  322  6e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  41.39 
 
 		 450 aa  322  7e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  45.04 
 
 		 437 aa  322  8e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 439 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 439 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 439 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 439 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  40 
 
 		 439 aa  315  8e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  40 
 
 		 439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  39.66 
 
 		 439 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  43.22 
 
 		 435 aa  313  4.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  44.68 
 
 		 439 aa  313  4.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  41.89 
 
 		 450 aa  312  5.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  39.95 
 
 		 447 aa  312  6.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  41.35 
 
 		 456 aa  312  9e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  41.02 
 
 		 446 aa  311  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  42 
 
 		 441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  41.97 
 
 		 433 aa  309  8e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0384  major facilitator family transporter  39.91 
 
 		 453 aa  308  1.0000000000000001e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  42.03 
 
 		 430 aa  307  2.0000000000000002e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  40.61 
 
 		 452 aa  307  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  43.77 
 
 		 439 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  43.41 
 
 		 460 aa  306  6e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  43.41 
 
 		 460 aa  306  6e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1342  major facilitator superfamily transporter  40.7 
 
 		 450 aa  306  7e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4765  major facilitator transporter  41.11 
 
 		 442 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  42.56 
 
 		 445 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 445 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 445 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  40.23 
 
 		 452 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5058  major facilitator superfamily MFS_1  38.37 
 
 		 468 aa  304  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181226  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 445 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  40.33 
 
 		 447 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  38.05 
 
 		 459 aa  302  7.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  41.47 
 
 		 442 aa  301  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  40.28 
 
 		 442 aa  301  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  40 
 
 		 439 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  41.26 
 
 		 452 aa  301  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  37.56 
 
 		 465 aa  300  3e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  40.24 
 
 		 439 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  41.94 
 
 		 441 aa  300  4e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1103  major facilitator family transporter  40.5 
 
 		 464 aa  300  4e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.338347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.2 
 
 		 438 aa  299  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  39.9 
 
 		 438 aa  299  7e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1594  major facilitator transporter  42.67 
 
 		 442 aa  298  9e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000379312 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  40.93 
 
 		 450 aa  298  9e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4465  major facilitator transporter  40.96 
 
 		 460 aa  298  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5078  major facilitator transporter  41.43 
 
 		 444 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  40.2 
 
 		 430 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  42.23 
 
 		 446 aa  296  5e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  42.45 
 
 		 445 aa  295  9e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  36.89 
 
 		 458 aa  295  9e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1002  major facilitator superfamily MFS_1  34.92 
 
 		 468 aa  295  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.101841 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  36.16 
 
 		 465 aa  295  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  38.31 
 
 		 435 aa  294  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  41.98 
 
 		 460 aa  294  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  41.11 
 
 		 443 aa  293  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  38.37 
 
 		 430 aa  293  4e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  37.59 
 
 		 484 aa  293  5e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  41.29 
 
 		 465 aa  293  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  40.67 
 
 		 461 aa  293  6e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  40.73 
 
 		 438 aa  290  4e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  40.73 
 
 		 438 aa  290  4e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  40.73 
 
 		 438 aa  290  4e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  40.43 
 
 		 438 aa  289  6e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4783  major facilitator superfamily MFS_1  38.99 
 
 		 474 aa  289  6e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 459 aa  289  7e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  40.68 
 
 		 441 aa  288  9e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  40.49 
 
 		 438 aa  288  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  40.49 
 
 		 438 aa  288  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  37.8 
 
 		 434 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  37.96 
 
 		 435 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  39.61 
 
 		 438 aa  286  4e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  38.98 
 
 		 445 aa  286  4e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  37.96 
 
 		 435 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  37.96 
 
 		 435 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  36.38 
 
 		 459 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  43.1 
 
 		 438 aa  285  8e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  37.96 
 
 		 435 aa  285  9e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  39.39 
 
 		 433 aa  285  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  40.24 
 
 		 438 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3547  major facilitator transporter  41.24 
 
 		 440 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189326  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  38.12 
 
 		 431 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0251  shikimate transporter  39.39 
 
 		 433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0233  shikimate transporter  39.39 
 
 		 433 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.30942  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>