90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2540 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2540  flagellin  100 
 
 		 892 aa  1682    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4438  flagellin  66.22 
 
 		 886 aa  1016    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3800  flagellin  66 
 
 		 886 aa  996    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3814  flagellin  81.28 
 
 		 888 aa  1307    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4452  flagellin  82.96 
 
 		 888 aa  1379    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438814  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1670  flagellin  65.6 
 
 		 762 aa  668    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2370  flagellin  61.5 
 
 		 737 aa  592  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1490  flagellin  60.07 
 
 		 753 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1488  flagellin  61 
 
 		 735 aa  572  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.723636  normal  0.726949 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1489  flagellin  64.4 
 
 		 746 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.671791 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1104  hypothetical protein  56.5 
 
 		 523 aa  359  9.999999999999999e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.926496  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5527  putative flagellin protein, C-terminus  55.9 
 
 		 523 aa  332  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1336  hypothetical protein  66.43 
 
 		 528 aa  325  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1105  hypothetical protein  48.67 
 
 		 536 aa  312  2e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0838477  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5528  putative flagellin protein, C-terminus  52.12 
 
 		 514 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.757214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0522  hypothetical protein  52.12 
 
 		 522 aa  303  7.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0559459  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5530  putative flagellin protein, C-terminus  52.8 
 
 		 516 aa  301  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1337  hypothetical protein  49.51 
 
 		 537 aa  300  8e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3880  flagellin hook IN repeat protein  48.48 
 
 		 1562 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.411065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0543  flagellin hook IN repeat-containing protein  47.88 
 
 		 693 aa  210  8e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0686  flagellin hook IN repeat-containing protein  46.91 
 
 		 692 aa  205  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153449  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6936  hypothetical protein  44.67 
 
 		 620 aa  193  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5088  hypothetical protein  38.05 
 
 		 630 aa  189  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7243  hypothetical protein  54.34 
 
 		 578 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2995  hypothetical protein  58.19 
 
 		 405 aa  174  9e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2501  hypothetical protein  58.19 
 
 		 405 aa  172  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3020  hypothetical protein  56.5 
 
 		 405 aa  172  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762369  normal  0.12294 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1408  hypothetical protein  54.75 
 
 		 399 aa  172  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5762  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  52.53 
 
 		 420 aa  172  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2012  hypothetical protein  52.02 
 
 		 572 aa  171  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.999486 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6415  hypothetical protein  56.5 
 
 		 405 aa  171  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1246  hypothetical protein  54.19 
 
 		 399 aa  169  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2500  hypothetical protein  54.24 
 
 		 405 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1247  hypothetical protein  54.75 
 
 		 399 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1193  hypothetical protein  53.63 
 
 		 397 aa  162  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267898  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2551  putative flagellin protein, C-terminus  53.25 
 
 		 375 aa  157  7e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.345131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1194  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  54.89 
 
 		 400 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206866  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0238  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  52 
 
 		 432 aa  151  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2552  hypothetical protein  48.52 
 
 		 393 aa  150  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3332  flagellin domain-containing protein  38.86 
 
 		 300 aa  115  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3370  flagellin domain protein  42.11 
 
 		 275 aa  109  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0519137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0087  flagellin domain protein  38.92 
 
 		 272 aa  108  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.01522e-16 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3371  flagellin domain protein  42.5 
 
 		 275 aa  107  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0467531  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2486  flagellin domain protein  40.12 
 
 		 272 aa  105  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0106  flagellin domain protein  38.6 
 
 		 272 aa  105  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.298157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3830  flagellin domain protein  38.32 
 
 		 272 aa  104  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0123845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1762  flagellin domain protein  39.52 
 
 		 272 aa  103  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3746  flagellin domain protein  38.01 
 
 		 272 aa  103  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  35.48 
 
 		 289 aa  96.3  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  42.11 
 
 		 547 aa  76.3  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3292  hypothetical protein  32.75 
 
 		 260 aa  67.4  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  33.33 
 
 		 273 aa  66.2  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  32.12 
 
 		 273 aa  63.9  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  31.47 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  33.94 
 
 		 272 aa  56.2  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  28.82 
 
 		 292 aa  56.6  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  26.07 
 
 		 320 aa  56.6  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  28.93 
 
 		 301 aa  57  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  40.62 
 
 		 289 aa  56.2  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  27.92 
 
 		 302 aa  55.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  29.17 
 
 		 275 aa  56.2  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  32.26 
 
 		 273 aa  55.1  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  29.44 
 
 		 301 aa  54.7  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  26.4 
 
 		 302 aa  53.9  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  28.4 
 
 		 274 aa  53.1  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  35.87 
 
 		 395 aa  53.5  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  27.92 
 
 		 302 aa  52.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  24.47 
 
 		 320 aa  52.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  30 
 
 		 293 aa  52  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  24.47 
 
 		 320 aa  52  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3817  hypothetical protein  47.73 
 
 		 598 aa  52  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  27.91 
 
 		 277 aa  52  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  25.12 
 
 		 321 aa  51.2  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  33.7 
 
 		 395 aa  50.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  33.33 
 
 		 395 aa  50.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  25.12 
 
 		 320 aa  50.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  38.89 
 
 		 389 aa  49.7  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  29.69 
 
 		 311 aa  49.3  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2286  flagellin domain-containing protein  27.07 
 
 		 282 aa  49.3  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  25.89 
 
 		 302 aa  48.9  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  26.77 
 
 		 303 aa  48.5  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2570  flagellin domain protein  30.93 
 
 		 288 aa  48.5  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  26.47 
 
 		 274 aa  48.1  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0770  flagellar hook-associated protein 3  29.41 
 
 		 305 aa  48.1  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0622  flagellin domain-containing protein  35.29 
 
 		 266 aa  48.1  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  37.5 
 
 		 380 aa  48.1  0.0007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  26.04 
 
 		 277 aa  47.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0677  flagellin domain-containing protein  30.68 
 
 		 585 aa  47.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  33.77 
 
 		 320 aa  44.7  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5741  flagellin domain-containing protein  31.07 
 
 		 439 aa  44.3  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>