More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2530 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 608 aa  1215    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  44.5 
 
 		 740 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  39.38 
 
 		 1827 aa  410  1e-113  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  43.23 
 
 		 578 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  40.92 
 
 		 615 aa  385  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  40.42 
 
 		 620 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  41.2 
 
 		 601 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  39.77 
 
 		 620 aa  382  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  41.09 
 
 		 574 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  42.76 
 
 		 703 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  40.77 
 
 		 747 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  40.59 
 
 		 602 aa  363  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  41.01 
 
 		 626 aa  362  9e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  41.96 
 
 		 767 aa  362  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  38.8 
 
 		 955 aa  359  9e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  40.36 
 
 		 626 aa  355  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  40.49 
 
 		 614 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  40.49 
 
 		 614 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  40.49 
 
 		 614 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  40.49 
 
 		 614 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  37.93 
 
 		 648 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  40.19 
 
 		 626 aa  353  7e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  40.84 
 
 		 577 aa  352  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  41.12 
 
 		 1450 aa  351  2e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  39.02 
 
 		 636 aa  349  9e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  40.33 
 
 		 639 aa  348  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  39.02 
 
 		 612 aa  347  5e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  41.98 
 
 		 747 aa  342  8e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  39.28 
 
 		 637 aa  342  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.32 
 
 		 689 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  41.65 
 
 		 688 aa  341  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 614 aa  339  7e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  40.68 
 
 		 523 aa  338  1.9999999999999998e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  40.81 
 
 		 649 aa  334  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  40.81 
 
 		 649 aa  334  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 		 3145 aa  332  1e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  40.81 
 
 		 646 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  38.36 
 
 		 635 aa  329  8e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  38.36 
 
 		 635 aa  329  8e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  38.2 
 
 		 611 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  38.4 
 
 		 714 aa  327  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  40.43 
 
 		 935 aa  326  8.000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  40.1 
 
 		 714 aa  325  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  41.7 
 
 		 542 aa  324  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  40.91 
 
 		 520 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  39.03 
 
 		 556 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  35.3 
 
 		 615 aa  310  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  41.35 
 
 		 1038 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  40.27 
 
 		 457 aa  310  6.999999999999999e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  36.6 
 
 		 662 aa  309  8e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  41.27 
 
 		 1005 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.83 
 
 		 1034 aa  302  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 637 aa  301  2e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 		 681 aa  300  6e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  42.51 
 
 		 636 aa  298  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  35.32 
 
 		 592 aa  297  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  37.56 
 
 		 780 aa  291  3e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.44 
 
 		 760 aa  281  4e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  40.98 
 
 		 529 aa  279  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  38.73 
 
 		 1677 aa  275  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  34.34 
 
 		 653 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 		 653 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  38.5 
 
 		 472 aa  273  7e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  45.27 
 
 		 387 aa  272  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  39.7 
 
 		 473 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  39.33 
 
 		 550 aa  271  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0550  TPR repeat-containing protein  38.45 
 
 		 595 aa  271  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.492764  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  37.78 
 
 		 1212 aa  269  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  36.46 
 
 		 558 aa  268  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  42.29 
 
 		 412 aa  268  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  38.92 
 
 		 540 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  39.76 
 
 		 872 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  28.71 
 
 		 603 aa  267  4e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  33.6 
 
 		 1077 aa  266  5.999999999999999e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.55 
 
 		 454 aa  266  8.999999999999999e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  36.25 
 
 		 484 aa  257  4e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  36.83 
 
 		 527 aa  256  8e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  32.42 
 
 		 1451 aa  253  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  32.42 
 
 		 1454 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 		 611 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  35.76 
 
 		 438 aa  243  6e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  35.74 
 
 		 546 aa  242  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  30.54 
 
 		 583 aa  239  9e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  37.58 
 
 		 545 aa  239  9e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0955  TPR domain-containing protein  40.66 
 
 		 705 aa  239  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497218  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  37.58 
 
 		 545 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.63 
 
 		 604 aa  238  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.83 
 
 		 545 aa  236  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  36.31 
 
 		 559 aa  236  7e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  38.33 
 
 		 496 aa  236  8e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 607 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  37.96 
 
 		 600 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  34.13 
 
 		 1764 aa  235  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  38.16 
 
 		 502 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  38.16 
 
 		 502 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1511  TPR domain-containing protein  31.35 
 
 		 525 aa  232  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000212111  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 		 607 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 		 566 aa  231  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  38.49 
 
 		 502 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  36.7 
 
 		 593 aa  231  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>