More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2528 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
991 aa  2014    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  34.19 
 
 
751 aa  391  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  31.14 
 
 
825 aa  389  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  52.12 
 
 
454 aa  389  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  42.89 
 
 
1328 aa  337  7.999999999999999e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.65 
 
 
1424 aa  328  4.0000000000000003e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  42.89 
 
 
924 aa  321  5e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  44.28 
 
 
1215 aa  318  3e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  45.18 
 
 
1507 aa  316  1.9999999999999998e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  44.59 
 
 
1039 aa  311  5e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  39.08 
 
 
725 aa  310  6.999999999999999e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  48.33 
 
 
911 aa  308  3e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.54 
 
 
771 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  50.49 
 
 
568 aa  302  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  50.49 
 
 
568 aa  302  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.58 
 
 
787 aa  298  3e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  36.9 
 
 
1288 aa  294  5e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  39.13 
 
 
1105 aa  293  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.63 
 
 
767 aa  285  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  25.82 
 
 
919 aa  282  2e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  35.91 
 
 
1050 aa  278  4e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.38 
 
 
885 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  47.2 
 
 
444 aa  270  1e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  40.27 
 
 
1131 aa  262  3e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  45.31 
 
 
362 aa  255  4.0000000000000004e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  34.89 
 
 
1262 aa  254  5.000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  38.31 
 
 
1185 aa  243  1e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  54.24 
 
 
284 aa  243  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  36.27 
 
 
1488 aa  242  2e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.44 
 
 
1186 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  42.19 
 
 
843 aa  238  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  38.64 
 
 
1128 aa  233  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  38.06 
 
 
1044 aa  232  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  36.36 
 
 
493 aa  228  3e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  45.35 
 
 
311 aa  228  4e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  44.9 
 
 
919 aa  225  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  35.98 
 
 
953 aa  220  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  35.71 
 
 
799 aa  219  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  40.53 
 
 
814 aa  216  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  42.42 
 
 
672 aa  211  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  37.12 
 
 
443 aa  201  6e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  51.01 
 
 
212 aa  197  7e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  39.77 
 
 
680 aa  196  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  34.35 
 
 
1125 aa  194  7e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  50.23 
 
 
785 aa  192  2.9999999999999997e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  33.14 
 
 
822 aa  191  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  32.74 
 
 
828 aa  190  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  38.73 
 
 
977 aa  186  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  33.18 
 
 
1290 aa  184  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  39.39 
 
 
963 aa  177  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  33.99 
 
 
732 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 
776 aa  176  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  50.28 
 
 
190 aa  173  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  40.95 
 
 
481 aa  170  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  33.6 
 
 
1056 aa  167  8e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  32.07 
 
 
669 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  34.47 
 
 
949 aa  161  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  31.09 
 
 
1068 aa  158  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  30.64 
 
 
1088 aa  156  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 
837 aa  152  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1855  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.47 
 
 
667 aa  152  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 
469 aa  151  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  28.94 
 
 
1040 aa  151  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  33 
 
 
1475 aa  149  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.03 
 
 
968 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  23.4 
 
 
1550 aa  149  3e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  34.05 
 
 
1028 aa  148  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  28.76 
 
 
2145 aa  147  1e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06956  conserved hypothetical protein  40.49 
 
 
304 aa  141  7e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  32.56 
 
 
577 aa  141  7.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  29.98 
 
 
1136 aa  138  6.0000000000000005e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  32.82 
 
 
1146 aa  136  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  25.6 
 
 
1404 aa  136  1.9999999999999998e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  25.7 
 
 
740 aa  133  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 
937 aa  132  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  30.23 
 
 
1212 aa  131  6e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 
1283 aa  129  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  24.78 
 
 
694 aa  128  6e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  29.85 
 
 
1324 aa  127  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  38.24 
 
 
702 aa  126  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.277202 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  29.58 
 
 
851 aa  124  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 
966 aa  122  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  30.75 
 
 
713 aa  121  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  30.68 
 
 
1676 aa  120  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  26.06 
 
 
708 aa  120  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  25.47 
 
 
857 aa  119  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3535  tetratricopeptide TPR_4  30.61 
 
 
934 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.155601 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  26.07 
 
 
686 aa  114  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.94 
 
 
841 aa  112  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  27.11 
 
 
1228 aa  111  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5157  hypothetical protein  38.16 
 
 
178 aa  111  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  31.71 
 
 
801 aa  110  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  27.41 
 
 
1106 aa  109  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4175  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.18 
 
 
854 aa  109  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  23.61 
 
 
1054 aa  106  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2501  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  38.17 
 
 
1036 aa  104  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120058  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1510  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 
303 aa  104  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0607189 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2362  serine/threonine protein kinase  27.19 
 
 
1435 aa  103  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0458945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  26.25 
 
 
1314 aa  103  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  31.27 
 
 
1479 aa  103  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0837409 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>