More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2508 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_2508  Glutathione S-transferase domain  100 
 
 
214 aa  430  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6685  glutathione S-transferase  72.9 
 
 
214 aa  322  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3695  Glutathione S-transferase domain  62.19 
 
 
215 aa  266  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0434501  hitchhiker  0.00000154046 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1699  Glutathione S-transferase domain protein  63.45 
 
 
211 aa  247  8e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0537  Glutathione S-transferase domain  56.1 
 
 
222 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213809  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0524  Glutathione S-transferase domain protein  57.65 
 
 
222 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3564  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.73 
 
 
211 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.146055  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3382  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.81 
 
 
219 aa  234  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485104  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5220  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.81 
 
 
219 aa  234  8e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0962693  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4826  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.2 
 
 
211 aa  232  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3512  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1358  Glutathione S-transferase domain  58.21 
 
 
206 aa  231  7.000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.462445  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0607  putative glutathione S-transferase protein  54.29 
 
 
213 aa  228  8e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0065  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.5 
 
 
213 aa  224  5.0000000000000005e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167606  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0847  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.96 
 
 
200 aa  172  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1991  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.67 
 
 
206 aa  152  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175013  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1820  glutathione S-transferase-like protein  38.81 
 
 
201 aa  151  7e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.631165 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0995  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.5 
 
 
213 aa  149  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2556  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.71 
 
 
210 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.23 
 
 
205 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0897  glutathione S-transferase  42.19 
 
 
210 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.08 
 
 
213 aa  135  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.519007  normal  0.381422 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2958  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.76 
 
 
211 aa  135  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4505  Glutathione S-transferase domain  41.08 
 
 
213 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal  0.527562 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1689  glutathione S-transferase-like  37.44 
 
 
213 aa  134  8e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.74 
 
 
207 aa  134  9e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0031  glutathione S-transferase  37.11 
 
 
198 aa  134  9e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4394  Glutathione S-transferase domain  40.54 
 
 
213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1955  Glutathione S-transferase domain  37.32 
 
 
208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0193951  normal  0.329521 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2778  glutathione S-transferase-like protein  36.36 
 
 
211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.910721 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2166  Glutathione S-transferase domain protein  37.44 
 
 
208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193029  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5702  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.28 
 
 
214 aa  128  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.366134  normal  0.106893 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0039  glutathione S-transferase-like  37.82 
 
 
198 aa  127  9.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1911  glutathione S-transferase  38.73 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6295  glutathione S-transferase-like protein  35.79 
 
 
204 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14476  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2329  glutathione S-transferase-like  35.26 
 
 
204 aa  117  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209551  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2943  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.26 
 
 
204 aa  117  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2889  glutathione S-transferase-like  34.12 
 
 
209 aa  116  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.737778  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2990  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.67 
 
 
204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2964  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.74 
 
 
204 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2853  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.67 
 
 
204 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.606213 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2090  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.9 
 
 
227 aa  113  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2937  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.67 
 
 
204 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4186  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.8 
 
 
202 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.367804  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0145  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.7 
 
 
203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.397548  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00444  glutathione S-transferase  49.51 
 
 
116 aa  106  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0188129  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2859  Glutathione S-transferase domain protein  36.06 
 
 
215 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0243  glutathione S-transferase-like  33.02 
 
 
220 aa  105  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0144  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.26 
 
 
205 aa  105  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764911  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4110  Glutathione S-transferase domain protein  36.27 
 
 
186 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4150  glutathione S-transferase domain protein  36.27 
 
 
186 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0407  glutathione S-transferase  34.83 
 
 
197 aa  105  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2002  glutathione S-transferase-like protein  34.87 
 
 
185 aa  102  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  35.03 
 
 
201 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  35.03 
 
 
201 aa  99.4  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2628  Glutathione S-transferase domain  36.59 
 
 
200 aa  99  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  34.01 
 
 
201 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.43 
 
 
207 aa  96.3  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0039  glutathione S-transferase-like protein  29.67 
 
 
218 aa  96.7  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2423  putative glutathione S-transferase  30.14 
 
 
217 aa  95.9  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3680  glutathione S-transferase  32.51 
 
 
215 aa  95.9  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.41 
 
 
207 aa  95.9  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.81 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2020  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.18 
 
 
201 aa  93.6  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2666  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
217 aa  93.2  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0074512  normal  0.597042 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.61 
 
 
215 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173214  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3752  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.2 
 
 
210 aa  92  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0132369  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.6 
 
 
211 aa  92  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3629  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.2 
 
 
210 aa  92  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395815  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0783  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.84 
 
 
209 aa  91.7  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.16 
 
 
202 aa  91.3  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3561  Glutathione S-transferase domain protein  29.7 
 
 
210 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134068  normal  0.24035 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3183  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.31 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.413955  normal  0.024534 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0571  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.79 
 
 
206 aa  89.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.382264  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0387  glutathione S-transferase-like  32 
 
 
229 aa  89.4  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0755  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.65 
 
 
209 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.76216  normal  0.189515 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0681  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.7 
 
 
210 aa  89  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.052324  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  31.77 
 
 
205 aa  88.6  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2979  glutathione S-transferase  25.86 
 
 
211 aa  88.6  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.978891  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2600  glutathione S-transferase  34.74 
 
 
200 aa  89  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.465574 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0259  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.65 
 
 
205 aa  88.6  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.29 
 
 
205 aa  88.6  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4867  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.52 
 
 
214 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2389  Glutathione S-transferase domain protein  32.82 
 
 
183 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2161  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.16 
 
 
199 aa  87  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0539  Glutathione S-transferase domain protein  34.1 
 
 
224 aa  86.7  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333365  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.39 
 
 
205 aa  85.5  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.51 
 
 
205 aa  85.1  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0838  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.57 
 
 
227 aa  85.5  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0531264  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2823  glutathione S-transferase  33.8 
 
 
200 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0457673  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5352  Glutathione S-transferase domain  32.84 
 
 
214 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3767  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.75 
 
 
222 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5325  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.04 
 
 
214 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517428  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.94 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3374  putative glutathione S-transferase  31.6 
 
 
234 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0444471  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2345  glutathione S-transferase, putative  31.6 
 
 
234 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3417  glutathione S-transferase, putative  31.6 
 
 
234 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0270497  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1471  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.35 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.214549 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2653  Glutathione S-transferase domain  32.52 
 
 
211 aa  82.4  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.520035  normal  0.305227 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5977  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.22 
 
 
221 aa  82.8  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2523  putative glutathione S-transferase  31.6 
 
 
234 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>